|
|
| Κωδικός Πόρου |
000348402 |
| Τίτλος |
Πολυφασματικός διαχωρισμός τρισδιάστατων εικόνων φθορισμού |
| Άλλος τίτλος |
Multispectral decomposition of 3D fluorescence tomography data |
|
Συγγραφέας
|
Σημαντηράκη, Μαρία
|
|
Σύμβουλος διατριβής
|
Ζαχαράκης, Γιάννης
Ripoll, Jorge
|
| Περίληψη |
Η βασική μέθοδος για να αποκτήσουμε images σε τρεις διαστάσεις είναι με την χρήση της fluorescence molecular tomography (FMT). Μια μέθοδος από απόσταση που χρησιμοποιεί ως βάση τις αρχές της οπτικής τομογραφίας διάχυσης (DOT) και φθορίζουσες ουσίες ως μέσο ανίχνευσης. Στην περίπτωση που υπάρχουν όμως δυο χρωστικές ταυτόχρονα στο δείγμα, το σήμα το οποίο θα καταγράψει η κάμερα μας στο κανάλι ανίχνευσης θα περιέχει σήμα και από τις δυο χρωστικές.
Στην εργασία αυτή θα παρουσιάσουμε διαφορετικές μεθόδους που μπορούμε να χρησιμοποιήσουμε για να διαχωρίσουμε το φθορίζον σήμα που προέρχεται από δυο χρωστικές. Γενικά πολλές από τις γνωστές πρωτεΐνες όπως το GFP ή το Ds Red έχουν φθορίζοντα φάσματα, τα οποία αν χρησιμοποιηθούν μαζί αλληλεπικαλύπτονται. Γι'αυτο το λόγο είναι και πολύ δύσκολο να τις ξεχωρίσουμε μόνο με την χρήση των φίλτρων. Για να μπορέσουμε να τις διαχωρίσουμε θα χρησιμοποιήσουμε κατάλληλα δείγματα που ονομάζονται phantoms τα οποία θα αποτελούνται από χρωστικές με παρόμοιες ιδιότητες που το φάσμα τους επίσης επικαλύπτεται. Γενικά, η μέθοδο του διαχωρισμού είναι ένας γραμμικός αλγόριθμος με τον οποίο μπορούμε να ορίσουμε την συνεισφορά στο ολικό σήμα κάθε μιας χρωστική ουσίας που βρίσκεται ταυτόχρονα στο υπό εξέταση δείγμα. Έτσι με αυτόν τον τρόπο μπορούμε να απομονώσουμε το σήμα που μας ενδιαφέρει από τα αλλά σήματα που υπάρχουν ταυτόχρονα στο κανάλι ανίχνευσης.
Για τα πειράματα μας έχουμε χρησιμοποιήσει δυο διαφορετικές χρωστικές το CFSE και το Atto590, καθώς ξέρουμε ότι τα φάσματα τους αλληλεπικαλύπτονται. Εν συνεχεία με την χρήση του φασματογράφου και της διάταξης FMT, προσπαθήσαμε να διαχωρίσουμε τις χρωστικές με δυο διαφορετικούς τρόπους. Ο πρώτος τρόπος έχει να κάνει με την εφαρμογή του γραμμικού αλγόριθμου στα ήδη αναδιαμορφωμένα δεδομένα. Ο δεύτερος τρόπος απαιτεί την εφαρμογή του γραμμικού αλγόριθμου για διαχωρισμό στα raw δεδομένα που πήραμε στο εργαστήριο, και μετά έχουμε την ανάλυση αυτών των ήδη διαχωρισμένων δεδομένων, ώστε να τα διαμορφοποιησουμε ξανά.
|
| Φυσική περιγραφή |
105 σ. : εικ. ; 30 εκ. |
| Γλώσσα |
Αγγλικά |
| Θέμα |
Multispectral imaging |
|
Spectral unmixing |
| Ημερομηνία έκδοσης |
2009-07-24 |
| Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Φυσικής--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
|
|
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
| Εμφανίσεις |
429 |
Πολυφασματικός διαχωρισμός τρισδιάστατων εικόνων φθορισμού
