E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Βιοχημικός και βιοφυσικός χαρακτηρισμός των χλωροσωμάτων του βακτηρίου Chlorobaculum tepidum

Αρχική Βιοχημικός και βιοφυσικός χαρακτηρισμός των χλωροσωμάτων του βακτηρίου Chlorobaculum tepidum

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Τίτλος

Βιοχημικός και βιοφυσικός χαρακτηρισμός των χλωροσωμάτων του βακτηρίου Chlorobaculum tepidum

Συγγραφέας

Διβάρης, Παναγιώτης

Σύμβουλος διατριβής

Τσιώτης, Γεώργιος

Περίληψη

Στην παρούσα εργασία μελετάται η ανάπτυξη του βακτηρίου Chlorobaculum tepidum παρουσία και απουσία βιταμίνης B₁₂. To Chlorobaculum tepidum αποτελεί πράσινο θειούχο, κατά Gram αρνητικό βακτήριο, το οποίο αναπτύσσεται υποχρεωτικά υπό αναερόβιες συνθήκες, περιέχει ορισμένα φωτοσυλλεκτικά οργανίδια, τα χλωροσώματα και χρησιμοποιεί ενώσεις θείου, συγκεκριμένα θειούχα και θειοθειικά άλατα, καθώς και στοιχειακό θείο, ως δότες ηλεκτρονίων, για την φωτοσυνθετική διαδικασία. Με στόχο την παραπάνω μελέτη, συλλέχθηκαν κύτταρα του βακτηρίου από καλλιέργειες σε διάφορα στάδια ανάπτυξης (4h, 24h, 30h, 48h) και μέσω ποσοτικοποίησης των βακτηριοχλωροφυλλών a, c, d & e και του στοιχειακού θείου (S°) με φασματοφωτομετρία υπεριώδους - ορατού, εξετάστηκε η επίδραση της βιταμίνης B₁₂ στον ρυθμό ανάπτυξης αυτού. Στην συνέχεια, μέσω βαθμίδωσης ζάχαρης, πραγματοποιήθηκε απομόνωση των χλωροσωμάτων των κυττάρων, των οποίων το μέγεθος και σχήμα προσδιορίστηκαν από εικόνες ηλεκτρονικού μικροσκοπίου διέλευσης (TEM), με την χρήση μεθόδων κρυο-ηλεκτρονικής μικροσκοπίας (Cryo-EM) και αρνητικής χρώσης (Negative Staining). Τέλος, πραγματοποιήθηκε αποδιατακτική ηλεκτροφόρηση πηκτής πολυακρυλαμιδίου (SDS-PAGE) για την μελέτη και τον προσδιορισμό των χλωροσωμικών πρωτεϊνών, καθώς και ταυτοποίηση αυτών με φασματομετρία μάζας MALDI-TOF και έγινε προσπάθεια απομόνωσης του baseplate της χλωροσωμικής πρωτεΐνης CsmA.

Γλώσσα

Ελληνικά

Θέμα

Cryo-EM

CsmA-baseplate

Negative staining

SDS-PAGE

Silver staining

Βιταμίνη Β12

Διαβάθμιση ζάχαρης

Πράσινα θειούχα βακτήρια

Φασματομετρία απορρόφησης UV-Vis