E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Φασματοσκοπικός χαρακτηρισμός της αλληλεπίδρασης του N3, CN, CO με το διπυρηνικό κέντρο του κυτοχρώματος c αα3 από το P. denitrificans και του κινολικού κυτοχρώματος bo3 από το E.coli

Αρχική Φασματοσκοπικός χαρακτηρισμός της αλληλεπίδρασης του N3, CN, CO με το διπυρηνικό κέντρο του κυτοχρώματος c αα3 από το P. denitrificans και του κινολικού κυτοχρώματος bo3 από το E.coli

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000369503

Τίτλος

Φασματοσκοπικός χαρακτηρισμός της αλληλεπίδρασης του N3, CN, CO με το διπυρηνικό κέντρο του κυτοχρώματος c αα3 από το P. denitrificans και του κινολικού κυτοχρώματος bo3 από το E.coli

Άλλος τίτλος

Spectroscopic characterization of the interaction of N3, CN, CO with the binuclear center of cytochrome caa3 from the P. denitrificans and quinol cytochrome bo3 from E.coli

Συγγραφέας

Βάμβουκα, Μαγδαληνή

Σύμβουλος διατριβής

Γανωτάκης, Δημήτριος

Περίληψη

Οι κυτοχρωμικές και κινολικές οξειδάσες είναι τα τελικά ένζυμα στην αναπνευστική αλυσίδα του κυττάρου. Καταλύουν την πλήρη αναγωγή του Ο₂ σε νερό, ενώ χρησιμοποιούν την ενέργεια που ελευθερώνεται για την ταυτόχρονη άντληση πρωτονίων κατά μήκος της βιολογικής μεμβράνης που είναι βυθισμένα. Το ηλεκτροχημικό δυναμικό που δημιουργείται κατά μήκος της μεμβράνης αποτελεί την κινητήρια δύναμη για τη σύνθεση του ΑΤΡ. Σκοπός της ερευνητικής εργασίας που παρουσιάζεται εδώ είναι η μελέτη της δομής και της δυναμικής του διπυρηνικού κέντρου των κυτοχρωμικών και κινολικών οξειδασών μέ χρήση φασματοσκοπίας ορατού υπεριώδους (UV-Vis) και υπερύθρου (FTIR). Συγκρκριμένα μελετάται η δέσμευση του ιόντος του αζιδίου στο πλήρως οξειδωμένο κυτόχρωμα αα₃ από το P. denitrificans βαστήριο. Τα αποτελέσματα δείχνουν ότι δέσμευση του αζιδίου σε δύο φάσεις, μία φάση υψηλής συγγένειας και μία φάση χαμηλής συγγένειας. Τα αποτελέσματα των FTIR πειραμάτων που παρουσιάζονται εδώ, προτείνουν ότι στη φάση χαμηλής συγγένειας το αζίδιο δεσμεύεται σε δύο ξεχωριστές διαμορφώσεις σχηματίζοντας, πιθανότατα και στις δύο, σύμπλοκα της μορφής αίμη α₃³⁺-Ν₃-Cu_B²⁺. Εξετάζεται επίσης η αλληλεπίδραση του ιόντος του κυανίου με την κυτοχρωμική οξειδάση από τα μιτοχόνδρια (CcO) και τα κινολικά κυτόχρωματα αα₃-600 από B. subtilis βακτήριο και bo₃ από το Ε. coli. H παρούσα εργασία προτείνει ότι το κυάνιο σχηματίζει σύμπλοκα γέφυρας στο πλήρως οξειδωμένο διπυρηνικό κέντρο της κυτοχρωμικής οξειδάσης των μιτοχονδρίων (CcO), του κυτοχρώματος bo₃ και του κυτοχρώματος αα₃-600. Επίσης, φαίνεται ότι σε pH 8.4, προσθήκη του κυανίου στην CcO προκαλεί την αναγωγή της αίμης α και του CuB, και προτείνεται ότι κάτω από αυτές τις συνθήκες το κυάνιο δεσμεύεται στο Fe_a3³⁺ σε δύο διαφορετικές διαμορφώσεις ως τελικό ligand. Βάσει των πειραματικών αποτελεσμάτων μας και προηγούμενων μελετών προτείνουμε μια σειρά πειραμάτων με χρήση στατικών και χρονοαναλυόμενων τεχνικών UV-Vis και FTIR με σκοπό 1) τον πλήρη χαρακτηρισμό της δέσμευσης εξωγενών ligands στο διπυρηνικό κέντρο των κυτοχρωμικών και κινολικών οξειδασών ως συνάρτηση του pH και της οξειδωτικής κατάστασης και 2) την κατανόηση της σχέσης εξάρτησης της θέσης αναγωγής και του μηχανισμού άντλησης των πρωτονίων.

Φυσική περιγραφή

iii, 45 φύλλα : εικ. ; 30 εκ.

Γλώσσα

Ελληνικά

Θέμα

Binuclear center

Cytochrome oxidases

FTIR spectroscopy

Ligand binding

Quinol oxodases

UV-VIS spectroscopy

Δέσμευση υποκατάστατων