Your browser does not support JavaScript!

Αρχική    Μελέτη της θερμοκρασίας εξάρτησης της κυτοχρωμικής c οξειδάσης με μοριακή δυναμική  

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

Προσθήκη στο καλάθι
[Προσθήκη στο καλάθι]
Τίτλος Μελέτη της θερμοκρασίας εξάρτησης της κυτοχρωμικής c οξειδάσης με μοριακή δυναμική
Άλλος τίτλος Studies of Temperature dependence of cytochrome c oxidase with Molecular Dynamics
Συγγραφέας Καμπαναράκης, Αλέξανδρος
Σύμβουλος διατριβής Φαράντος, Σταύρος
Περίληψη Η κυτοχρωμική c οξειδάση (CcO) είναι το τελικό διαμεμβρανικό ένζυμο στην αναπνευστική αλυσίδα. Το μοριακό οξυγόνο ανάγεται σε νερό στο διπυρηνικό κέντρο αιμικού Fe/CuB. Η σχάση του δεσμού Ο-Ο παράγει το οξο-φερρύλ (Feiv=O) ενδιάμεσο. Σε αυτήν την ερευνητική εργασία χρησιμοποιούμε υπολογισμούς Μοριακής Δυναμικής προκειμένου να ανιχνεύσουμε τις δονήσεις που ενέχονται στην τάση του Fe-O κατά την αλλαγή της διηλεκτρικής σταθεράς αλλά και κατά την αλλαγή της θερμοκρασίας. Ο ρόλος της πρωτεϊνικής μήτρας αποδεικνύεται σημαντικός για τις φασματικές ιδιότητες του φερρύλ ενδιάμεσου, καθώς οι συχνότητες και οι εντάσεις των ευαίσθητων στο οξυγόνο κορυφών ελέγχονται από αλλαγές της διηλεκτρικής σταθεράς. Επίσης το ένζυμο της κυτοχρωμική c οξειδάση αποδεικνύεται ιδιαίτερα σταθερό σ’ ένα αρκετά μεγάλο εύρος θερμοκρασιών.
Συγκεκριμένα η έρευνα μας κατέληξε στα εξής συμπεράσματα:

• H δόνηση Feiv=O της CcO δεν επηρεάζεται για τιμές της διηλεκτρικής σταθεράς μικρότερες του 1,5. Για τιμές μεγαλύτερες του 1,5 έχουμε μια ποιο εντοπισμένη δόνηση Feiv=O.

• Το ηλεκτροστατικό δυναμικό του ενεργού κέντρου της πρωτεΐνης είναι ένας σημαντικός παράγοντας επιρροής στη δόνηση ν(FeO). Το οριακό σημείο αυτής της επιρροής φαίνεται να είναι η τιμή της διηλεκτρικής σταθεράς 1,5.

• Στη μελέτη μας εμφανίστηκαν πέντε κορυφές τις οποίες αποδώσαμε σε δονήσεις

• Η μελέτη του ενεργού κέντρου της CcO είναι μια καλή προσέγγιση της μελέτης του συνόλου της πρωτεΐνης.

• Το σύστημα μας αποδεικνύεται αρκετά ανθεκτικό στην αλλαγή της θερμοκρασίας.

• Μια και το ηλεκτροστατικό δυναμικό φαίνεται να επηρεάζει την δόνηση Feiv=O, οι δύο κορυφές στους 790/804 cm-1 θα μπορούσαν να αποδοθούν σε δυο διαφορετικές διαμορφώσεις οφειλόμενες σε συμβάντα πρωτονίωσης*(πρωτονίωση/αποπρωτονίωση αμινοξέων). Η τιμή 1,5 της διηλεκτρικής σταθεράς φαίνεται είναι το μεταίχμιο μεταξύ των δύο διαμορφώσεων.

Φυσική περιγραφή 114 σ. : έγχρ. εικ., πίν. ; 30 εκ.
Γλώσσα Ελληνικά
Θέμα Cytochrome c Oxidase
dielectric dependence
dynamic protein frame
ferryl intermediate
molecular dynamic
temperature dependence
Κυτοχρωμική c οξειδάση
διηλεκτρική εξάρτηση
θερμοκρασιακή εξάρτηση
μοριακή δυναμική
πρωτεϊνική μήτρα
φερρύλ ενδιάμεσο
Ημερομηνία έκδοσης 2008-12-04
Συλλογή   Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Χημείας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
  Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
Εμφανίσεις 61

Ψηφιακά τεκμήρια
No preview available

Προβολή Εγγράφου
Εμφανίσεις : 7