E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Πρόβλεψη ανθρώπινων στόχων miRNAS σε περιοχές διαφορετικές των 3 UTRs χρησιμοποιώντας γνωστούς αλγόριθμους

Αρχική Πρόβλεψη ανθρώπινων στόχων miRNAS σε περιοχές διαφορετικές των 3 UTRs χρησιμοποιώντας γνωστούς αλγόριθμους

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000373305

Τίτλος

Πρόβλεψη ανθρώπινων στόχων miRNAS σε περιοχές διαφορετικές των 3 UTRs χρησιμοποιώντας γνωστούς αλγόριθμους

Άλλος τίτλος

Predicting human mirna target sites in regions other than 3utrs using known algorithms

Συγγραφέας

Πλιώτα, Πηνελόπη

Σύμβουλος διατριβής

Ηλιόπουλος, Ιωάννης

Περίληψη

Τα microRNAs (miRNAs) είναι μικρά ενδογενή μη-κωδικά μόρια RNA, που παίζουν σημαντικό ρόλο στην μετα-μεταγραφική ρύθμιση των γονιδίων. Στον άνθρωπο πιστεύεται πως τα miRNAs στοχεύουν κυρίως τα 3’UTRs (3’ αμετάφραστες περιοχές). Αντιθέτως, στα φυτά τα miRNAs είναι αδιαμφισβήτητο πως μπορούν να στοχεύσουν κάθε περιοχή πάνω στα mRNAs, όχι μόνο τα 3’UTRs. Τα περισσότερα όμως υπάρχοντα εργαλεία για την πρόβλεψη στόχων των miRNAs στον άνθρωπο περιορίζουν τα αποτελέσματα τους μόνο στα 3΄UTRs. Σκοπός της μελέτης είναι να φανεί αν τα εργαλεία αυτά μπορούν να προβλέψουν θέσεις-στόχους των miRNAs και σε άλλες περιοχές. Επιπρόσθετα, η μελέτη εστιάζει στην σύγκριση των κοινών προβλέψεων μεταξύ των εργαλείων. Όλα αυτά γίνονται τόσο κάτω από εξελικτικά μη συντηρημένες, όσο και συντηρημένες συνθήκες, δεδομένου ότι η εξελικτική συντήρηση παίζει πολύ σημαντικό ρόλο στην πρόβλεψη στόχων των miRNAs. Όπως τα αποτελέσματα δείχνουν, τα εργαλεία αυτά μπορούν να προβλέψουν πολλούς στόχους και σε άλλες περιοχές εκτός των 3’UTRs. Συγκεκριμένα όσο αφορά τα εξώνια, οι προβλέψεις των εργαλείων είναι περισσότερες σε σχέση με αυτές των 3’UTRs, ακόμα και μετά την εισαγωγή του παράγοντα της συντήρησης. Τα αποτελέσματα μπορούν να εξηγηθούν με δύο διαφορετικούς τρόπους. Ή ότι τα εργαλεία χρειάζονται πολύ βελτίωση ακόμα για την έγκυρη πρόβλεψη στόχων, όσον αφορά τον διαχωρισμό των περιοχών, ή ότι αγνοούμε σημαντικές βιολογικές πληροφορίες σε σχέση με το πώς και που δρουν τα miRNAs στον άνθρωπο.

Φυσική περιγραφή

66 σ : πιν. ; 30 εκ.

Γλώσσα

Ελληνικά

Θέμα

Human mirnas

Medical profession

Target prediction algorithms

miRNAs

Αλγόριθμοι πρόβλεψεις στόχων Mirnas

Ανθρώπινα mirnas

Ημερομηνία έκδοσης