|
|
| Κωδικός Πόρου |
000410651 |
| Τίτλος |
Μελέτη της μικροβιακής σύστασης της σκόνης τησ Σαχάρας : εφαρμογές στη περιβαλλοντική μικροβιολογία |
| Άλλος τίτλος |
Study of the microbial community on Sahara dust. |
|
Συγγραφέας
|
Ζώτου, Κλειώ Α.
|
|
Σύμβουλος διατριβής
|
Στεφάνου, Ευρυπίδης
|
| Περίληψη |
Η παρούσα διπλωματική εργασία είχε ως στόχο της τον χαρακτηρισμό της βακτηριακής ποικιλότητας στην αερομεταφερόμενη σκόνη από τη Σαχάρα με τη χρήση νέων τεχνολογιών αλληλλούχισης. Ο προσδιορισμός της μικροβιακής ποικιλότητας της αφρικανικής σκόνης καθώς και ο χαρακτηρισμός των βακτηριακών κοινοτήτων που εν δυνάμει θα μπορούσαν να αποτελέσουν κίνδυνο για την ανθρώπινη υγεία ήταν ο σκοπός της παρούσας διπλωματικής. Οι νέες τεχνολογίες επιλέχθηκαν διότι προσφέρουν μεγαλύτερη απόδοση, λεπτομέρεια, διακριτική ικανότητα και μεγαλύτερη ταχύτητα. Αυτή είναι η πρώτη μελέτη στην Ελλάδα όπου η βακτηριακή ποικιλότητα χαρακτηρίζεται με την χρησιμοποίηση ομικών τεχνολογιών.
Η δειγματοληπτική διαδικασία ξεκίνησε το 2013 όπου λήφθηκαν τα πρώτα δείγματα και συνεχίστηκε έως το 2014. Ο συνολικός αριθμός των δειγμάτων ήταν 22 και χωρίστηκαν σε δείγματα όπου το φαινόμενο ήταν στην ακμή του και σε δείγματα που το φαινόμενο δεν υπήρχε ώστε να έχουμε την δυνατότητα να συγκρίνουμε και να διαχωρίσουμε τη βακτηριακή ποικιλότητα μεταξύ των 2 περιόδων. Η δειγματοληψία έλαβε χώρα στο Εργαστήριο Χημικών Περιβαλλοντικών Διεργασιών από το κ. Ιακωβίδη. Στη συνέχεια τα δείγματα μεταφέρθηκαν στο εργαστήριο Μοριακής Βιολογίας του Πανεπιστημίου Πατρών όπου ξεκίνησε η διαδικασία για το χαρακτηρισμό των βακτηριακών κοινοτήτων. Το πρώτο βήμα στη διαδικασία ήταν η απομόνωση του γενετικού υλικού η οποία πραγματοποιήθηκε με το DNA Isolation kit της εταιρίας MOBIO. Εν συνεχεία αφού εκτιμήθηκε η ποσότητα και η καθαρότητα του γενετικού υλικού ξεκίνησε η ενίσχυση του. Η απαιτούμενη ποσότητα που χρειάζονταν ώστε να μελετηθεί το δείγμα είναι 300 ng γενετικού υλικού. Μετά το πέρας της διαδικασίας της ενίσχυσης του γενετικού υλικού ακλούθησε ο καθαρισμός και η τελική ποσοτικοποίηση. Το τελικό στάδιο της πειραματικής διαδικασίας έλαβε χώρα στην εταιρία IMGM S.A όπου πραγματοποιήθηκε και η τελική αλληλούχιση. Για την ανάλυση των δεδομένων χρησιμοποιήθηκε το λογισμικό πακέτο Qiime.
Τέλος για την στατιστική ανάλυση και την εικονική παρουσίαση των δεδομένων που αναλύθηκαν έγινε χρήση των προγραμμάτων Past 3, Primer 7 και Excel.
|
| Φυσική περιγραφή |
93 φύλλα : πίν., σχήμ., εικ. (μερ. εγχρ.) ; 30 εκ. |
| Γλώσσα |
Ελληνικά |
| Θέμα |
Bacteria |
|
Βακτήρια |
|
Ποικιλότητα |
| Ημερομηνία έκδοσης |
2017-07-21 |
| Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Χημείας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
|
|
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
| Εμφανίσεις |
278 |
Μελέτη της μικροβιακής σύστασης της σκόνης τησ Σαχάρας : εφαρμογές στη περιβαλλοντική μικροβιολογία
