E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Design and method development of palaeoproteomics analysis in modern and ancient human bones

Αρχική Design and method development of palaeoproteomics analysis in modern and ancient human bones

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000434274

Τίτλος

Design and method development of palaeoproteomics analysis in modern and ancient human bones

Άλλος τίτλος

Σχεδιασμός και ανάπτυξη μεθοδολογίας παλαιοπρωτεϊνωματικής ανάλυσης μοντέρνων και αρχαίων ανθρώπινων οστών

Συγγραφέας

Τσιμινικάκη, Κωνσταντίνα Ι.

Σύμβουλος διατριβής

Κοκκινίδης, Μιχαήλ

Μέλος κριτικής επιτροπής

Αϊβαλιώτης, Μιχαήλ
Περγαντής, Σπυρίδων

Περίληψη

Η πρωτεϊνωματική ανάλυση βασισμένη στη φασματομετρία μάζας (MS) είναι ένας ευρέως γνωστός επιστημονικός τομέας, που περιλαμβάνει τη μεγάλης κλίμακας διερεύνηση της δομής και της λειτουργίας ενός ευρέος φάσματος πρωτεϊνών και των μετα-μεταφραστικών τροποποιήσεών τους. Η πρωτεϊνωματική ανάλυση που βασίζεται σε φασματομετρία μάζας επιτρέπει τη μελέτη πεδίων παλαιοανθρωπολογίας, βιο-αρχαιολογίας, αρχαιολογίας και εγκληματολογικών επιστημών γενικότερα. Προσφέρει πολύτιμες πληροφορίες για τις αρχαίες πρωτεΐνες, τις πρωτεϊνικές οδούς και τις μετα-μεταφραστικές τροποποιήσεις τους, σε αντίθεση με τις κοινές τεχνικές ανθρωπολογίας ή την ανάλυση αρχαίου DNA. Η παλαιοπρωτεϊνωματική ανάλυση έχει προσφέρει μια ποικιλία πρωτοκόλλων σε διαφορετικά είδη δειγμάτων, όπως αντικείμενα τέχνης, δόντια και οστά διαφόρων οργανισμών, προκειμένου να απαντηθούν εξελικτικές ή διατροφικές ερωτήσεις, για εκτίμηση φύλου καθώς και για χρονολόγηση. Ο στόχος της παρούσας μελέτης είναι να σχεδιάσει και να αναπτύξει μια μεθοδολογία παλαιοπρωτεϊνωματικής ανάλυσης βασισμένη σε MS για τη μελέτη σύγχρονων και αρχαίων ανθρώπινων δειγμάτων, ειδικά οστών. Χρησιμοποιήθηκαν συνολικά 9 κλασματοποιημένα δείγματα, 8 σχετικά σύγχρονα και ένα αρχαίο δείγμα. Η επιλογή και προετοιμασία του δείγματος, η πέψη, η αφαλάτωση και η ανάλυση υγρής χρωματογραφίας νανοροής υψηλής απόδοσης συζευγμένη με διαδοχική φασματομετρία μάζας (nLC-MS/MS) πραγματοποιήθηκαν με βάση ένα ήδη καθιερωμένο πρωτόκολλο με σημαντικές τροποποιήσεις. Η παρούσα μελέτη ήταν επιτυχής στην εξαγωγή, την πέψη, τη συγκέντρωση και την ταυτοποίηση πρωτεϊνών από σύγχρονα και αρχαία ανθρώπινα δείγματα, καθώς και στον εντοπισμό μοναδικών πρωτεϊνών. Είναι απαραίτητο να προχωρήσουμε σε μια περαιτέρω βιοπληροφορική ανάλυση, συμπεριλαμβανομένων άλλων πρωτεϊνωμάτων από βακτήρια ή μύκητες, προκειμένου να εντοπιστεί κάποια πιθανή επιμόλυνση. Επιπλέον, υπάρχει η ανάγκη επέκτασης του αριθμού δειγμάτων και είναι σημαντικό να σχεδιάσουμε μια τυπική μεθοδολογία δειγματοληψίας και καθαρισμού.

Φυσική περιγραφή

28 φύλλα : πίν., σχήμ., εικ. ; 30 εκ.

Γλώσσα

Αγγλικά

Θέμα

Ancient proteins

Human bones

nLC-MS/MS

Ανθρώπινα οστά

Αρχαίες πρωτεΐνες

Ημερομηνία έκδοσης

2020-11-27