|
|
| Κωδικός Πόρου |
000444154 |
| Τίτλος |
Cancer as an evolutionary process : Identification and Modeling of driver mutations using computational simulations |
| Άλλος τίτλος |
Μελέτη του καρκίνου από εξελικτική σκοπιά |
|
Συγγραφέας
|
Δασκαλάκη, Μαρία-Όλγα
|
|
Σύμβουλος διατριβής
|
Παυλίδης, Παύλος
Καραλή, Γεωργία
Χαρμανδάρης , Βαγγέλης
|
| Περίληψη |
Από εξελικτική σκοπιά ο καρκίνος μπορεί α θεωρηθεί ως αποτέλεσμα της φυσικής επιλογής στο σώμα μας. Τα κύτταρα μπορούν να γίνουν αντιληπτά ως πληθυσμοί ατόμων με έναν συνεχή κύκλο ωρίμανσης, αναπαραγωγής, μετάλλαξης και τελικά θανάτου. Υπό κάποια πιθανότητα μία μετάλλαξη με λειτουργικό αντίκτυπο σε επίπεδο πρωτεινών, θα
μπορούσε να προσδώσει στο κύτταρο που τη φέρει πλεονέκτημα αναπαραγωγής οδηγώντας στον ανεξέλεγκτο πολλαπλασιασμό του προκαλώντας την εγκαθίδρυση του
στον ιστό και τη δημιουργία επιθετικών όγκων. Οι υπεύθυνες για τον ανεξέλεγκτο πολλαπλασσιαμό μεταλλάξεις ονομάζονται driver. Η ανίχνευση driver μεταλλάξεων θα μπορούσε να οδηγήσει σε ανάπτυξη στοχευμένων θεραπειών συμβάλλοντας τόσο στην πρόληψη όσο και στην αύξηση των πιθανοτήτων επιβίωσης ενός ασθενούς. Γι' αυτό το λόγο, σε αυτή την εργασία δημιουργήσαμε ενα προσομοιωτή του κυτταρικού κύκλου, βασισμένο στο πληθυσμιακό μοντέλο γενετικής ποικιλομοφίας Wright-Fisher. Το μοντέλο Wright-Fisher επεκτάθηκε μέσω της χρήσης κυτταρικών αυτομάτων και διαφορετικών συναρτήσεων της ικανότητας αναπαραγωγής του κυττάρου ως ένα μέσα αναπαράστασης των περιβαλλοντικών πιέσεων που επίσης επηρεάζουν τον κυτταρικό κύκλο και κατά συνέπεια την πιθανότητα εγκαθίδρυσης ή εξαφάνισής του. Τα αποτελέσματα της προσομοίωσης αναλύθηκαν χρησιμοποιώντας μεθόδους τόσο στατιστικής όσο και μηχανικής μάθησης προκειμένου να μελετηθεί ο καρκίνος από εξελικτική σκοπιά υπολογίζωντας μετρικά εγκαθίδρυσης, απαιτούμενου χρόνου για έναν γονότυπο ώστε να καταλάβει τον ιστό, ανταγωνισμό και μέγεθος του όγκος, με απώτερο στόχο το συνδυασμό των παραπάνω για την κατασκευή της τροχιάς κάθε μετάλλαξης του γονιδιώματος στον εξελικτικό χρόνο, χαρακτηριστικό το οποίο θα μπορούσε να είναι ο κύριος παράγοντας διαχωρισμού μεταξύ driver και passenger μεταλλάξεων.
|
| Φυσική περιγραφή |
64 σ. : πίν. σχήμ. ; 30 εκ. |
| Γλώσσα |
Αγγλικά |
| Θέμα |
Fixation |
|
Passenger |
|
Probabilities |
|
Μεταλλάξεις |
|
Πιθανότητες |
| Ημερομηνία έκδοσης |
2021-12-01 |
| Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Ιατρική Σχολή--Τμήμα Ιατρικής--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
|
|
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
| Εμφανίσεις |
298 |
Cancer as an evolutionary process : Identification and Modeling of driver mutations using computational simulations
