| Περίληψη |
Η μεταγραφή των μη κωδικοποιητικών RNA είναι γνωστό ότι ρυθμίζει την έκφραση
γειτονικών γονιδίων που κωδικοποιούν πρωτεΐνες. Ένα τέτοιο γονίδιο είναι το ΙΜΕ1 ο
επαγωγέας της γαμετογένεσης στον ζυμομύκητα Saccharomyces cerevisiae, ο οποίος
ρυθμίζεται από το μη κωδικό RNA, IRT1 που βρίσκεται ανοδικά, μέσα στον υποκινητή του. Η
πρωτεΐνη Rpb9, μια υπομονάδα της RNA πολυμεράσης II είχε προηγουμένως αναγνωριστεί
από το εργαστήριο ως πιθανός ενεργοποιητής του IRT1. Ο στόχος αυτής της μεταπτυχιακής
διατριβής ήταν να διερευνήσει πώς η Rpb9 θα μπορούσε να εμπλέκεται στη ρύθμιση των
γονιδίων μεσω των μη κωδικών RNA.
Πρώτα απ 'όλα, όταν απουσιάζει η Rpb9 και όταν στο περιβάλλον υπάρχουν θρεπτικά σε
χαμηλή συγκέντρωση, η μεταγραφή του IRT1 καταστέλλεται οδηγώντας σε αύξηση της
έκφρασης του γονιδίου IME1 σε απλοειδή κύτταρα, η οποία μπορεί να οδηγήσει σε επαγωγή
μείωσης και στη συνέχεια σε χαμηλή βιωσιμότητα σε αυτόν τον κυτταρικό τύπο. Χαμηλή
βιωσιμότητα παρατηρείται επίσης στα σπόρια που δημιουργούνται κατά τη γαμετογένεση
όταν αυτή συμβαίνει σε διπλοειδή κύτταρα ομοζυγωτικά για τη μετάλλαξη rpb9Δ. Σε αυτά τα
κύτταρα, τα επίπεδα ενός ncRNA, του NDC80luti και του NDC80 (του γονιδίου που
κωδικοποιεί την πρωτεΐνη Ndc80), απορυθμίζονται απουσία Rpb9, και αυτό οδηγεί σε
ανώμαλο διαχωρισμό χρωμοσωμάτων κατά τη διάρκεια της μείωσης, με αποτέλεσμα τα
ελαττωματικά σπόρια που δεν μπορούν να επιβιώσουν. Τέλος, η Rpb9 βρέθηκε ότι είναι
σημαντική για τη ρύθμιση της έκφρασης ενός ακόμη γονιδίου, του SER3 το οποίο σε
περιβάλλον πλούσιο σε θρεπτικά συστατικά, καταστέλλεται από το ncRNA SRG1. Ενώ τα
επίπεδα του SRG1 δεν αλλάζουν σημαντικά απουσία Rpb9, παρατηρήσαμε μια μετατόπιση
στη θέση έναρξης της μεταγραφής SRG1, ανοδικά, η οποία μπορεί να συμβάλλει στην
αποκαταστολή του SER3.
Τα ευρήματά μας υποδεικνύουν ότι η Rpb9 απαιτείται για τη σωστή ρύθμιση τριών
γονιδιακών τόπων που ρυθμίζονται από μη κωδικοποιητική μεταγραφή. Η απώλεια της Rpb9,
οδηγεί σε απορρύθμιση των τόπων αυτών και στην συνέχεια σε διάφορους φαινοτύπους,
όπως χαμηλή βιωσιμότητα. Επιπλέον, αποδείχθηκε ότι η Rpb9 είναι στην πραγματικότητα
μια απαραίτητη πρωτεΐνη για τον σακχαρομύκητα, σε αντίθεση με όσα ήταν γνωστά μέχρι
τώρα.
|
Τhe role of Rpb9 in gene regulation by non-coding RNAs
