Your browser does not support JavaScript!

Αρχική    XAB2 links pre-mRNA splicing with the DNA damage response during mammalian development  

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

Προσθήκη στο καλάθι
[Προσθήκη στο καλάθι]
Κωδικός Πόρου 000442169
Τίτλος XAB2 links pre-mRNA splicing with the DNA damage response during mammalian development
Άλλος τίτλος Η πρωτεΐνη XAB2 συνδέει το μάτισμα του RNA με την κυτταρική απάντηση στις βλάβες DNA κατά την διάρκεια της ανάπτυξης
Συγγραφέας Τσεκρέκου, Μαρία Π.
Σύμβουλος διατριβής Γαρίνης, Γεώργιος
Μέλος κριτικής επιτροπής Αλεξανδράκη, Δέσποινα
Καλαντίδης, Κρίτων
Σπηλιανάκης, Χαράλαμπος
Τζαμαρίας, Δημήτρης
Δελιδάκης, Χρήστος
Ταλιανίδης, Ιωάννης
Περίληψη Οι βλάβες του DNA προκαλούν την ενεργοποίηση σηματοδοτικών μονοπατιών, τα οποία ελέγχουν την επιδιόρθωση του DNA, την ρύθμιση της μεταγραφής καθώς και τις αποφάσεις για την προσωρινή ή μόνιμη αναστολή του κυτταρικού κύκλου ή την επαγωγή κυτταρικού θανάτου. Το σύνολο των μονοπατιών αυτών, από την αναγνώριση της βλάβης μέχρι την επιδιόρθωση του DNA και τις επιλογές για την τύχη του κυττάρου, συνιστά την απόκριση στις βλάβες τού DNA (DNA damage response, DDR). Τα τελευταία χρόνια, το μάτισμα του RNA έχει συσχετισθεί με την κυτταρική απόκριση στις βλάβες τού DNA, ωστόσο ο μηχανισμός με τον οποίο αυτά τα δύο μονοπάτια αλληλεπιδρούν συντονισμένα παραμένει άγνωστος. H πρωτεΐνη ΧΑΒ2 έχει εμπλακεί στο μάτισμα του RNA και ταυτόχρονα στο μονοπάτι επιδιόρθωσης του DNA μέσω της εκτομής νουκλεοτιδίων (Nucelotide excision repair, NER), ωστόσο η λειτουργική της συνεισφορά και στα δύο μονοπάτια παραμένει άγνωστη. Στην παρούσα διατριβή, χρησιμοποιήσαμε ένα νέο μοντέλο ποντικού προκειμένου να χαρακτηρίσουμε την λειτουργία της ΧΑΒ2 κατά την ανάπτυξη του ποντικού in vivo. Η παραγωγή του νέου μοντέλου περιλαμβάνει την προσθήκη μίας ετικέτας συγγενείας στο ενδογενές γονίδιο μέσω γονιδιακής στόχευσης (knock in). Η συγκεκριμένη ετικέτα αναγνωρίζεται και βιοτινυλιώνεται από την βακτηριακή λιγάση BirA, με αποτέλεσμα σε ποντικούς που εκφράζουν τόσο το knock in αλλήλιο όσο και διαγονιδιακή λιγάση BirA, η ΧΑΒ2 να βιοτινυλιώνεται in vivo, παρέχοντας έτσι ένα πολύτιμο εργαλείο για την απομόνωση της πρωτεΐνης μαζί με πρωτεϊνικούς ή DNA/RNA στόχους. Συνοπτικά βρήκαμε ότι η ΧΑΒ2 αποτελεί κύριο συστατικό του μηχανισμού ματίσματος: αλληλεπιδρά με τους παράγοντες ματίσματος PRP19, BCAS2 και Aquarius και προσδένεται σε pre-mRNAs καθώς και στα U4 και U6 snRNAs. Απώλεια της XAB2 οδηγεί σε ελαττωματική ωρίμαση του pre-mRNA μέσω της μειωμένης εκτομής ιντρονίων, μειωμένη επιδιορθωτική ικανότητα του NER και ανεπαρκή ενεργοποίηση του DDR. Επιπλέον, η επαγωγή βλαβών στο DNA προκαλεί την αποσύνδεση της ΧΑΒ2 από τους RNA στόχους της. αντίστοιχη αποσύνδεση παρατηρήθηκε και σε ηπατικό ιστό αναπτυσσόμενων ποντικών με μεταλλαγές που προκαλούν ανεπάρκεια του μηχανισμού NER. Κατά συνέπεια, προτείνουμε ότι η ΧAB2 αποτελεί λειτουργικό σύνδεσμο μεταξύ των μηχανισμών ματίσματος, NER και γενικότερου DDR. Αυτή η λειτουργική σύνδεση σε συνδυασμό με τις παρατηρήσεις στον ηπατικό ιστό αναπτυσσόμενων ποντικών με ελαττωματικό NER, θα μπορούσε να εξηγήσει εν μέρει τις αναπτυξιακές ανωμαλίες που παρατηρούνται σε ασθένειες με παθολογική αιτιολογία την ανεπάρκεια μηχανισμών επιδιόρθωσης DNA.
Φυσική περιγραφή 216 σ. : πίν., σχήμ., εικ. (μερ. εγχρ.) ; 30 εκ.
Γλώσσα Αγγλικά
Θέμα NER
Nucleotide excision repair
Επιδιόρθωση με εκτομή νουκλεοτιδίων
Ημερομηνία έκδοσης 2021-07-28
Συλλογή   Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Βιολογίας--Διδακτορικές διατριβές
  Τύπος Εργασίας--Διδακτορικές διατριβές
Εμφανίσεις 30

Ψηφιακά τεκμήρια
No preview available

Κατέβασμα Εγγράφου
Προβολή Εγγράφου
Εμφανίσεις : 1