E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Evolution of conserved non-coding elements in teleost fish

Αρχική Evolution of conserved non-coding elements in teleost fish

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000444172

Τίτλος

Evolution of conserved non-coding elements in teleost fish

Άλλος τίτλος

Εξέλιξη των συντηρημένων μη κωδικών στοιχείων στους τελεοστέους

Συγγραφέας

Ηλιοπούλου, Ελισάβετ

Σύμβουλος διατριβής

Ηλιόπουλος, Ιωάννης

Μέλος κριτικής επιτροπής

Παυλίδης, Παύλος
Μανουσάκη, Τερέζα

Περίληψη

Πολλά γονίδια που σχετίζονται με εξελικτικά συντηρημένες λειτουργίες βρίσκονται κοντά σε εξαιρετικά συντηρημένα μη κωδικα στοιχεία (CNE), τα οποία συχνά δρουν ως ενισχυτές των γειτονικών τους γονιδίων. Ένας μικρός αριθμός μελετών έχει υποδείξει την απώλεια και την ταχεία εξελικτική απόκλιση των CNE στους τελεόστεους. Εδώ, επικεντρωθήκαμε στον εντοπισμό και τη μελέτη του συνόλου των CNE των τελεόστεων, εκμεταλλευόμενοι την πρόσφατη αύξηση των γονιδιωμάτων υψηλής ποιότητας. Σχεδιάσαμε μια διαδικασία συγκριτικής γονιδιωματικής για την ευθυγράμμιση των γονιδιωμάτων και την ανίχνευση των CNE. Επιπλέον, κατασκευάσαμε φυλογενωμικά δέντρα με βάση τα CNE, για να ελέγξουμε τις δυνατότητές τους στην επίλυση των φυλογενετικών τοποθετήσεων των τελεόστεων και να μελετήσουμε την απώλεια, την αύξηση και την εξελικτική απόκλιση των CNE μεταξύ των τελεόστεων. Τέλος, προσπαθήσαμε να αποκτήσουμε πληροφορίες σχετικά με τη δυνατότητα των εντοπισμένων CNE ως αναπτυξιακών ενισχυτών, συσχετίζοντάς τα με κοντινά αναπτυξιακά γονίδια. Η μελέτη αυτή παρείχε πληροφορίες σχετικά με την εξέλιξη των CNE στους τελεόστεους και ένα σύνολο πιθανά συντηρημένων αναπτυξιακών ρυθμιστικών στοιχείων που μπορούν να χρησιμοποιηθούν σε περαιτέρω πειραματικές δοκιμές.

Φυσική περιγραφή

50 σ. : πίν. σχήμ. ; 30 εκ.

Γλώσσα

Αγγλικά

Θέμα

Enhancers

Pairwise whole genome alignment

Phylogenomic analysis

Vertebrates

Ολόκληρος διπλασιασμός του γονιδιώματος

Σπονδυλωτά

Συντηρημένα μη κωδικά στοιχεία