E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Ανεύρεση μοριακών δεικτών για τον εντοπισμό ιϊκών και ιοειδικών μολύνσεων σε φυτά

Αρχική Ανεύρεση μοριακών δεικτών για τον εντοπισμό ιϊκών και ιοειδικών μολύνσεων σε φυτά

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000468871

Τίτλος

Ανεύρεση μοριακών δεικτών για τον εντοπισμό ιϊκών και ιοειδικών μολύνσεων σε φυτά

Άλλος τίτλος

Detection of molecular markers for the identification of virus and viroid infections in plants

Συγγραφέας

Ανδριανοπούλου, Αικατερίνη Ν.

Σύμβουλος διατριβής

Καλαντίδης, Κρίτων

Μέλος κριτικής επιτροπής

Κοτζαμπάσης, Κυριάκος
Τσαγρή, Ευθυμία

Περίληψη

Οι αλληλεπιδράσεις μεταξύ φυτών και παθογόνων αποτελούν αντικείμενο έρευνας χρόνων. Τόσο οι αμυντικοί μηχανισμοί, όσο και ο τρόπος που η εκδηλώνεται η παθογονικότητα έχουν σαν αποτέλεσμα φαινοτυπικά χαρακτηριστικά, δομικές και λειτουργικές τροποποιήσεις και αλλαγές σε μοριακό επίπεδο. Ειδικά στα ιϊκά και ιοειδικά παθογόνα, οι τελευταίες εντείνονται, λόγω της ενδοκυτταρικής τους φύσης και της απουσίας παραγωγής πρωτεϊνών από τα ιοειδή. Η RNA σίγηση, σε διαφορετικά επίπεδα, οι ιϊκές πρωτεΐνες, αλλά και οι μεταβολές σε παράγοντες του ξενιστή, μεταξύ των οποίων οι αλλαγές στην γονιδιακή έκφραση, παρατηρούνται να τροποποιούν τα συμπτώματα και την πορεία της μόλυνσης. Στο πλαίσιο της δεδομένης διατριβής, μελετάται η αλλαγή στην έκφραση ενδογενών γονιδίων σε φυτά N.benthamiana κατόπιν μόλυνσης από ιϊκά και ιοειδικά παθογόνα ως δυνητικός μοριακός δείκτης, ιδιαιτέρως, των ιοειδικών μολύνσεων. Για το σκοπό αυτό επιλέχθηκαν 14 γονίδια, από διαθέσιμη βάση δεδομένων, που παρουσιάζουν μεταβολή στην έκφραση σε μολυσμένα φυτά. Χρησιμοποιήθηκαν δείγματα ολικού RNA μολυσμένων φυτών με CMV, TBSV, PSTVd και CEVd στα οποία πραγματοποιήθηκε ανάλυση με RT-qPCR για την έκφραση των 12 από τα επιλεγμένα γονίδια. Επίσης, προσδιορίστηκαν τα επίπεδα μόλυνσης από το κάθε παθογόνο, για να εκτιμηθεί η επίδραση στην παρατηρούμενη μεταβολή της έκφρασης. Από το σύνολο των γονιδίων, τα NPR3 και HSP20 φαίνεται να παρουσιάζουν διαφορετική μεταβολή στην έκφραση σε μολύνσεις με τα ιοειδή που μελετήθηκαν σε σχέση με τους αντίστοιχους ιούς, για την επιβεβαίωση των αποτελεσμάτων, ωστόσο απαιτούνται περισσότερες επαναλήψεις και μελέτη διαφορετικών συνθηκών. Από την παρούσα διατριβή αναδεικνύεται η δυσκολία στην εύρεση μοριακών δεικτών αποκλειστικά για μολύνσεις με ιοειδή, συνεκτιμώντας πως η γονιδιακή έκφραση επηρεάζεται από πλήθος παραγόντων μεταξύ των οποίων το είδος και στέλεχος του παθογόνου, το είδος και η ποικιλία του φυτού ξενιστή αλλά και οι περιβαλλοντικές συνθήκες. Η προσπάθεια εύρεσης μοριακών δεικτών σε μολύνσεις δύναται να επιταχύνει και να βελτιώσει τους ελέγχους πολλαπλασιαστικού υλικού αλλά και να αναδείξει νέες σχέσεις μεταξύ παθογόνων και ξενιστών.

Φυσική περιγραφή

90 σ. : πίν., σχήμ., εικ. ; 30 εκ.

Γλώσσα

Ελληνικά

Θέμα

Infaction detection

PSTVd

Viroid infections

Διάγνωση μολύνσεων

Ιοειδή

Ιοειδικές μολύνσεις

Μοριακοί δείκτες