E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Structural studies of the M.BseCI methyltransferase from Geobacillus stearothermophilus

Αρχική Structural studies of the M.BseCI methyltransferase from Geobacillus stearothermophilus

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000443485

Τίτλος

Structural studies of the M.BseCI methyltransferase from Geobacillus stearothermophilus

Άλλος τίτλος

Δομικές μελέτες της M.BseCI μεθυλτρανσφεράσης από το Geobacillus stearothermophilus

Συγγραφέας

Μήτσικας, Δημήτριος Α.

Σύμβουλος διατριβής

Κοκκινίδης, Μιχαήλ

Μέλος κριτικής επιτροπής

Αθανασάκη, Ειρήνη
Παυλίδης, Ιωάννης

Περίληψη

Η DNA µεθυλτρανσφεράση BseCI (M.BseCI) απο το βακτήριο Geobacillus stearothermophilus, είναι µια µεθυλτρανσφεράση αδενίνης, η οποία σχετίζεται µε µια περιοριστική ενδονουκλεάση. Καταλύει τη µεθυλίωση του ατόµου Ν6 της 3΄ αδενίνης στην αλληλουχία 5΄-ATCGAT-3΄ παρέχοντας, κατ’ επέκταση, έναν αµυντικό µηχανισµό έναντι µόλυνσης του βακτηρίου από βακτηριοφάγους. Αν και οι µεθυλτρανσφεράσες κυτοσίνης έχουν µελετηθεί εντατικά, οι γνώσεις µας σχετικά µε τις µεθυλτρανσφεράσες αδενίνης παραµένουν περιορισµένες. Στην εργασία αυτή περιγράφεται ο προσδιορισµός της τρισδιάστατης δοµής της M.BseCI, τόσο στη µορφή του αποενζύµου (2.5 Å), όσο και στη µορφή συµπλόκου µε το συµπαράγοντα S-αδενοσυλ-Lοµοκυστεΐνη και το DNA-στόχο σε τρεις διαφορετικές καταστάσεις µεθυλίωσης, που αντιστοιχούν στο φυσικό υπόστρωµα (2.4 Å), στο τελικό προϊόν της αντίδρασης της µεθυλίωσης (2.6 Å), και στη µη µεθυλιωµνη κατάσταση (2.3 Å). Όπως και οι υπόλοιπες µεθυλτρανσφεράσες, το ένζυµο αποτελείται από δύο διακριτές επικράτειες και περιέχει το χαρακτηριστικό µοτίβο µεθυλάσης, παρά την έλλειψη οµολογίας στην αλληλουχία της µε άλλα ένζυµα της ίδιας οικογένειας. Παραδόξως, παρατηρούνται εκτεταµένες δοµικές οµοιότητες και στην περιοχή αναγνώρισης του DNA σε σχέση µε άλλες λυµένες Ν6-µεθυλτρανσφεράσες, υποδηλώνοντας πως η συγκεκριµένη οµάδα ενζύµων ίσως να είναι πιο οµοιογενής απ’ ότι αναµενόταν. Τα αποτελέσµατα της δουλειάς αυτής, πέρα από την προσθήκη µιας ακόµα µεθυλτρανσφεράσης στην ήδη υπάρχουσα βιβλιογραφία, παρέχουν περαιτέρω πληροφορίες σχετικά µε τη δοµική βάση της Ν6-µεθυλίωσης και δίνουν την ευκαιρία για συγκριτική µελέτη µε άλλες ήδη πάρχουσες µεθυλτρανσφεράσες.

Φυσική περιγραφή

48 σ. : πίν., σχήμ., εικ. (μερ. εγχρ.) ; 30 εκ.

Γλώσσα

Αγγλικά

Θέμα

Adomet-dependent Mtases

Base flipping

DNA modification

N6-adenine methylation

Tupe II restriction-modification systems

Απόσπαση βάσης

Μεθυλάσες τύπου ΙΙ