|
|
| Κωδικός Πόρου |
uch.csd.msc//2005kanterakis |
| Τίτλος |
Επιλογή Γονιδίων και Κατάτμηση Δεδομένων Πειραμάτων με Μικροσυστοιχίες: Το σύστημα MineGene με Μικροσυστοιχίες: Το σύστημα MineGene |
| Άλλος τίτλος |
Gene Selection & Clustering Microarray Data: The MineGene System |
| Συγγραφέας |
Καντεράκης, Αλέξανδρος
|
| Περίληψη |
Τα τελευταία χρόνια είμαστε μάρτυρες μίας επανάστασης η οποία ξεκίνησε με την ολοκλήρωση της αποκωδικοποίησης του ανθρώπινου γονιδιώματος. Το DNA, το μόριο που περιέχει τις γενετικές μας πληροφορίες έχει αναλυθεί θέτοντας νέες υποσχέσεις και προκλήσεις για την κατανόηση του ρόλου των γενετικών παραγόντων στην υγεία και ασθένεια των ανθρώπων. Επιπλέον, οι μικροσυστοιχίες DNA είναι συσκευές που μετράνε τη ταυτόχρονη έκφραση πολλών χιλιάδων γονιδίων, επιτρέποντας την ταχύτατη καταγραφή της έκφρασης των γονιδίων. Παρόλο που αυτές οι τεχνολογικές εξελίξεις μας οδηγούν στην κατανόηση της γενετικής βάσης διάφορων ασθενειών είναι προφανές ότι πρέπει να συμπεριλάβουμε και την γνώση που έχει αποκτηθεί από την κλινική εμπειρία. Στην παρούσα εργασία παρουσιάζουμε αρχικά τις ιδιότητες και τα κύρια στοιχεία ενός αποκεντρωμένου σύγχρονου πληροφοριακού συστήματος το οποίο χρησιμοποιεί συγκεκριμένες γνωστές οντολογίες και επισημειώσεις για διαχείριση δεδομένων που έχουν παραχθεί από πειράματα με μικροσυστοιχίες και αναλύουμε διάφορες υπάρχουσες υλοποιήσεις. Στη συνέχεια οραματιζόμαστε ένα συνεργικό κλινικό-γενομικό σενάριο λήψης αποφάσεων όπου ο γονότυπος και ο φαινότυπος των ασθενών θα αξιοποιείται για διάγνωση και θεραπεία. Επιπροσθέτως παρουσιάζουμε δύο πρωτότυπους αλγόριθμους μηχανικής μάθησης που υλοποιούν την ολοκλήρωση αυτών των δεδομένων κατά τη διαδικασία λήψης ιατρικών αποφάσεων. Ο πρώτος είναι ένας επιβλεπόμενος αλγόριθμος για επιλογή γονιδίων ο οποίος βασίζεται στη βαθμολόγηση γονιδίων μέσω μίας εντροπικής μετρικής. Ο δεύτερος είναι ένας μη επιβλεπόμενος γραφο-θεωρητικός αλγόριθμος για ιεραρχική κατάτμηση. Τέλος παρουσιάζουμε την υλοποίηση των παραπάνω μεθόδων, την εφαρμογή τους σε πραγματικά δεδομένα καθώς επίσης και την σύγκρισή τους με άλλες δημοσιευμένες προσεγγίσεις.
|
| Ημερομηνία έκδοσης |
2005-07-01 |
| Ημερομηνία διάθεσης |
2005-07-19 |
| Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Επιστήμης Υπολογιστών--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
|
|
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
| Εμφανίσεις |
528 |
Επιλογή Γονιδίων και Κατάτμηση Δεδομένων Πειραμάτων με Μικροσυστοιχίες: Το σύστημα MineGene με Μικροσυστοιχίες: Το σύστημα MineGene
