|
|
| Κωδικός Πόρου |
000395356 |
| Τίτλος |
Analysis of "old" microarray data of lung cancer reveals hidden pieces of new biological knowledge |
| Άλλος τίτλος |
Ανάλυση «παλαιών» δεδομένων μικροσυστοιχιών καρκίνου του πνεύμονα αποκαλύπτει κρυμμένα κομμάτια βιολογικής γνώσης |
|
Συγγραφέας
|
Κερκεντζές, Κωνσταντίνος Σ.
|
|
Σύμβουλος διατριβής
|
Τσαμαρδινός, Ιωάννης
|
|
Μέλος κριτικής επιτροπής
|
Roe, Oluf Dimitri
Τσακαλίδης, Παναγιώτης
|
| Περίληψη |
Ο καρκίνος του πνεύμονα ιστολογικά και κλινικά είναι μια ετερογενή ομάδα κακοήθων
όγκων με αδιευκρίνιστη μοριακή βάση. Επί του παρόντος, χιλιάδες σύνολα μοριακών
δεδομένων από καρκίνο του ανθρώπου είναι διαθέσιμα δημοσίως, τα οποία συνήθως
αναλύονται μόνο κατά την πρωταρχική τους δημοσιευσή. Νέες στατιστικές μέθοδοι και
οι όλο και πιο ακριβείς γονιδιακοί χαρακτηρισμοί μπορούν να μετατρέψουν αυτά τα
«
παλαιά
»
βιολογικά δεδομένα σε ανανεωμένες πηγές γνώσης με πιθανή κλινική
σημασία. Στην εργασία αυτή, παρέχουμε μια
in
silico
απόδειξη της ιδέας μας με την
εξαγωγή νέων πληροφοριών από ένα υψηλής ποιότητας σύνολο δεδομένων έκφρασης
mRNA
, που αρχικά δημοσιεύθηκε το 2001, μέσω της χρήσης σύγχρονων
βιοπληροφορικών προσεγγίσεων.
Τα δεδομένα αποτελούνται από ιστολογικά καθορισμένες περιπτώσεις
αδενοκαρκινώματος του πνεύμονα, καρκινώματος των πλακώδων κυττάρων του
πνεύμονα, μικροκυτταρικού καρκίνου του πνεύμονα, καρκινικών όγκων, μετάστασεων
(αδενοκαρκινώματος του μαστού και του παχέους εντέρου) και δείγματα φυσιολογικού
πνεύμονα (203
δείγματα συνολικά). Μια ευρεία γκάμα στατιστικών ελέγχων
πραγματοποιήθηκε για τον προσδιορισμό γονιδίων με διαφορική έκφραση,
διαγνωστικών και προγνωστικών γονιδίων, εμπλουτισμένων γονιδιακών οντολογιών και
βιοχημικών μονοπατιών. Επιπλεόν, επικύρωσαμε την
προσέγγιση της ανάλυσής μας
εφαρμόζοντάς την σε άλλα δύο σύνολα δεδομένων και ελέγχοντας την αντιστοιχία των
αποτ
ελεσμάτων μεταξύ και των τριών.
Τα αποτελέσματα της εκ νέου ανάλυσης αυτού του δημόσια διαθέσιμου συνόλου
δεδομένων παρουσίασαν γνωστά βιολογικ
ά χαρακτηριστικά των υποκατηγοριών
καρκίνου του πνεύμονα. Επιπλέον, αποκαλύφθηκαν νέα μονοπάτια με δυνητικά κλινική
σημασία. Τέλος, τα ευρήματα υποστηρίζουν επίσης την υπόθεσή μας ότι ακόμη και τα
παλιά «-ωματικά» δεδομένα υψηλής ποιότητας μπορούν να αποτε
λέσουν μια πηγή
σημαντικών βιολογικών πληροφοριών όταν χρησιμοποιούνται κατάλληλες σύγχρονες
μέθοδοι της βιοπληροφορικής.
|
| Φυσική περιγραφή |
v, 69 σ. : πίν., εικ.(μερ. εγχ.) ; 30 εκ. |
| Γλώσσα |
Αγγλικά, Ελληνικά |
| Θέμα |
mRNA expression |
|
Έκφραση mRNA |
|
Καρκίνος του πνεύμονα |
| Ημερομηνία έκδοσης |
2015-07-17 |
| Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Επιστήμης Υπολογιστών--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
|
|
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
| Εμφανίσεις |
564 |
Analysis of "old" microarray data of lung cancer reveals hidden pieces of new biological knowledge
