Your browser does not support JavaScript!

Αρχική    SATB1 mediated chromatin landscape in murine T cells  

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

Προσθήκη στο καλάθι
[Προσθήκη στο καλάθι]
Κωδικός Πόρου 000433992
Τίτλος SATB1 mediated chromatin landscape in murine T cells
Άλλος τίτλος Ο ρόλος του SATB1 στην διαμόρφωση της δομής της χρωματίνης στα Τ κύτταρα ποντικού
Συγγραφέας Παπαματθαιάκης, Διονύσιος Αλέξανδρος Ι.
Σύμβουλος διατριβής Σπηλιανάκης, Χαράλαμπος
Επιστημονικός σύμβουλος Ταλιανίδης, Ιωάννης
Περίληψη Το γονιδίωμα των ανώτερων θηλαστικών χαρακτηρίζεται από την πολύπλοκη και πολυδιάστατη οργάνωση της δομής της χρωματίνης στον τρισδιάστατο χώρο του πυρήνα. Η αρχιτεκτονική του ευκαρυωτικού γονιδιώματος επηρεάζει άμεσα την επιγενετική ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης μέσω της στρατολόγησης σημαντικών μεταγραφικών παραγόντων και αναδιοργανωτών της χρωματίνης. Η πρωτεΐνη Special AT-rich sequence Binding protein 1 (SATB1) είναι ένας οργανωτής της χρωματίνης διαδραματίζοντας σημαντικό ρόλο στη διαμόρφωση της χρωματινικής δομής των Τ λεμφοκυττάρων. Η απουσία της SATB1 οδηγεί σε διακοπή της ανάπτυξης των Τ λεμφοκυττάρων προσδίδοντας στο ποντίκι φαινοτυπικά χαρακτηριστικά που προσομοιάζουν με αυτοανοσία. Τα τελευταία χρόνια, μελέτες για την SATB1 έχουν επιβεβαιώσει την ικανότητά της να δημιουργεί βρόχους σε μικρές γονιδιωματικές αποστάσεις καθώς και τον ρόλο της στην ορθή ανάπτυξη διαφόρων γενεαλογιών των Τ λεμφοκυττάρων. Παρόλα αυτά ο μηχανισμός μέσω του οποίου η SATB1 διαμεσολαβεί τη δημιουργία γειτνιάσεων μεταξύ ενισχυτών και υποκινητών γονιδίων παραμένει άγνωστος. Η παρούσα μελέτη εστιάστηκε στη μελέτη της αλληλεπίδρασης της πρωτεΐνης SATB1 με διάφορους μεταγραφικούς παράγοντες και στο ρόλο της να ρυθμίζει τη δράση τους. Παρατηρήθηκε αλληλεπίδραση της SATB1 με την ακετυλοτρασφεράση p300 και επιβεβαιώθηκε ότι έχουν παρόμοια υποκυτταρική κατανομή στον πυρήνα των θυμοκυττάρων. Επιπροσθέτως, πραγματοποιήθηκε ανοσοκατακρήμνιση χρωματίνης για την ενεργοποιητική της μεταγραφής τροποποίηση της ιστόνης H3K27ac σε αγρίου τύπου C57BL/6 (WT) και Satb1fl/flCD4-Cre (Satb1 cKO) θυμοκύτταρα. Το συνολικό επίπεδο της ακετυλίωσης της ιστόνης 3 (H3) στη λυσίνη 27 (K27) δεν έδειξε σημαντικές διαφορές μεταξύ των δύο καταστάσεων, το οποίο επιβεβαιώθηκε και με πειράματα ανοσοφθορισμού για την H3K27ac και τη SATB1. Παρόλα αυτά παρατηρήθηκε απορρύθμιση στην εναπόθεση της ακετυλίωσης σε συγκεκριμένες γονιδιωματικές περιοχές όπου είτε μειώθηκαν είτε αυξήθηκαν τα επίπεδά της. Ενδιαφέρουσα ήταν η παρατήρηση μειωμένης εναπόθεσης και συνεπώς ενεργότητας σε ρυθμιστικές περιοχές γονιδίων που ευθύνονται για τον έλεγχο της ορθής ανάπτυξης, διαφοροποίησης και καθορισμού των διαφορετικών κυτταρικών γενεαλογιών των Τ κυττάρων. Αντίθετα, παρατηρήθηκε αυξημένη εναπόθεση σε ενεργοποιητικές προφλεγμονώδεις κυτοκίνες και μεταγραφικούς παράγοντες που καθορίζουν την ενεργοποίηση και τη δράση κυτταρικών γενεαλογιών οι οποίες αναπτύσσονται σε μετέπειτα στάδια. Συμπερασματικά, η SATB1 είναι ικανή και απαραίτητη για τη χωροχρονική ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης σε διάφορες γενεαλογίες των Τ κυττάρων και η απουσία της μπορεί να οδηγήσει σε φαινότυπο που προσομοιάζει αυτόν της αυτοανοσίας.
Φυσική περιγραφή 37 σ. : πίν., σχήμ., εικ. (μερ. εγχρ.) ; 30 εκ.
Γλώσσα Αγγλικά
Θέμα Gene regulation
Immune system
Transcription
Ανοσοποιητικό σύστημα
Γονιδιακή ρύθμιση
Χρωματίνη
Ημερομηνία έκδοσης 2020-11-27
Συλλογή   Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Βιολογίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
  Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
Εμφανίσεις 11

Ψηφιακά τεκμήρια
No preview available

Κατέβασμα Εγγράφου
Προβολή Εγγράφου
Εμφανίσεις : 1