Your browser does not support JavaScript!

Αρχική    Learning pathway dynamics from single-cell proteomic data  

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

Προσθήκη στο καλάθι
[Προσθήκη στο καλάθι]
Κωδικός Πόρου 000419430
Τίτλος Learning pathway dynamics from single-cell proteomic data
Άλλος τίτλος Μάθηση δυναμικών βιολογικών μονοπατιών από single cell δεδομένα
Συγγραφέας Βέρρου, Κλειώ-Μαρία
Σύμβουλος διατριβής Τσαμαρδίνος, Ι
Νικολάου, Χ.
Στρουμπούλης, Ι
Περίληψη Οι πλατφόρμες μονού κυττάρου παρέχουν δεδομένα με στατιστικά μεγάλα δείγματα παρατηρήσεων στιγμιότυπου ικανών να επιλύσουν τη διακυτταρική ετερογένεια. Επί του παρόντος, υπάρχει μια αυξανόμενη βιβλιογραφία σχετικά με τους αλγόριθμους που εκμεταλλεύονται αυτό το χαρακτηριστικό προκειμένου να συναχθεί η τροχιά των βιολογικών μηχανισμών όπως ο πολλαπλασιασμός των κυττάρων και η διαφοροποίηση. Η μεθοδολογία συμπερασμάτων τροχιάς (Τ.Ι. μέθοδοι) δεν έχει ακόμη χρησιμοποιηθεί για την αντιμετώπιση του προβλήματος της εκμάθησης της δυναμικής των σηματοδοτικών πρωτεϊνικών μονοπατιών. Σε αυτή την εργασία αξιολογούμε αυτήν την προοπτική. Ελέγξαμε την απόδοση αυτής της νέας κατηγορίας μεθόδων σε δύο από τα προσωρινά σύνολα δεδομένων των πρωτεϊνωμάτων που δημιουργήθηκαν χρησιμοποιώντας ξεχωριστά σηματοδοτικά ερεθίσματα στον ίδιο πληθυσμό κυττάρων. Για να αξιολογήσουμε την ποιότητα της μάθησης, κατασκευάσαμε τέσσερις διαφορετικές μεθόδους αξιολόγησης που εξετάζουν την απόδοση του αλγορίθμου με βάση (α) την προϋπάρχουσα βιολογική γνώση, (β) την ευρωστία τους, (γ) τη συσχέτιση τους με το αρχικό σύνολο δεδομένων και (δ) την τραχύτητα των επιπέδων φωσφορυλίωσης κατά τον βιολογικό χρόνο. Δείχνουμε ότι μόνο ο πειραματικός χρόνος είναι ανεπαρκής για να παρέχει γνώση σχετικά με τη σειρά των πρωτεϊνών κατά τη διάρκεια της μεταγωγής σήματος. Συνεπώς, δείχνουμε ότι οι T.Ι. μέθοδοι παρέχουν πλουσιότερες πληροφορίες σχετικά με την υποβόσκουσα δυναμική. Τα αποτελέσματά μας υπογραμμίζουν επίσης ότι κανένας από τους ήδη αναπτυγμένους αλγορίθμους δεν είναι καθολικά εφαρμόσιμος σε αυτό το πρόβλημα, επειδή η ποιότητα εκμάθησης εξαρτάται σε μεγάλο βαθμό από τη σηματοδοτικό εναύσματα.
Φυσική περιγραφή 70 σ. : πίν. σχήμ. ; 30 εκ.
Γλώσσα Αγγλικά
Θέμα Mass cytometry
Proteomics
Ψευδοχρόνος
Ημερομηνία έκδοσης 2018-12-05
Συλλογή   Σχολή/Τμήμα--Ιατρική Σχολή--Τμήμα Ιατρικής--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
  Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
Εμφανίσεις 124

Ψηφιακά τεκμήρια
No preview available

Δεν έχετε δικαιώματα για να δείτε το έγγραφο.
Δεν θα είναι διαθέσιμο έως: 2021-12-05