|
|
| Κωδικός Πόρου |
000351155 |
| Τίτλος |
Μεταβολή της βενθικής μικροβιακής ποικιλότητας με την απόσταση από κλωβούς ιχθυοκαλλιεργειών |
| Άλλος τίτλος |
Benthic bacterial community changes according to distance from fish farms |
|
Συγγραφέας
|
Φοδελιανάκης, Στέλιος
|
| Περίληψη |
Σκοπός της παρούσας εργασίας ήταν η μελέτη της μεταβολής της σύστασης της βενθικής μικροβιακής βιοκοινότητας εξαιτίας της επίδρασης της ιχθυοκαλλιέργειας με χρήση της ηλεκτροφόρησης σε διαβάθμιση αποδιατακτικών μέσων σε πήκτωμα πολυακριλαμίδης (Detergent Gradient Gel Electrophoresis ή DGGE) και ο συσχετισμός των δεδομένων αυτών με δεδομένα για βιοτικούς και αβιοτικούς παράγοντες που υπήρχαν για τα ίδια δείγματα. Αρχικά έγινε εξαγωγή ολικού DNA από δείγματα ιζήματος του ανώτερου στρώματος (0-5 cm) σε συγκεκριμένες αποστάσεις από κλωβούς ιχθυοκαλλιέργειας από δυο διαφορετικές τοποθεσίες. Ακολούθησε PCR με διαειδικούς (universal) βακτηριακούς εκκινητές και nested PCR με άλλο ζεύγος εσωτερικών διαειδικών εκκινητών. Τα προϊόντα διαχωρίστηκαν με βάση την αλληλουχία τους μέσω DGEE έτσι ώστε να εκτιμηθεί η μικροβιακή βιοποικιλότητα του κάθε δείγματος και να κατασκευαστούν οι μήτρες παρουσίας-απουσίας για τα βακτηριακά taxa. Ο μέσος αριθμός των βακτηριακών τάξων συσχετίστηκε με δεδομένα για τα ίδια δείγματα για τη συγκέντρωση των φωσφορικών ιόντων, της οργανικής ύλης, των δεικτών Δ* και ES(10) της ποικιλότητας της μακροπανίδας και τη διάμετρο των κόκκων του ιζήματος. Τέλος αλληλουχήθηκαν με κλωνοποίηση επιλεγμένες ζώνες μέσω DGGE, οι οποίες αντιπροσώπευαν taxa τα οποία είτε υπήρχαν μόνο στα δείγματα κοντά στους κλωβούς (πολυμορφικά), είτε υπήρχαν σε όλα τα δείγματα μιας περιοχής (κοινά). Τα αποτελέσματα της εργασίας δείχνουν:
Α) μια ομοιότητα στη σύσταση των βακτηριακών κοινοτήτων ανά δειγματοληπτική περιοχή
Β) μια τάση αύξησης του μέσου αριθμού των βακτηριακών τάξων κοντά στους κλωβούς
Γ) θετική συσχέτιση του μέσου αριθμού των βακτηριακών τάξων με τα φωσφορικά ιόντα και την οργανική ύλη και αρνητική με τους δείκτες ποικιλότητας της μακροπανίδας και τη διάμετρο των κόκκων του ιζήματος
Δ) παρουσία διαφορετικών βακτηριακών ομάδων ανά δειγματοληπτική περιοχή
|
| Φυσική περιγραφή |
43 σ. : εικ. ; 30 εκ. |
| Γλώσσα |
Ελληνικά |
| Θέμα |
16SRNA |
|
DGGE |
|
Metagenomics |
|
Microbes |
|
Βακτήρια |
| Ημερομηνία έκδοσης |
2009-11-20 |
| Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Βιολογίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
|
|
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
| Εμφανίσεις |
244 |
Μεταβολή της βενθικής μικροβιακής ποικιλότητας με την απόσταση από κλωβούς ιχθυοκαλλιεργειών
