| Περίληψη |
Ο ευρωπαϊκός γαύρος (Engraulis encrasicolus) είναι ένα από τα οκτώ είδη της οικογένειας Engraulidae. Κατανέμεται στη Μεσόγειο, στη Μαύρη Θάλασσα, στη Θάλασσα της Αζοφικής και στον ανατολικό Ατλαντικό από τις ακτές της Σκανδιναβίας μέχρι τις ακτές της δυτικής Αφρικής. Η αφθονία του είδους και η εξάρτησή του από χαμηλότερα επίπεδα πελαγικής τροφής, το καθιστούν πολύ σημαντικό συνδετικό κρίκο της αλυσίδας της ενεργειακής ροής των ανώτερων τροφικών επιπέδων.
Στην παρούσα μελέτη χρησιμοποιήθηκε το μικροδορυφορικό DNA ως μοριακός δείκτης για τη γενετική διαφοροποίηση των πληθυσμών του ευρωπαϊκού γαύρου. Το μικροδορυφορικό DNA είναι μικρές, επαναλαμβανόμενες, απλές αλληλουχίες DNA, μήκους 1-6 bp. Το μικροδορυφορικό DNA επιλέχθηκε ως ο καταλληλότερος δείκτης καθώς παρουσιάζει υψηλό πολυμορφισμό επιτρέποντας έτσι το διαχωρισμό μεταξύ ομοζυγωτικών και ετεροζυγωτικών καταστάσεων σε διπλοειδείς οργανισμούς. Είναι ιδιαίτερα πολυμορφικό επειδή συνήθως βρίσκεται σε περιοχές που δεν κωδικοποιούν πρωτεΐνες (μη κωδικές περιοχές) κι επομένως καμιά μεταλλαγή δεν μπορεί να επηρεάσει τη λειτουργία του. Ακόμη, εμφανίζεται συχνά και συνήθως κατανέμεται ομοιόμορφα στο πυρηνικό γονιδίωμα, και θεωρείται ότι έχει ουδέτερη συμπεριφορά όσον αφορά την επιλογή.
Από άτομα γαύρου κατασκευάσθηκαν εμπλουτισμένες γενωμικές βιβλιοθήκες για μικροδορυφορικό DNA. Από τις βιβλιοθήκες αυτές επιλέχθηκαν θετικοί κλώνοι, αλληλουχήθηκαν, και για όσους απ’ αυτούς περιείχαν κατάλληλη μικροδορυφορική αλληλουχία σχεδιάσθηκαν εκκινητές. Επιλέχθηκαν οι καλύτεροι μικροδορυφορικοί τόποι οι οποίοι χρησιμοποιήθηκαν για τη μελέτη της γενετικής δομής των πληθυσμών του γαύρου. Η παρούσα μελέτη ολοκληρώθηκε με τη γονοτύπηση 10 πληθυσμιακών δειγμάτων γαύρου (48-100 άτομα για κάθε δείγμα) που καλύπτουν το μεγαλύτερο μέρος της γεωγραφική εξάπλωσης του είδους, από τη Μαύρη Θάλασσα μέχρι το Βόρειο Ατλαντικό.
Τα αποτελέσματα των γονοτυπήσεων ερμηνεύονται σύμφωνα με την τοπογραφία των περιοχών και συγκρίνονται με αντίστοιχες πληροφορίες που έχουν δημοσιευθεί για το συγκεκριμένο είδος, με χρήση άλλων μοριακών τεχνικών (μιτοχονδριακό DNA και αλλο ένζυμα).
|
Ανάπτυξη μικροδορυφορικών γενετικών δεικτών στον ευρωπαϊκό γαύρο (Engraulis encrasicolus) και μελέτη της γενετικής δομής των πληθυσμών του
