|
|
| Κωδικός Πόρου |
uch.csd.msc//2006papoutsides |
| Τίτλος |
Σχεδίαση και ανάπτυξη μίας biomedical GRID υποδομής για την εφαρμογή αλγορίθμων εξόρυξης δεδομένων υψηλών επιδόσεων και λειτουργιών εξόρυξης γνώσης |
| Άλλος τίτλος |
A biomedical GRID infrastructure to enable high performing data mining and knowledge extraction operations |
| Συγγραφέας |
Παπουτσίδης, Ευάγγελος
|
| Περίληψη |
Το μεγάλο φάσμα κλινικών και γενετικών πληροφοριών που είναι διαθέσιμες στην ερευνητική κοινότητα παρέχει μία τεράστια ευκαιρία για βελτίωση των ικανοτήτων μας στη μείωση της θνησιμότητας και τη βελτίωση των θεραπειών ενώ καθιστά ορατή την ανάγκη για εξατομικευμένη ιατρική περίθαλψη. Η έλλειψη, όμως, μιας κοινής υποδομής δημιουργεί δυσκολίες στην ανάλυση διαφορετικών πηγών δεδομένων από τα κλινικά και ερευνητικά ιδρύματα με αποτέλεσμα ερευνητικές εγκαταστάσεις να χρησιμοποιούν απομονωμένα σύνολα δεδομένων και πληροφοριακά εργαλεία. Η διαδικασία «ανακάλυψης γνώσης» σε μεγάλες βάσεις δεδομένων στοχεύει πρωτίστως στον εντοπισμό ενδιαφερόντων κρυμμένων προτύπων και τάσεων και ακολούθως στην ευνόητη παρουσίασή τους. Όμως, η εξόρυξη δεδομένων παρουσιάζει δυσκολίες εξαιτίας του όγκου των δεδομένων αλλά και της απαιτούμενης υπολογιστικής ισχύος. Σε εφαρμογές με πρακτική σημασία και όταν το σύνολο των δεδομένων είναι ιδιαίτερα μεγάλο και η δομής τους πολύπλοκη οι ακολουθιακοί αλγόριθμοι εξόρυξης δεδομένων συνήθως προκύπτουν ανεπαρκείς. Η τεχνολογία «πλέγματος» (grid) διευρύνει σε σημαντικό βαθμό τη δυνατότητα για αύξηση της χρήσης των διαθέσιμων υπολογιστικών και αποθηκευτικών πόρων. Η φιλοσοφία της συγκεκριμένης τεχνολογίας είναι ο συντονισμένος διαμοιρασμός των πόρων με σκοπό τη λύση προβλημάτων σε δυναμικούς εικονικούς οργανισμούς (virtual organizations). Με τη διαδικασία «ανακάλυψης γνώσης» επιθυμούμε την εξερεύνηση του τρόπου με τον οποίο η τεχνολογία «πλέγματος» δύναται να παρέχει την κατάλληλη υποδομή για πρόσβαση σε διαφορετικές πηγές δεδομένων καθώς και την απαραίτητη υπολογιστική ισχύ για την εφαρμογή τεχνικών εξόρυξης δεδομένων υψηλών επιδόσεων. Βάσει του πλαισίου αυτού, η συγκεκριμένη μεταπτυχιακή εργασία αποτελεί μια δραστηριότητα εξερεύνησης με απώτερο στόχο τη μελέτη ανοιχτών θεμάτων που αφορούν τη χρήση τεχνολογίας «πλέγματος» στο χώρο της βιοϊατρικής πληροφορικής. Βασικός κορμός της εργασίας είναι η σχεδίαση και ανάπτυξη μιας πειραματικής grid υποδομής μέσω της οποίας ο χρήστης μπορεί να εκτελέσει τις εξής λειτουργίες: α) πρόσβαση και ανάκτηση δεδομένων από κλινικά πληροφοριακά συστήματα, β) ενημέρωση για τους διαθέσιμους υπολογιστικούς πόρους και τις υπηρεσίες εξόρυξης δεδομένων στο grid, γ) εκτέλεση ενός παράλληλου αλγορίθμου για την εύρεση κανόνων συσχέτισης (Association Rule Mining) μεταξύ κλινικών γνωρισμάτων. Η αρχιτεκτονική της συγκεκριμένης υποδομής υλοποιήθηκε με τη βοήθεια του εργαλείου Globus Toolkit 4, ενώ η πρόσβαση στα κλινικά δεδομένα επετεύχθη μέσω της διεπαφής OGSA-DAI. Υπεύθυνος για τον έλεγχο των υπολογιστικών πόρων του grid ορίστηκε ο διαχειριστής TORQUE ενώ για την παράλληλη υλοποίηση του ARM αλγορίθμου χρησιμοποιήθηκε η βιβλιοθήκη mpiJava.
|
| Ημερομηνία έκδοσης |
2006-04-01 |
| Ημερομηνία διάθεσης |
2006-07-19 |
| Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Επιστήμης Υπολογιστών--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
|
|
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
| Εμφανίσεις |
354 |
Σχεδίαση και ανάπτυξη μίας biomedical GRID υποδομής για την εφαρμογή αλγορίθμων εξόρυξης δεδομένων υψηλών επιδόσεων και λειτουργιών εξόρυξης γνώσης
