|
|
| Κωδικός Πόρου |
000381979 |
| Τίτλος |
Study of TET2 gene in Chronic Idiopathic Neutropenia Patients |
| Άλλος τίτλος |
Μελέτη του γονιδίου ΤΕΤ2 σε ασθενείς με Χρόνια Ιδιοπαθή Ουδετεροπενία |
|
Συγγραφέας
|
Σημαντηράκης, Εμμανουήλ
|
|
Σύμβουλος διατριβής
|
Παπαδάκη Ελένη
|
|
Μέλος κριτικής επιτροπής
|
Ποντίκογλου, Χαρίλαος
Καστρινάκη Χριστίνα
|
| Περίληψη |
Εισαγωγή: Οι μεταλλαγές στο γονίδιο Τet2 είναι συχνές στα μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα , την οξεία
μυελογενή λευχαιμία και την χρόνια μυελομονοκυτταρική λευχαιμία. Το Tet2 είναι ένα σημαντικό ένζυμο που
καταλύει τη μετατροπή της 5-μέθυλοκυτοσίνης σε 5-υδροξυμέθυλοκυτοσίνη. Η 5-υδροξυμέθυλοκυτοσίνη δρα
ως σήμα απομεθυλίωσης και το Tet2 αναδείχθηκε ως ένα σημαντικό ογκογονίδιο στους αιματολογικούς
καρκίνους τα τελευταία χρόνια. Η απώλεια του Τet2 οδηγεί τα αιμοποιητικά προγονικά κύτταρα που ανήκουν
στο διαμέρισμα LSK να αυξήσουν την βλαστικότητά τους και ευνοούν την διαφοροποίηση των
μονοπυρινικών/κοκκιοκυτταρικών προγονικών κυττάρων προς την μονοκυτταρική σειρά, εις βάρος της
κοκκιώδους σειράς.
Στόχος: Σε κάποια πρώιμα πειράματα αλληλούχισης σε δείγματα DNA 7 ασθενών με Χρόνια Ιδιοπαθή
Ουδετροπενία βρήκαμε τον πολυμορφισμό μονού νουκλεοτιδίου (SNP) rs62621450 σε συχνότητα 7%, στους
ασθενείς της Κρήτης, σε σχέση με την αναφερόμενη στην βιβλιογραφία (5%). Θελήσαμε να αξιολογήσουμε
τον πολυμορφισμό αυτόν ως βιολογικό μάρτυρα της Χρόνιας Ιδιοπαθούς Ουδετεροπενίας.
Επίσης θελήσαμε να μετρήσουμε τα επίπεδα έκφρασης του mRNA του Tet2 σε λευκομονοπύρηνα και
κοκκιοκύτταρα και να αξιολογίσουμε εάν η ουδετεροπενία μπορεί να οφείλεται στην μικρότερη έκφραση του
mRNA του Tet2.
Μέθοδοι: Εκτίμηση του πολυμορφισμού του Τet2 rs62621450 στους ασθενείς με CIN: 42 ασθενείς με
Χρόνια Ιδιοπαθή ουδετεροπενία και 30 υγιής μάρτυρες έλαβαν μέρος σε αυτήν την κοωρτή. Ελήφθησαν
δείγματα περιφερικού αίματος και απομονώθηκαν κοκκιοκύτταρα. Από τα τελευταία απομονώθηκε DNA. Για
την ανίχνευση του γονότυπου των ατόμων χρησιμοποιήθηκε το κιτ γονοτύπισης TaqMan Genotyping Kit.
Εκτίμηση των επιπέδων του mRNA του Tet2: Λευκομονοπύρηνα και κοκκιοκύτταρα/ουδετερόφιλα
απομονώθηκαν από δείγματα περιφερικού αίματος από 16 ασθενείς και 16 υγιής μάρτυρες και απομονώθηκε
το ολικό RNA τους. Έγινε αντίστροφη μεταγραφή και στη συνέχεια τα επίπεδα του mRNA του Tet2
μετρήθηκαν με την μέθοδο της Αλυσιδωτής Αντίδρασης Πολυμεράσης σε πραγματικό χρόνο (real time PCR).
Οι τιμές κανονικοποιήθηκαν ως προς το γονίδιο οικιακής οικονομίας GAPDH και τα επίπεδα έκφρασης
ποσοτικοποιήθηκαν ως τιμή 2^-DCt.
Αποτελέσματα: 1 από τους 42 ασθενείς ήταν ετερόζυγοι ως προς το αγρίου τύπου αλληλόμορφο και
τον πολυμορφισμό (1,2%), ενώ 3 από τους 30 υγιής μάρτυρες ήταν ετερόζυγοι για τον πολυμορφισμό (5%)
(σύμφωνα με το Fisher’s exact test P=0.3). Αυτό σημαίνει ότι η συχνότητα του πολυμορφισμού δεν διαφέρει
μεταξύ της κοωρτής μας και της αναφερόμενης από την βιβλιογραφία.
Τα επίπεδα του mRNA του Tet2 και για τις 3 ισομορφές είναι κατά 0.5 φορές αυξημένα στα
λευκομονοπύρηνα των ασθενών με (P=0.0094), την ίδια τάση φαίνεται να έχουν και τα κοκκιοκύτταρα των
ασθενών (P=0.7).
Συμπεράσματα: Στην κοωρτή μας, η Χρόνια Ιδιοπαθής Ουδετεροπενία δεν φαίνεται να σχετίζεται με
τον πολυμορφισμό του Tet2 rs62621450. Παρόλα αυτά φαίνεται να υπάρχει μια μέτρια μεν, σημαντική δε
αύξηση των επιπέδων του mRNA του Tet2 στα λευκομονοπύρηνα των ασθενών σε σχέση με τους υγιείς
μάρτυρες. Μπορεί να παρατηρούμε αυτό το φαινόμενο ως αποτέλεσμα ενός αντισταθμιστικού μηχανισμού
στην απώλεια των ουδετεροφίλων στην περιφερικό αίμα των ασθενών, μέσω κάποιου είδους σηματοδότηση
μέσω έκκρισης ή απελευθέρωσης κάποιου διαλυτού παράγοντα/μορίου μπορεί να λαμβάνει χώρα. Η
29
τελευταία αυξάνει την έκφραση του Tet2 στα προγονικά κύτταρα της μυελικής και κοκκιοκυτταρικής σειράς
για να προωθήσει την επιβίωσή τους και την διαφοροποίησή τους προς την κοκκιοκυτταρική/μονοκυτταρική
σειρά.
|
| Φυσική περιγραφή |
29 σ : πιν. ; 30 εκ. |
| Γλώσσα |
Αγγλικά |
| Θέμα |
Myelodysplastic syndromes |
|
Neutropenia |
|
Μυελοδυσπλασία |
|
ΤΕΤ2 |
|
Χρόνια Ιδιοπαθής Ουδετεροπενία |
| Ημερομηνία έκδοσης |
2012-12-11 |
| Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Ιατρική Σχολή--Τμήμα Ιατρικής--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
|
|
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
| Εμφανίσεις |
231 |
Study of TET2 gene in Chronic Idiopathic Neutropenia Patients
