|
Κωδικός Πόρου |
uch.biology.phd//2001ladoukakis |
Τίτλος |
Ο Ομόλογος ανασυνδυασμός στο μιτοχονδριακό DNA των ζώων |
Άλλος τίτλος |
Homologous recombination in animal mitochondrial DNA |
Συγγραφέας
|
Λαδουκάκης, Εμμανουήλ
|
Σύμβουλος διατριβής
|
Ζούρος, Ελευθέριος
|
Περίληψη |
Η παρούσα διατριβή βάλλει κατά της εδραιωμένης άποψης ότι το mtDNA των ζώων δεν ανασυνδυάζεται. Η άποψη αυτή βασίστηκε σε έμμεσες παρατηρήσεις, όπως στο γεγονός ότι δεν είχαν ανιχνευθεί ποτέ ανασυνδυασμένα μόρια mtDNA και δεν βρέθηκαν προϊόντα ανασυνδυασμένου mtDNA σε υβρίδια καλλιεργούμενων σωματικών κυττάρων. Παρουσιάζονται στοιχεία για την ύπαρξη ανασυνδυασμού στο mtDNA των ζώων από δύο διαφορετικές πηγές: δεδομένα από αλληλουχίες που βρέθηκαν στις γονάδες αρσενικών ατόμων μυδιών και δεδομένα που ανακτήθηκαν από ήδη δημοσιευμένες αλληλουχίες. α) Τα αρσενικά άτομα του μυδιού κληρονομούν ένα τύπο mtDNA από τη μητέρα τους (F γονιδίωμα) και ένα από τον πατέρα τους (Μ γονιδίωμα). Στην πλειονότητα των περιπτώσεων τα δύο μόρια διαφέρουν κατά περισσότερο από 20% στη νουκλεοτιδική τους αλληλουχία, όμως υπάρχουν εξαιρέσεις που το πατρικό μιτοχονδριακό γονιδίωμα μπορεί να διαφέρει ελάχιστα από το μητρικό. Εξετάσαμε αρσενικά άτομα από την τελευταία κατηγορία και βρήκαμε ανασυνδυασμένες αλληλουχίες σε τέσσερα από τα δέκα άτομα. Οι ιστοί της γονάδας αυτών των ατόμων ήταν πολυπλασμικοί και όχι διπλασμικοί κυρίως εξαιτίας του ανασυνδυασμού. Μέσα στο κομμάτι των 681 bp από το γονίδιο της κυτοχρωμικής οξειδάσης ΙΙΙ (COIII), το μήκος των τμημάτων που είχαν ανταλλαχθεί μέσω του ανασυνδυασμού κυμαίνονταν από 24 έως 255 bp (ή και περισσότερο). Η πιθανότητα τα ανασυνδυασμένα αυτά μόρια να οφείλονται σε λάθος της μεθόδου αποκλείστηκε από δύο ανεξάρτητα πειράματα κατά τα οποία i) η DNA πολυμεράση δεν μπόρεσε να παράγει ανασυνδυασμένα μόρια in vitro όταν της δόθηκαν ως μήτρα, κλωνοποιημένες οι πατρικές αλληλουχίες και ii) με ειδικά σχεδιασμένους εκκινητές ανακτήθηκαν οι ανασυνδυασμένες αλληλουχίες από το DNA της γονάδας. Η κλωνοποίηση προϊόντων PCR από τυπικά αρσενικά έδειξε ότι μπορεί να συμβαίνει ανασυνδυασμός μεταξύ M και F μορίων mtDNA. Επίσης συμβαίνει όχι μόνο στη COIII αλλά και σε άλλες περιοχές του mtDNA. β) Διενεργήθηκε μια μη-συστηματική έρευνα στη βιβλιογραφία για να βρεθούν στοιχεία για "ιστορικό ανασυνδυασμό". Πρώτα μετατράπηκαν οι νουκλεοτιδικές αλληλουχίες σε αμινοξικές με το σκεπτικό ότι το "σήμα" του ανασυνδυασμού θα είναι περισσότερο εμφανές στα αμινοξέα από ότι στα νουκλεοτίδια. Ανακαλύφθηκαν τρεις περιπτώσεις (μια στο καρκινοειδές Gammarus fossarum, στο γένος του αμφιβίου Rana, και στο γένος του θηλαστικού Apodemus) στις οποίες οι συγκρίσεις των αμινοξικών αλληλουχιών υποδείκνυαν την ύπαρξη ανασυνδυασμού. Στη συνέχεια επιστρέψαμε στις νουκλεοτιδικές αλληλουχίες και εξετάσαμε αν οι ομοιότητες μεταξύ των πιθανών ανασυνδυασμένων τμημάτων μπορούν να εξηγηθούν από τυχαία γεγονότα. Αυτή η πιθανότητα είναι εξαιρετικά μικρή.
|
Φυσική περιγραφή |
175 σ. : εικ. ; 30 εκ. |
Γλώσσα |
Ελληνικά |
Θέμα |
Ανασυνδυασμός; DNA, Μιτοχονδριακό (M+DNA); Ετεροπλασμία; Κλώνος; Ζώα; Γονιδιακή μετατροπή |
Ημερομηνία έκδοσης |
2001-06-21 |
Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Βιολογίας--Διδακτορικές διατριβές
|
|
Τύπος Εργασίας--Διδακτορικές διατριβές
|
Εμφανίσεις |
352 |