E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Σύγκριση των εξελικτικών ρυθμών των γονιδίων που κωδικοποιούνται από μιτοχονδριακό και πυρηνικό dna και που τα προϊόντα τους συνθέτουν τα σύμπλοκα της οξειδωτικής φωσφορυλίωσης. Διερεύνηση της ύπαρξης θετικής επιλογής σε γονίδια των συμπλόκων της οξειδωτικής φωσφορυλίωσης σε εξελικτικές γραμμές της οικογένειας δροσοφιλίδων

Αρχική Σύγκριση των εξελικτικών ρυθμών των γονιδίων που κωδικοποιούνται από μιτοχονδριακό και πυρηνικό dna και που τα προϊόντα τους συνθέτουν τα σύμπλοκα της οξειδωτικής φωσφορυλίωσης. Διερεύνηση της ύπαρξης θετικής επιλογής σε γονίδια των συμπλόκων της οξειδωτικής φωσφορυλίωσης σε εξελικτικές γραμμές της οικογένειας δροσοφιλίδων

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000361053

Τίτλος

Σύγκριση των εξελικτικών ρυθμών των γονιδίων που κωδικοποιούνται από μιτοχονδριακό και πυρηνικό dna και που τα προϊόντα τους συνθέτουν τα σύμπλοκα της οξειδωτικής φωσφορυλίωσης. Διερεύνηση της ύπαρξης θετικής επιλογής σε γονίδια των συμπλόκων της οξειδωτικής φωσφορυλίωσης σε εξελικτικές γραμμές της οικογένειας δροσοφιλίδων

Άλλος τίτλος

Evolutionary behaviour analysis of the proteins that participate in the oxidative phosphorylation complexes, and are assembled by either nuclear of mitochondrial dna. A scan for positive selection in the oxidative phosphorylation complexes of ten drosophilidae species.

Συγγραφέας

Ζουμαδάκης, Χρήστος

Σύμβουλος διατριβής

Λαδουκάκης, Μανόλης

Περίληψη

Σκοποί της παρούσας εργασίας, ήταν: α) η μελέτη του εξελικτικού προτύπου των πρωτεϊνών που συμμετέχουν στα σύμπλοκα της οξειδωτικής φωσφορυλίωσης, και που είτε κατασκευάζονται στο μιτοχόνδριο από μιτοχονδριακό DNA, είτε κατασκευάζονται στο κυτταρόπλασμα από πυρηνικό DNA και κατόπιν στοχεύονται στο μιτοχόνδριο. Επίσης, εξετάστηκε εάν συγκεκριμένα χαρακτηριστικά των πρωτεϊνών αυτών, όπως το μέγεθος, ο αριθμός των αλληλεπιδράσεων ή η ένταση της επιλογής που ασκείται πάνω τους, έχουν στατιστικά σημαντικές συσχετίσεις μεταξύ τους. Τα αποτελέσματα δείχνουν πως οι πυρηνικές πρωτεΐνες που αλληλεπιδρούν με μιτοχονδριακές στα σύμπλοκα της αναπνοής, έχουν κατά γενικό κανόνα παρόμοιους εξελικτικούς ρυθμούς με τις υπόλοιπες πυρηνικές πρωτεΐνες. Οι εξελικτικοί αυτοί ρυθμοί στα ζώα είναι ταχύτεροι από αυτούς των αντίστοιχων μιτοχονδριακών πρωτεϊνών ενώ στα φυτά είναι αργότεροι. Ωστόσο για να μπορούν οι πρωτεϊνες που προέρχονται από διαφορετικά γενετικά υπόβαθρα (μιτοχονδριακό και πυρηνικό) να συνεργαστούν για να φτιάξουν τα σύμπλοκα της αναπνοής σημαντικό ρόλο φαίνεται να παίζει η φυσική επιλογή η οποία στις πρωτεϊνες από μιτοχονδριακό υπόβαθρο είναι αυστηρότερη. Αντίθετο πρότυπο παρατηρείται στα φυτά. Αθροιστικά, τόσο στις μιτοχονδριακές, όσο και στις πυρηνικές πρωτεΐνες που αλληλεπιδρούν με μιτοχονδριακές, βρέθηκε θετική συσχέτιση ανάμεσα στο μήκος και στον αριθμό των αλληλεπιδράσεών τους, ενώ κάποια από τα σύμπλοκα οξ. φωσφορυλίωσης, βρέθηκε συσχέτιση ανάμεσα στην ένταση της επιλογής και είτε στο μήκος, είτε στον αριθμό των αλληλεπιδράσεων των πρωτεϊνών που συμμετέχουν σε αυτά. β) η εφαρμογή διαφόρων τεχνικών μέγιστης πιθανοφάνειας ώστε να δoθεί μια ολοκληρωμένη εικόνα της ύπαρξης ή όχι θετικής επιλογής για όλα τα γονίδια που απαρτίζουν τα σύμπλοκα οξειδωτικής φωσφορυλίωσης (είτε αυτά κωδικοποιούνται από τον πυρήνα είτε κωδικοποιούνται από το μιτοχόνδριο) σε δέκα είδη της οικογένειας των δροσοφιλιδών, καθώς και η σύγκριση των ρυθμών εξέλιξης των πρωτεϊνών αυτών σε όλους τους κόμβους του φυλογενετικού δέντρου δέντρου των ειδών αυτών. Τα αποτελέσματα δείχνουν την ύπαρξη διαφορών στην ένταση της επιλογής σε συγκεκριμένα γονίδια και συγκεκριμένους κόμβους του δέντρου. Επίσης, εντοπίστηκαν ενδείξεις θετικής επιλογής σε αρκετά γονίδια, οι περισσότερες από τις οποίες εντοπίζονται στα είδη D.pseudoobscura και D.persimilis, μετά τον διαχωρισμό τους από τον κοινό τους πρόγονο.

Φυσική περιγραφή

70 σ. : εικ. ; 30 εκ.

Γλώσσα

Ελληνικά

Θέμα

Drosophila

Mitochondrion

Δροσόφιλα

Μιτοχόνδριο

Ημερομηνία έκδοσης

2010-11-19

Συλλογή