E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Μελέτη της έκφρασης των δύο ισομορφών του γονιδίου της Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) σε αναπτυξιακά στάδια και ιστούς του λαυρακιού (Dicentrarchus labrax) και της τσιπούρας (Sparus aurata)

Αρχική Μελέτη της έκφρασης των δύο ισομορφών του γονιδίου της Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) σε αναπτυξιακά στάδια και ιστούς του λαυρακιού (Dicentrarchus labrax) και της τσιπούρας (Sparus aurata)

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000364009

Τίτλος

Μελέτη της έκφρασης των δύο ισομορφών του γονιδίου της Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) σε αναπτυξιακά στάδια και ιστούς του λαυρακιού (Dicentrarchus labrax) και της τσιπούρας (Sparus aurata)

Άλλος τίτλος

Study of the expression of the two GAPDH isoforms in different developmental stages and tissues of the European seabass (Dicentrarchus labrax) and the gilthead seabream (Sparus aurata)

Συγγραφέας

Νουσδίλη, Δήμητρα

Σύμβουλος διατριβής

Λαδουκάκης, Μανόλης
Κωτούλας, Γεώργιος
Κεντούρη, Μαρουδιώ

Περίληψη

H αφυδρογονάση της 3-φωσφορική γλυκεραλδεϋδης - Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) κατέχει σημαντικό ρόλο σε βασικές καταβολικές διαδικασίες του κυττάρου και κατά συνέπεια, δεν αποτελεί έκπληξη πως έχει παρατηρηθεί μια σχετικά σταθερή έκφρασή της στους περισσότερους ιστούς και κύτταρα, ανεξαρτήτα από εξωτερικές παραμέτρους. Συνεπώς έχει χαρακτηριστεί ως διαχειριστικό γονίδιο (housekeeping gene) και χρησιμοποιείται ως εσωτερικό γονίδιο αναφοράς σε ποσοτικές μελέτες γονιδιακής έκφρασης. Ωστόσο, στοιχεία που προέκυψαν από πρόσφατες μελέτες, δείχνουν διαφορετικά πρότυπα έκφρασης σε διάφορους οργανισμούς και ιστούς καθώς και την ύπαρξη διαφορετικών ισομορφών και ψευδογονιδίων. Επιπλέον, το GAPDH έχει αποδειχθεί ότι εμπλέκεται στις διαδικασίες της μεταγραφής, της απόπτωσης καθώς και σε άλλες λειτουργίες. Οι νέες αυτές μελέτες, καθιστούν αναγκαία την επανεκτίμηση και την περαιτέρω μελέτη των γονιδίων GAPDH, της δομής, μοριακής εξέλιξης, προτύπου έκφρασής τους και καταλληλότητά τους ως γονίδια αναφοράς. Στα πλαίσια της παρούσας μεταπτυχιακής εργασίας απομονώθηκαν και χαρακτηρίστηκαν οι δύο ισομορφές του GAPDH για την τσιπούρα (Sparus aurata) και το λαυράκι (Dicentrarchus labrax) και περιγράφεται ο τρόπος απομόνωσης και χαρακτηρισμού τους. Πραγματοποιήθηκε η φυλογενετική ανάλυσή τους με τα παράλογα γονίδια του GAPDH 10 ειδών ψαριών και με εφαρμογή μεθόδων μοριακής εξέλιξης ελέγχθηκε πιθανή δράση φυσικής επιλογής στα δύο αυτά γονίδια. Δεν παρατηρήθηκε θετική (κατευθύνουσα) επιλογή στα γονίδια. Μελετήθηκε ακόμη η δομή των ισομορφών και έγινε ανάλυση της συντενίας σε σχέση με ψάρια-«μοντέλα» που έχουν δημοσιευμένα γονιδιώματα. Εκτιμήθηκαν τα επίπεδα έκφρασης των ισομορφών του GAPDH στο λαυράκι και στη τσιπούρα σε σειρά πρώιμων αναπτυξιακών σταδίων καθώς και σε σειρά ιστών, με εφαρμογή της μέθοδου της qPCR και της One-step RT-PCR αντίστοιχα. Τα αναπτυξιακά στάδια που επιλέχθηκε να μελετηθούν στο λαυράκι περιλαμβάνουν το στάδιο του μοριδίου, το στάδιο 50% επιβολή, το στάδιο του νευριδίου, το στάδιο ¾ επιβολή, το στάδιο εκκόλαψης και το στάδιο της προνύμφης. Στην τσιπούρα περιλαμβάνονται το στάδιο του γαστριδίου, το στάδιο του ύστερου γαστριδίου, το στάδιο εκκόλαψης, το στάδιο θωρακικού πτερυγίου, το στάδιο του σχηματισμού ματιού, το στάδιο του ανοίγματος στόματος, το στάδιο του καφέ ματιού 8 καθώς και περαιτέρω σταδίων της πρώιμης ανάπτυξής : το στάδιο των μη γονιμοποιημένων αυγών, το 2,4 κυτταρικό στάδιο, το 8,16 κυτταρικό στάδιο, το 64 κυτταρικό στάδιο, το προς μορίδιο στάδιο, το προς επιβολή στάδιο, το στάδιο του βλαστιδίου (πρώϊμη επιβολή) και το στάδιο της επιβολής, αποκαλύπτοντας αποκλίνουσα γονιδιακή έκφραση και των δύο ισομορφών και προτείνοντας τον πιθανό ρόλο του GAPDH 1 ως γονίδιο μητρικής δράσης. Η μελέτη της εξειδίκευσης σε συγκεκριμένους ιστούς χρήζει περαιτέρω διερεύνησης.

Φυσική περιγραφή

73 σ. : χάρτ., πίν., έγχ. εικ. ; 30 εκ.

Γλώσσα

Ελληνικά

Θέμα

Gene expression

Ισομορφή

Λαυράκι

Τριπούρα

Ημερομηνία έκδοσης

2011-03-18

Συλλογή