E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Detection of Circulating Nucleic Acids associated with cancer using QCM-D acoustic device combined with RCA isothermal DNA amplification method

Αρχική Detection of Circulating Nucleic Acids associated with cancer using QCM-D acoustic device combined with RCA isothermal DNA amplification method

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000412656

Τίτλος

Detection of Circulating Nucleic Acids associated with cancer using QCM-D acoustic device combined with RCA isothermal DNA amplification method

Άλλος τίτλος

Ανίχνευση κυκλοφορούντων νουκλεϊκών οξέων που σχετίζονται με τον καρκίνο με τη χρήση ακουστικών βιοαισθητήρων σε συνδυασμό με την ισόθερμη μέθοδο πολλαπλασιασμού του DNA RCA

Συγγραφέας του σεναρίου

Ναούμη, Νιικολέττα Χ.

Σύμβουλος διατριβής

Γκιζέλη, Ηλέκτρα

Περίληψη

Ο καρκίνος αποτελεί κύρια αιτία θανάτου σε παγκόσμιο επίπεδο. Μέχρι τώρα οι κυριότερες τεχνικές που χρησιμοποιούνται για τη διάγνωση του καρκίνου είναι η ραδιολογία, η μαγνητική τομογραφία και η βιοψία με τη λήψη ιστού. Ωστόσο, οι παραπάνω μέθοδοι είναι ακριβές και απαιτούν σημαντικό χρόνο μέχρι τη λήψη των αποτελεσμάτων ενώ επίσης επιβαρύνουν την υγεία του ασθενή. Τα κυκλοφορούντα νουκλεϊκά οξέα, όπως τα κυκλοφορούν καρκινικό DNA και τα κυκλοφορούντα miRNAs έχουν χρησιμοποιηθεί επανειλημμένα για την ανάπτυξη μη επεμβατικών, μοριακών διαγνωστικών μεθόδων με στόχο την πρόγνωση και την αποτελεσματική και έγκαιρη διάγνωση του καρκίνου. Έτσι, μία μεγάλη ποικιλία μοριακών μεθόδων που βασίζονται στον πολλαπλασιασμό του στόχου, καθώς και μέθοδοι που κάνουν χρήση των νανοϋλικών, νανοτεχνολογίας και βιοαισθητήρων έχουν αναπτυχθεί ήδη. Ωστόσο, η πλειονότητα αυτών των μεθόδων χαρακτηρίζεται από υψηλό κόστος, αυξημένη πολυπλοκότητα της διαδικασίας, ενώ απαιτούν τη χρήση ειδικού εξοπλισμού και αρκετό χρόνο. Έτσι, δε δύναται να χρησιμοποιηθούν για καθημερινή κλινική εφαρμογή. Στόχος της μεταπτυχιακής διατριβής ήταν η ανάπτυξη μίας μη επεμβατικής, εύκολη στο χειρισμό και γρήγορης μεθόδου για την ανίχνευση σημειακών μεταλλάξεων στο ελεύθερο καρκινικό DNA καθώς και την ανίχνευση κυκλοφορούντων miRNAs. Και οι δύο μέθοδοι βασίζονται στη συνδυασμένη χρήση του QCM-D ακουστικού βιοαισθητήρα με την ισόθερμη μέθοδο πολλαπλασιασμού του DNA, RCA. Όσον αφορά την ανίχνευση σημειακών μεταλλάξεων στο ελεύθερο καρκινικό DNA, ανιχνεύθηκαν επιτυχώς και με υψηλή ακρίβεια τα 10 αντίγραφα του στόχου, έπειτα από την συνδυασμένη εφαρμογή αντίδραση μοριακής συγκόλλησης ακολουθούμενη από RCA. Ωστόσο, στον ακουστικό βιοαισθητήρα ανιχνεύθηκε 1 pmol του DNA στόχου. Σχετικά με την ανίχνευση κυκλοφορούντος miRNA, επιτεύχθηκε η ανίχνευση 1 fmol miRNA-21 χωρίς τη χρήση βιοαισθητήρα (off-chip), εφαρμόζοντας ενός-βήματος αντίδραση (κατά την οποία οι δύο ξεχωριστές αντιδράσεις συγκόλλησης και πολυμερισμού πραγματοποιούνται παράλληλα σε μία και μόνο αντίδραση) σε θερμοκρασία δωματίου, αποφεύγοντας τη χρήση οποιουδήποτε είδους συσκευής. Ωστόσο, το όριο ανίχνευσης στο βιοαισθητήρα αποτέλεσε το 0,1 pmol. Αν και απαιτείται η διεξαγωγή πολλών πειραμάτων ακόμη και βελτιστοποίηση των πρωτοκόλλων, τα αποτελέσματα είναι ενθαρρυντικά για την ανάπτυξη μία πρωτοπόρας διαγνωστικής μεθόδου με στίχο την κλινική εφαρμογή.

Φυσική περιγραφή

60 σ. : σχεδ., πίν., εικ. (μερ. εγχρ.) ; 30 εκ.

Γλώσσα

Αγγλικά

Θέμα

Acoustic Biosensors

Ακουστικοί βιοαισθητήρες

Κυκλοφορούντα νουκλεϊκά οξέα

Ημερομηνία έκδοσης

2017-11-22

Συλλογή

Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Βιολογίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης