|
|
| Κωδικός Πόρου |
000453897 |
| Τίτλος |
Διερεύνηση μολυσματικών πρωτεϊνών φυτικών παθογόνων μέσω δομικών και λειτουργικών προσεγγίσεων |
| Άλλος τίτλος |
Investigating plant pathogens' virulence proteins through structural and functional approaches |
|
Συγγραφέας
|
Κωτσαρίδης, Κωνσταντίνος Ι
|
|
Σύμβουλος διατριβής
|
Σαρρής, Παναγιώτης
|
|
Μέλος κριτικής επιτροπής
|
Καλαντίδης, Κρίτων
Μόσχου, Παναγιώτης
Κοτζαμπάσης, Κυριάκος
Χατζηνικολάου, Δημήτριος
Τραντάς, Εμμανουήλ
Παυλίδης, Ιωάννης
|
| Περίληψη |
Οι μοριακές αλληλεπιδράσεις φυτών-μικροβίων είναι ένα σημαντικό ερευνητικό
πεδίο, η κατανόηση του οποίου μπορεί να οδηγήσει τόσο στο σχεδιασμό πιο
επιτυχημένων νέων στρατηγικών για μια βιώσιμη παραγωγή τροφίμων, όσο και στην
κατανόηση των βασικών βιολογικών μηχανισμών που καθορίζουν τις
αλληλεπιδράσεις αυτές σε μοριακό επίπεδο. Ωστόσο, η δομική προσέγγιση των
μοριακών αλληλεπιδράσεων πρωτεΐνης-πρωτεΐνης, μεταξύ ενός παθογόνου και των
στόχων του στον ξενιστή, δεν έχει μελετηθεί σε μεγάλος βάθος από την επιστημονική
κοινότητα. Η σημαντική πρόοδος που έχει επιτευχθεί τα τελευταία χρόνια λόγω της
ραγδαίας ανάπτυξης προγραμμάτων τεχνητής νοημοσύνης, τα οποία είναι ικανά να
προβλέπουν την τριτοταγή δομή μιας πρωτεΐνης και ως αποτέλεσμα, την περαιτέρω
εμβάθυνση και δημιουργία υποθέσεων σχετικά με τον λειτουργικό χαρακτηρισμό των
πρωτεϊνών, μπορεί να βοηθήσει αλλάζοντας δραματικά τους τρόπους προσέγγισης
και μελέτης στο πεδίο αυτό.
Ο γενικότερος συλλογισμός και πειραματικός σχεδιασμός της παρούσας διατριβής
παρουσιάζεται στο πρώτο Κεφάλαιο: «Εισαγωγή», όπου περιγράφεται η βασική
θεωρία για τη συντήρηση των πρωτεϊνικών δομών των τελεστών που έχουν όμοιες
λειτουργίες εντός του κυττάρου του ξενιστή, ενώ γίνεται μια πρώτη εφαρμογή των
προγραμμάτων υπολογισμού τριτοταγούς δομής πρωτεϊνών, και συσχέτισης της με τη
λειτουργία πιθανών μολυσματικών πρωτεϊνικών παραγόντων και την ικανότητα τους
να επάγουν προγραμματισμένο κυτταρικό θάνατο από δύο στελέχη (Temecula1,
CoDiRo) και ένα υποείδος (Sandyi Ann-1) του φυτικού παθογόνου καραντίνας
Xylella fastidiosa.
Επιπροσθέτως, στην παρούσα διδακτορική διατριβή, παρουσιάζονται τα
αποτελέσματα από τις δομικές αναλύσεις και λειτουργικούς χαρακτηρισμούς των
τελεστών του εκκριτικού συστήματος τύπου-ΙΙΙ (type III secretion system – T3SS),
XopP και RipE1 των παθογόνων Xanthomonas campestris pv. campestris και
Ralstonia solanacearum αντίστοιχα, ως προς την επίδραση τους στην υπομονάδα
Exo70B1 του συμπλόκου εξωκύττωσης του φυτού ξενιστή Arabidopsis thaliana. Ο
τελεστής XopP, όπως προκύπτει από τις in vivo και in vitro αναλύσεις, παρουσιάζει
λειτουργία κινάσης, ενώ ο τελεστής RipE1, ο οποίος είχε προηγουμένως
χαρακτηρισθεί ως πρωτεάση κυστεΐνης, έχει την ικανότητα να διασπά την πρωτεΐνη
Exo70B1 in vitro.
|
| Φυσική περιγραφή |
156 σ. : πίν., σχήμ., εικ. (μερ. εγχρ.) ; 30 εκ. |
| Γλώσσα |
Ελληνικά |
| Θέμα |
Exo70B1 subunit |
|
Exocyst complex |
|
Functional characterization |
|
In silico prediction of tertiary structure |
|
In silico υπολογισμός τριτοταγής δομή |
|
Type 3 secretion system effectors |
|
Λειτουργικός χαρακτηρισμός |
|
Σύμπλοκο εξωκύττωσης |
|
Τελεστές εκκριτικού συστήματος 3 |
|
Υπομονάδα Exo70B1α |
| Ημερομηνία έκδοσης |
2023-02-22 |
| Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Βιολογίας--Διδακτορικές διατριβές
|
|
|
Τύπος Εργασίας--Διδακτορικές διατριβές
|
| Εμφανίσεις |
42 |
Διερεύνηση μολυσματικών πρωτεϊνών φυτικών παθογόνων μέσω δομικών και λειτουργικών προσεγγίσεων
