E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - A tale of two proteins : S. cerevisiae Rad9 DNA damage checkpoint protein and Aft1 transcription factor on the surveillance of DNA damage-prone chromatin under non DNA damage-induced conditions. Insights from genome-wide analyses.

Αρχική A tale of two proteins : S. cerevisiae Rad9 DNA damage checkpoint protein and Aft1 transcription factor on the surveillance of DNA damage-prone chromatin under non DNA damage-induced conditions. Insights from genome-wide analyses.

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000388629

Τίτλος

A tale of two proteins : S. cerevisiae Rad9 DNA damage checkpoint protein and Aft1 transcription factor on the surveillance of DNA damage-prone chromatin under non DNA damage-induced conditions. Insights from genome-wide analyses.

Άλλος τίτλος

Μια ιστορία δύο πρωτεϊνών: Η πρωτεΐνη ελέγχου καταστροφής DNA ScRad9 και ο μεταγραφικός παράγοντας Aft1 στην επιτήρηση της ευαίσθητης σε καταστροφή DNA χρωματίνης υπό φυσιολογικές συνθήκες. Μελέτη με γονιδιωματικής κλίμακας αναλύσεις.

Συγγραφέας

Ανδρεάδης, Χρήστος Κ.

Σύμβουλος διατριβής

Αλεξανδράκη, Δέσποινα

Περίληψη

Οι πρωτεΐνες που αποκρίνονται στην καταστροφή του DNA και οι πρωτεΐνες επιδιόρθωσης των βλαβών στο DNA σχετίζονται σημαντικά με τα μονοπάτια συντήρησης του γονιδιώματος. Παρόλα αυτά, λίγα είναι γνωστά για το ρόλο τους σε συνθήκες μη επαγόμενης καταστροφής DNA. Στην παρούσα εργασία δείχνουμε ότι η πρωτεΐνη ελέγχου Rad9, γνωστή για τη διαμεσολάβηση του σήματος καταστροφής DNA από κινάσες που βρίσκονται στην κορυφή του μονοπατιού απόκρισης σε κινάσες που βρίσκονται στο τέλος αυτού, αλληλεπιδρά με τον μεταγραφικό παράγοντα Aft1 στη ζύμη. Ο παράγοντας Aft1 ρυθμίζει την ομοιόσταση του σιδήρου και επίσης σχετίζεται με τη γονιδιωματική ακεραιότητα έχοντας επιπρόσθετες λειτουργίες μη σχετιζόμενες με το σίδηρο. Χρησιμοποιώντας τεχνικές γονιδιωματικής κλίμακας και ανοσοκτακρήμνιση χρωματίνης βρήκαμε ότι η πρωτεΐνη Rad9 στρατολογείται στο 16% των γονιδίων της ζύμης, συχνά σχετιζόμενα με την κυτταρική ανάπτυξη και το μεταβολισμό, ενώ επηρεάζει τη μεταγραφή του ~2% του κωδικευόμενου γονιδιώματος κατά την απουσία εξωγενώς επαγόμενης καταστροφής DNA. Η πρωτεΐνη Rad9 στρατολογείται σε ευαίσθητες περιοχές του γονιδιώματος (μεταγραφικά ενεργές, πλούσιες σε αλληλουχίες GC, κεντρομερή, περιοχές αυξημένης συχνότητας μειωτικού ανασυνδυασμού και μεταθετά στοιχεία) με μη τυχαίο και Aft1-εξαρτώμενο τρόπο. Περαιτέρω αναλύσεις αποκάλυψαν ουσιαστικές ομοιότητες μεταξύ του προτύπου πρόσδεσης της Rad9 στο γονιδίωμα και σημαντικών τροποποιήσεων ιστονών σχετιζόμενων με ενεργή μεταγραφή όπως οι H3K36me, H3K79me και H3K4me. Επομένως, τα ευρήματά μας υποδεικνύουν ότι η πρωτεΐνη Rad9 συνεργάζεται με τον παράγοντα Aft1 σε περιοχές χρωματίνης που είναι ευαίσθητες σε καταστροφή DNA προκειμένου να διευκολύνουν την επιτήρηση του γονιδιώματος, διασφαλίζοντας ταχεία και αποτελεσματική απόκριση σε πιθανά γεγονότα καταστροφής DNA.

Φυσική περιγραφή

270 σ. : πίν., εικ. ; 30 εκ.

Γλώσσα

Αγγλικά

Θέμα

Chromatin immunoprecipitation

Genome integrity

Ακεραιότητα γονιδιώματος

Ανοσοκατακρήμνιση χρωματίνης

Ημερομηνία έκδοσης

2014-10-02

Συλλογή