E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - The role of phase-separating condensates with membrane interfaces

Αρχική The role of phase-separating condensates with membrane interfaces

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000468986

Τίτλος

The role of phase-separating condensates with membrane interfaces

Άλλος τίτλος

Ο ρόλος πρωτεϊνικών συμπυκνωμάτων σε μεμβρανικές επιφάνειες

Συγγραφέας

Λεβάντακη, Πετρούλα Σ.

Σύμβουλος διατριβής

Μόσχου, Παναγιώτης

Μέλος κριτικής επιτροπής

Κεκλίνογλου, Ιωάννα
Βιδάκη, Μαρίνα

Περίληψη

Μακρομόρια όπως πρωτεΐνες μπορούν να διαχωριστούν από το περιβάλλον τους μέσω διαχωρισμού υγρής-υγρής φάσης και να δημιουργήσουν δομές που ονομάζονται συμπυκνώματα (condensates). Τα Processing bodies (PBs) είναι ριβονουκλεοπρωτεϊνικά συμπυκνώματα που εντοπίζονται στο κυτταρόπλασμα των κυττάρων και συμμετέχουν στη μετα-μεταγραφική ρύθμιση με διεργασίες όπως RNA αποθήκευση και αποδόμηση. Πιο συγκεκριμένα, το decapping σύμπλοκο των PBs συμμετέχει στην αποδόμηση του mRNA μέσω του 5’ άκρου του. H Decapping Protein 1 (DCP1) ανήκει στο decapping complex, ωστόσο εντοπίζεται στην πλασματική μεμβράνη και στις άκρες των κυττάρων πέρα από τα PBs. Η πρωτεομική ανάλυση της DCP1 μέσω μίας μεθόδου βιοτινυλίωσης γειτονικών μορίων αποκάλυψε πιθανή συσχέτιση της πρωτεΐνης με μηχανισμούς αναδιαμόρφωσης της ακτίνης, καθώς και με μονοπάτια μεταφοράς κυστιδίων. Η συγκεκριμένη διπλωματική εστιάζεται στον κυτταρικό εντοπισμό της DCP1 και στον ρόλο της σε μεμβρανικές επιφάνειες. Η DCP1 μπόρεσε να προσδεθεί in vitro σε λιπίδια που εντοπίζονται κυρίως στην πλασματική μεμβράνη, στα Multivesicular Bodies (MVBs) και στα αυτοφαγoσώματα. Αυτά τα αποτελέσματα επιδεικνύουν τον εντοπισμό της DCP1 σε διάφορες μεμβράνες ή ακόμα και την αλληλεπίδραση των PBs με μεμβρανικές επιφάνειες, ωστόσο in vivo μελέτες είναι απαραίτητες. Επιπρόσθετα, μέσω συνεστιακής μικροσκοπίας βρέθηκε πως η DCP1 συν-εντοπίζεται με την DRP1A και την DRP1C στην πλασματική μεμβράνη και σε κυτταροπλασματικά puncta, ενώ τα χαρακτηριστικά των PBs είχαν διαφοροποιηθεί στο alix-1 μετάλλαγμα. Οι DRP1 πρωτεΐνες σχετίζονται με την αποκοπή κυστιδίων κλαθρίνης και με τη διχοτόμηση μιτοχονδρίων, διεγείροντας ερωτήσεις σχετικά με τους μηχανισμούς κοπής των PBs. Ενώ η ALIX είναι μία πρωτεΐνη του ESCRT-III που συμμετέχει στη διαλογή πρωτεϊνών για αποδόμηση στο χυμοτόπιο και στις αποκρίσεις σε αβιοτικό στρες. Οι διαφορές στον σχηματισμό και σύζευξη των PBs χρειάζεται περαιτέρω μελέτη για την πιθανή χρήση των μεμβρανών σαν ικριώματα - scaffolds- για σχηματισμό των PBs, ή για ανοιχτά μονοπάτια αντιμετώπισης του στρες στο alix-1 που πιθανόν επηρεάζουν τις ιδιότητες των PBs. Τέλος, πραγματοποιήθηκε μία υποσχόμενη δοκιμή για ένα μεμβρανικά εμπλουτισμένο DCP1 proxitome για την περαιτέρω ανάλυση των μονοπατιών μεταφοράς κυστιδίων που μπορεί να εμπλέκεται η DCP1.

Φυσική περιγραφή

49 σ. : πίν., σχήμ., εικ. (μερ. εγχρ.) ; 30 εκ.

Γλώσσα

Αγγλικά, Ελληνικά

Θέμα

Decapping Protein 1 (DCP1)

Processing bodies

Vesicle trafficking

Κυστίδια

Συμπυκνώματα

Ημερομηνία έκδοσης

2024-11-29