|
|
| Κωδικός Πόρου |
000463053 |
| Τίτλος |
Population genomic analysis of the European anchovy (Engraulis encrasicolus) in the Western and Central Mediterranean |
| Άλλος τίτλος |
Γονιδιωματική πληθυσμών του Ευρωπαϊκού γαύρου (Engraulis encrasicolus) της Δυτικής και Κεντρικής Μεσογείου |
|
Συγγραφέας
|
Αλεξανδρίδης, Δαμιανός Ν.
|
|
Σύμβουλος διατριβής
|
Τσιγγενόπουλος, Κωνσταντίνος
|
|
Μέλος κριτικής επιτροπής
|
Σωμαράκης, Στυλιανός
Μανουσάκη, Τ.
|
| Περίληψη |
Οι γονιδιωματικές μελέτες έχουν γίνει πρόσφατα ένα ισχυρό εργαλείο για την απόκτηση γνώσεων σχετικά με την πρόσφατη εξελικτική ιστορία των ειδών, τα πρότυπα της χωρικής γενετικής δομής και συνδεσιμότητας. Ο ευρωπαϊκός γαύρος (Engraulis encrasicolus), ένα από τα σημαντικότερα πελαγικά ψάρια στη Μεσόγειο Θάλασσα, αποτελεί βασικό είδος στο θαλάσσιο οικοσύστημα λόγω του ρόλου του στη ρύθμιση των τροφικών αλληλεπιδράσεων, ενώ παράλληλα συμβάλλει σημαντικά στην αλιευτική βιομηχανία της περιοχής. Σκοπός της παρούσας έρευνας ήταν η αξιολόγηση της γενετικής δομής του πληθυσμού του ευρωπαϊκού γαύρου στη Δυτική και Κεντρική Μεσόγειο με τη χρήση γονιδιωματικής προσέγγισης. Για τον εντοπισμό μεγάλου αριθμού πολυμορφικών τόπων, συναρμολογήσαμε αρχικά ένα πρόχειρο γονιδίωμα αναφοράς 1.69 Gb και 79.8% γονιδιακής περιεκτικότητας -BUSCO- που χρησιμεύει ως ισχυρό μέσο για την περαιτέρω ανάλυσή μας. Στη συνέχεια, στοιχίσαμε τα δεδομένα αλληλούχησης ddRAD, από 398 άτομα γαύρου σε δώδεκα περιοχές της Δυτικής και Κεντρικής Μεσογείου, τα οποία οδήγησαν στην επιτυχή γονοτύπηση και περαιτέρω μελέτη με βάση 9.497 μονονουκλεοτιδικούς πολυμορφισμούς (SNPs). Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι τα δείγματά μας χωρίστηκαν σε δύο ομάδες: η μία περιλαμβάνει τον Ατλαντικό και την Θάλασσα Alboran και η άλλη τη Βορειοδυτική και Κεντρική Μεσόγειο Θάλασσα (FST=0,09). Αυτή η διαφοροποίηση αναδεικνύει την παρουσία δύο διαφορετικών γενετικών δεξαμενών, η οποία ευθυγραμμίζεται με προηγούμενες έρευνες για τον ευρωπαϊκό γαύρο, υποδεικνύοντας για άλλη μια φορά το μέτωπο Αλμερίας-Οράν ως πιθανό φραγμό γενετικής ροής στο είδος. Κατά συνέπεια, η έρευνά μας θέτει τις βάσεις για την οριοθέτηση διακριτών ιχθυαποθεμάτων και την εφαρμογή στοχευμένων στρατηγικών διατήρησης για τη διαφύλαξη του είδους από την υπεραλίευση και την υποβάθμιση των ενδιαιτημάτων.
|
| Φυσική περιγραφή |
43 σ. : πίν., σχήμ., εικ. ; 30 εκ. |
| Γλώσσα |
Αγγλικά |
| Θέμα |
DDRAD |
|
Genome assembly |
|
SNPS |
|
Ευρωπαϊκός γαύρος |
|
Μεσόγειος |
|
Συναρμολόγηση γονιδιώματος |
| Ημερομηνία έκδοσης |
2024-03-29 |
| Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Βιολογίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
|
|
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
| Εμφανίσεις |
242 |
Population genomic analysis of the European anchovy (Engraulis encrasicolus) in the Western and Central Mediterranean
