|
Κωδικός Πόρου |
000460509 |
Τίτλος |
The role of the nascent RNA in chromatin conformation and genome regulation |
Άλλος τίτλος |
Ο ρόλος του νεοσυντιθέμενου RNA στη ρύθμιση της διαμόρφωσης της χρωματίνης και της γονιδιακής έκφρασης |
Συγγραφέας
|
Κυδωνάκης, Κωνσταντίνος Ε.
|
Σύμβουλος διατριβής
|
Lavigne, Matthieu
|
Μέλος κριτικής επιτροπής
|
Σπηλιανάκης, Χαράλαμπος
Γιακουντής, Αντώνιος
|
Περίληψη |
Τα νεοσυντιθέμενα μόρια RNA θεωρούνταν για πολύ καιρό ως παθητικοί παίχτες της μεταγραφής και των συν-μεταγραφικών λειτουργιών. Ωστόσο πρόσφατα δημοσιευμένες μελέτες έχουν καταδείξει τον ρόλο των μορίων αυτών στην προαγωγή της μεταγραφής, του ματίσματος και στην αρχιτεκτονικής της χρωματίνης. Βασιζόμενοι σε αυτές τις μελέτες, προσπαθήσαμε να βελτιώσουμε και εντάξουμε στο πλαίσιο μελέτης της οργάνωσης και της χωρικής διευθέτησης του νεοσυντιθέμενου RNA, δύο νέες μοριακές μεθόδους. Μια εξ αυτών μελετάει ταυτόχρονα και καθολικά τις αλληλεπιδράσεις των μορίων RNA με την χρωματίνη και περιλαμβάνει σε τεχνολογίες αλληλούχισης νέας γενιάς (GRID-seq). Η επόμενη αξιοποιεί το σύστημα CRISPR-dCas9 και επιτυγχάνει την στόχευση συγκεκριμένων περιοχών χρωματίνης, επιτρέποντας την συν-κατακρήμνιση κάθε είδους αλληλεπιδρώντων παραγόντων. Όσον αφορά το GRID-seq καταφέραμε να πραγματοποιήσουμε διπλή χημική μονιμοποίηση, ωστόσο είναι απαραίτητο να γίνουν βελτιώσεις στη διαδικασία με σκοπό να αυξήσουμε τον αριθμό των πυρήνων που απομονώνουμε. Παράλληλα πραγματοποιήσαμε κατακρήμνιση χρωματίνης αξιοποιώντας το σύστημα CRISPR-dCas9, την in vitro προσέγγιση και αξιολογήσαμε τον εμπλουτισμό αξιοποιώντας την μέθοδο της ποσοτικής PCR. Παρόλο που στις περισσότερες περιπτώσεις φαίνεται το σύστημά μας να μπορεί να διακρίνει με υψηλή εξειδίκευση τους επιθυμητούς στόχους, περισσότερες βελτιώσεις είναι απαραίτητες ώστε να αυξήσουμε την απόδοση του εμπλουτισμού.
|
Φυσική περιγραφή |
40 σ. : πίν., σχήμ., εικ. (μερ. εγχρ.) ; 30 εκ. |
Γλώσσα |
Αγγλικά |
Ημερομηνία έκδοσης |
2023-11-24 |
Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Βιολογίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
|
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
Εμφανίσεις |
1049 |