Your browser does not support JavaScript!

Αρχική    Genome analysis of Lagocephalus sceleratus : Unraveling the genomic aspects of a successful invader  

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

Προσθήκη στο καλάθι
[Προσθήκη στο καλάθι]
Κωδικός Πόρου 000440919
Τίτλος Genome analysis of Lagocephalus sceleratus : Unraveling the genomic aspects of a successful invader
Άλλος τίτλος Γονιδιωματική ανάλυση του είδους Lagocephalus sceleratus
Συγγραφέας Δάνης, Θεόδωρος
Σύμβουλος διατριβής Μανουσάκη, Τερέζα
Μέλος κριτικής επιτροπής Ηλιόπουλος, Ιωάννης
Ποταμιάς, Γεώργιος
Καντεράκης, Αλέξανδρος
Περίληψη Η ταξινομική οικογένεια Tetraodontidae περιλαμβάνει διάφορα είδη που ελκύουν ερευνητικό ενδιαφέρον όσον αναφορά την οικολογία και την εξέλιξη τους. Ωστόσο, τα γονιδιώματα αναφοράς και κάθε είδους γενωμικών πηγών, σπανίζουν για τα μέλη της οικογένειας αυτής. Στην παρούσα εργασία, επικεντρώσαμε την προσοχή μας στο λαγοκέφαλο (Lagocephalus sceleratus), γνωστό και ως ‘invasive sprinter’, διότι εισέβαλε από την Ερυθρά Θάλασσα στην Ανατολική και μέρος της Δυτικής Μεσογείου, μέσω της διώρυγας του Suez, μόλις μέσα σε μία δεκαετία. Το γονιδίωμα που κατασκευάστηκε αποτελείται από 235 contigs (N50 = 11,3 Mb) συνολικού μεγέθους 360 Mb με πληρότητα σε 98% σύμφωνα με τα αποτελέσματα του BUSCO. Το γονιδίωμα περιέχει 21,251 γονίδια εκ των οποίων τα 20,578 έχουν ταυτοποιηθεί λειτουργικά. Η φυλογενετική θέση του λαγοκέφαλου είναι ως το γειτονικό είδος του T. nigroviridis και μέσω της ανάλυσης των γονιδιακών οικογενειών βρέθηκε ότι 28 οικογένειες έχουν υποστεί διεύρυνση και 13 συρρίκνωση. Επιπλέον, ένας σημαντικός αριθμός γονιδίων του ανοσοποιητικού συστήματος έχει διευρυνθεί υποδεικνύοντας την σημαντική συνεισφορά τους στην επιτυχημένη εισβολή του λαγοκέφαλου. Το υψηλής ποιότητας γονιδίωμα που κατασκευάστηκε στην παρούσα εργασία αναμένεται να αποτελέσει την βάση για περαιτέρω μελέτες της βιολογίας του λαγοκέφαλου.
Φυσική περιγραφή 55 σ. : πίν. σχήμ. ; 30 εκ.
Γλώσσα Αγγλικά
Θέμα Assembly
Genomics
Invasion
Phylogenomics
Synteny
Εισβολέας
Φυλογονιδιωματική
Ημερομηνία έκδοσης 2021-07-30
Συλλογή   Σχολή/Τμήμα--Ιατρική Σχολή--Τμήμα Ιατρικής--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
  Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
Εμφανίσεις 428

Ψηφιακά τεκμήρια
No preview available

Κατέβασμα Εγγράφου
Προβολή Εγγράφου
Εμφανίσεις : 8