E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Chromatin conformation and chromosomal organization during the activation of T-cells

Αρχική Chromatin conformation and chromosomal organization during the activation of T-cells

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000426384

Τίτλος

Chromatin conformation and chromosomal organization during the activation of T-cells

Άλλος τίτλος

Μελέτη της χρωματινικής διαμόρφωσης και της χρωμοσωμικής οργάνωσης κατά την ενεργοποίηση Τ-λεμφοκυττάρων

Συγγραφέας

Κλωνιζάκης, Αντώνιος Μ.

Σύμβουλος διατριβής

Νικολάου, Χριστόφορος

Μέλος κριτικής επιτροπής

Σπηλιανάκης, Χαράλαμπος
Τζαμαρίας, Δημήτριος

Περίληψη

Η γονιδιακή ρύθμιση και έκφραση αποτελούν κρίσιμες διαδικασίες που ελέγχουν όλες τις πτυχές της ζωής των ευκαρυωτών. Η τρισδιάστατη δομή του γονιδιώματος αποτελεί πλέον ένα επιπρόσθετο επίπεδο ρύθμισης της έκφρασης γονιδίων, μέσω μηχανισμών που δεν είναι ακόμα καλά μελετημένοι. Στην παρούσα εργασία, μελετήθηκε ο ρόλος της πρωτεΐνης SATB1 σε κύτταρα ποντικού. Το γονίδιο Satb1 εκφράζεται σε συγκεκριμένους κυτταρικούς τύπους, όπως τα διπλά θετικά Τ-κύτταρα του θύμου αδένα. H πρωτεΐνη αυτή έχει συσχετισθεί με την δημιουργία “λουπών’’ και άλλων τρισδιάστατων χρωματινικών δομών, οι οποίες ρυθμίζουν την έκφραση συγκεκριμένων γονιδίων. Χρησιμοποιώντας μια διαγονιδιακή σειρά ποντικών, από την οποία απουσιάζει το γονίδιο της Satb1 στα κύτταρα του θύμου αδένα, δείχνουμε πώς τα ζώα αυτά αναπτύσσουν αυτοανοσία. Με τη χρήση πειραμάτων αλληλούχισης νέας γενιάς, γίνεται μια ενδελεχής μελέτη του μοριακού προφίλ των θυμοκυττάρων σε ποντίκια που έχουν απωλέσει το γονίδιο. Παρατηρούμε εκτεταμένες αλλαγές στην έκφραση γονιδίων, στην προσβασιμότητα της χρωματινής, στα επίπεδα μεθυλίωσης του DNA, αλλά και στις τρισδιάστατες αλληλεπιδράσεις μεταξύ πολλών περιοχών του γονιδιώματος. Προτείνουμε ένα μοντέλο, σύμφωνα με το οποίο, η απώλεια του γονιδίου της Satb1 οδηγεί σε διακοπή της διαφοροποίησης των Τ-λεμφοκυττάρων και στο σταδιακό εκφυλισμό των επιθηλιακών κυττάρων του θύμου εξαιτίας της δυσλειτουργικής κυτταρικής επικοινωνίας μεταξύ των Τ-κυττάρων και των επιθηλιακών κυττάρων αυτών. Τα παραπάνω φαινόμενα εξηγούν μερικώς την ανάπτυξη αυτοανοσίας σε περίπτωση απώλειας του γονιδίου.

Φυσική περιγραφή

95 σ. : σχεδ., πίν., εικ. (μερ.εγχρ.) ; 30 εκ.

Γλώσσα

Αγγλικά

Θέμα

3D genome organization

Autoimmunity

Gene expression

Gene regulation

Αυτοανοσία

Γονιδιακή έκφραση

Γονιδιακή ρύθμιση