E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Μελέτη πρωτεϊνικών συμπλόκων στο βακτηριακό στέλεχος Pseudomonas sp phDV1 παρουσία φαινόλης και οκρεσόλης

Αρχική Μελέτη πρωτεϊνικών συμπλόκων στο βακτηριακό στέλεχος Pseudomonas sp phDV1 παρουσία φαινόλης και οκρεσόλης

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000433952

Τίτλος

Μελέτη πρωτεϊνικών συμπλόκων στο βακτηριακό στέλεχος Pseudomonas sp phDV1 παρουσία φαινόλης και οκρεσόλης

Άλλος τίτλος

Study of protein complexes of the Pseudomonas sp phDV1 bacterial strain in presence of phenol and o-cresol

Συγγραφέας

Σπανού, Ανδρονίκη Γ.

Σύμβουλος διατριβής

Τσιώτης, Γεώργιος

Μέλος κριτικής επιτροπής

Γανωτάκης, Δημήτριος
Παυλίδης, Ιωάννης

Περίληψη

Η μελέτη των πρωτεϊνών και των πρωτεϊνικών συμπλόκων βακτηριακής προέλευσης είναι ένα πεδίο αυξανόμενου ενδιαφέροντος για την έρευνα της μεταφοράς και του μεταβολισμού των θρεπτικών συστατικών ενός βακτηρίου. Η Pseudomonas sp. phDV1, είναι ένα αρνητικό κατά Gram βακτήριο που επιλέγεται για την ικανότητα του να αποικοδομεί αρωματικές ενώσεις όπως είναι η φαινόλη και η ορθο-κρεσόλη. Στην παρούσα εργασία, έγινε ανάπτυξη του βακτηρίου χρησιμοποιώντας ως μοναδικές πηγές άνθρακα το ηλεκτρικό οξύ, την φαινόλη και την ορθο-κρεσόλη, αντίστοιχα, με σκοπό την πρωτεωμική ανάλυση των υδατοδιαλυτών και μεμβρανικών πρωτεϊνών/συμπλόκων του βακτηρίου. Για να επιτευχθεί η ανάπτυξη του βακτηρίου και έχοντας ως γνώμονα την τοξικότητα των παραπάνω αρωματικών ενώσεων, έγιναν προσπάθειες καλλιέργειας μέχρι να επιτευχθεί η ανάπτυξη του βακτηρίου στον εκάστοτε ρύπο και να συλλεχθούν τα βιολογικά δείγματα από τα οποία απομονώθηκαν το κυτταροπλασματικό και μεμβρανικό κλάσμα. Στην συνέχεια ακολουθείται ανάλυση των πρωτεϊνικών κλασμάτων με Blue Native PAGE (1D ή/και 2D ηλεκτροφόρηση). H ταυτοποίηση tων διαχωρισμένων πρωτεϊνών επιτεύχθηκε με φασματομετρίας μάζας και πιο συγκεκριμένα με την χρήση Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation (MALDI - TOF MS/MS) και nano-LC-Electron Spray (ESI) MS/MS. Τα αποτελέσματα που προκύπτουν από την πρωτεωμική ανάλυση αποτελούν συγκριτικές μελέτες για τις πρωτεΐνες και τα πρωτεϊνικά σύμπλοκα που ταυτοποιούνται ανάλογα την κάθε συνθήκη. Η παρούσα εργασία είναι μια καινούργια προσέγγιση στην μελέτη της μεταβολής του πρωτεώματος της Pseudomonas sp. phDV1, παρουσία μονοκυκλικών αρωματικών ρύπων.

Φυσική περιγραφή

217 σ. : πίν., σχήμ., εικ. (μερ.εγχρ.) ; 30 εκ.

Γλώσσα

Ελληνικά

Θέμα

Aromatic compounds

Biodegradation

Complexes

ESI

MALDI

Proteomic analysis

Pseudomonas sp. phDV1