|
Κωδικός Πόρου |
uch.chemistry.msc//2002stavrakis |
Τίτλος |
FTIR και Time-Resolved Step-Scan FTIR μελέτες της αντιδρασης του κυτοχρώματος cbb3 με το CO και το ΝΟ |
Συγγραφέας |
Σταυράκης, Σταύρος
|
Περίληψη |
Ο στόχος της παρούσας εργασίας είναι ο χαρακτηρισμός της δομής και της δυναμικής του διπυρηνικού κέντρου των κυτοχρωμικών Σε αυτή την εργασία περιγράφεται η κινητική μελέτη του συμπλόκου cbb3-CO με την τεχνική της step-scan FTIR φασματοσκοπίας. Το κυτόχρωμα cbb3 είναι η μοναδική αιμοχαλκοξειδάση στην οποία η διάσπαση του CuB-CO συμπλόκου συνοδεύεται από το σχηματισμό του Fe-CO συμπλόκου. Τα time-resolved FT-IR φάσματα της φωτοδιάσπασης του CO στη cbb3 κυτοχρωμική οξειδάση δείχνουν ότι η ν(CO) δόνηση τάσης του CuB στους 2064 cm-1 είναι ίδια με εκείνη του κυτοχρώματος αα3 παρόλο που το κυτόχρωμα cbb3 δεν περιέχει το cross-link Ηis-Tyr244 και τη φαρνεσυλική αλυσίδα. Οι ταχύτητες που υπολογίσαμε για τη διάσπαση του CO από το CuB (t1/2 = 120 μs) και την επαναδέσμευση του στην αίμη b3 (t1/2 = 150 μs) δείχνουν ότι το καθοριστικό στάδιο για την επαναδέσμευση του CO στην αίμη b3 είναι ο αποσχηματισμός του CuB-CO συμπλόκου. Σαν ένα πρώτο βήμα για την κατανόηση της αντίδρασης του κυτοχρώματος cbb3 με το NO είναι ο χαρακτηρισμός του διπυρηνικού κέντρου κατά τη δέσμευση του ΝΟ. Γι αυτό το λόγο μελετήσαμε με φασματοσκοπία UV-Vis και FTIR τη δομή του υποκατεστημένου με ΝΟ κυτοχρώματος cbb3 και τη συγκρίνουμε με αυτή των ΝΟ-συμπλόκων της αναγωγάσης του ΝΟ (ΝΟR) και της μυοσφαιρίνης. Τα δεδομένα δείχνουν ότι το ΝΟ δεσμεύεται αποκλειστικά στην αίμη b3 και όχι στο CuB. Αυτή είναι η πρώτη δονητική μελέτη της δέσμευσης του ΝΟ σε αιμοχαλκοξειδάση που βρίσκεται στην οξειδωμένη κατάσταση. Η απελευθέρωση του ΝΟ από την αίμη b3¬ του cbb3 δείχνει ότι το περιβάλλον της αίμης b3 στο cbb3 είναι λιγότερο πολικό από αυτό της NOR και ότι η ανοιχτή δομή του διπυρηνικού κέντρου b3/CuB, συγκρινόμενη με τη κλειστή δομή του διπυρηνικού κέντρου b3/μη-αιμικός Fe του NOR, διευκολύνει την θερμική απελευθέρωση του.
|
Ημερομηνία έκδοσης |
2002-00-01 |
Ημερομηνία διάθεσης |
2007-11-05 |
Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Χημείας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
|
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
Εμφανίσεις |
213 |