E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Μελέτη των συντηρημένων αλληλουχιών που δεν κωδικοποιούν πρωτεΐνες στα γονιδιώματα των ψαριών

Αρχική Μελέτη των συντηρημένων αλληλουχιών που δεν κωδικοποιούν πρωτεΐνες στα γονιδιώματα των ψαριών

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000334300

Τίτλος

Μελέτη των συντηρημένων αλληλουχιών που δεν κωδικοποιούν πρωτεΐνες στα γονιδιώματα των ψαριών

Άλλος τίτλος

Conserved non-coding sequences in figh genomes

Συγγραφέας

Μανουσάκη Τερέζα

Σύμβουλος διατριβής

Λαδουκάκης, Μανώλης

Περίληψη

Στην εποχή της μετα-γονιδιωματικής, τα συντηρημένα στοιχεία στις περιοχές εκτός γονιδίων έχουν τραβήξει το ερευνητικό ενδιαφέρον καθώς θεωρούνται σημαντικά στην εξέλιξη της ομάδας των μεταζώων και ιδιαίτερα των σπονδυλωτών. Στην παρούσα εργασία, μελετήθηκαν συγκριτικά τα 5 διαθέσιμα γονιδιώματα ψαριών, των Takifugu rubripes, Tetraodon nigroviridis, Danio rerio, Oryzias latipes και Gasterosteous aculeatus. Με χρήση εργαλείων βιοπληροφορικής, απομονώθηκε σε κάθε γονιδίωμα το τμήμα που δεν κωδικοποιεί πρωτεΐνες και βρίσκεται μεταξύ των γονιδίων. Η μελέτη είχε ως αποτέλεσμα την ανίχνευση 103 αλληλουχιών που είχαν τουλάχιστον 100 νουκλεοτιδικές βάσεις μήκος και 70% ομοιότητα μεταξύ τους (CNEs). Από τη μελέτη των CNEs πρoέκυψε ότι τα μισά περίπου από αυτά δεν έχουν ανιχνευθεί από τις μέχρι τώρα συγκρίσεις. Επιπλέον, παρουσιάζουν τα σημαντικότερα χαρακτηριστικά των συντηρημένων αλληλουχιών όπως αυτά έχουν καθοριστεί από προηγούμενες εργασίες. Για παράδειγμα, σημαντικό ποσοστό των CNEs βρίσκονται πλησίον γονιδίων που σχετίζονται με τη μεταγραφή και την ανάπτυξη, εμφανίζουν έντονα το φαινόμενο της συνταινίας και συγκεντρώνονται σε ομάδες (clusters). Τα αποτελέσματά μας δείχνουν την ελλιπή παρουσία CNEs στην ομάδα των τελεόστεων σε σχέση με τα υπόλοιπα σπονδυλωτά. Προτείνουμε ότι οι μισές περίπου από αυτές τις αλληλουχίες που βρίσκονται αποκλειστικά στα ψάρια, είναι πιθανό να αποτελούν σημαντικά cis – ρυθμιστικά στοιχεία των τελεόστεων.

Φυσική περιγραφή

102 σ. : εικ. ; 30 εκ.

Γλώσσα

Ελληνικά

Θέμα

CNEs

Comparative Genomics

Συγκριτική Γονιδιωματική

Ημερομηνία έκδοσης

2008-12-04

Συλλογή

Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Βιολογίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης