Your browser does not support JavaScript!

Αρχική    Φυλογεωγραφική μελέτη της κόκκινης γαρίδας (Aristaeomorpha foliacea) στη Μεσόγειο θάλασσα  

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

Προσθήκη στο καλάθι
[Προσθήκη στο καλάθι]
Κωδικός Πόρου 000440938
Τίτλος Φυλογεωγραφική μελέτη της κόκκινης γαρίδας (Aristaeomorpha foliacea) στη Μεσόγειο θάλασσα
Άλλος τίτλος Phylogeographic study of Aristaeomorpha foliacea in the Mediterranean sea
Συγγραφέας Τερζόγλου, Βασιλική Κ.
Σύμβουλος διατριβής Τσιγγενόπουλος, Κωνσταντίνος
Μέλος κριτικής επιτροπής Μανουσάκη, Τερέζα
Λαδουκάκης, Εμμανουήλ
Περίληψη Η μεγάλη κόκκινη γαρίδα Aristaeomorpha foliacea (Risso, 1827) είναι ένα κοσμοπολίτικο βενθοπελαγικό είδος γαρίδας το οποίο κατανέμεται μεταξύ άλλων στη Μεσόγειο, στην Καραϊβική, στη Ν. Αφρική, στην Ιαπωνία και στην Ωκεανία. Απαντάται σε βάθη από 120 έως 1300μ, με μέγιστη αφθονία στα 500 με 800μ και είναι από τα πιο σημαντικά εμπορικά είδη στη Μεσόγειο, όπου η παρουσία του εμφανίζει διαβάθμιση σε σχέση με το γεωγραφικό μήκος. Αλιεύεται συστηματικά στην κεντρική και ανατολική Μεσόγειο, ενώ στη δυτική πλευρά η αφθονία του είναι πλέον σημαντικά μειωμένη. Η πληροφορία για τη γενετική ποικιλότητα του είδους είναι περιορισμένη. Οι διαθέσιμες γενετικές μελέτες έχουν γίνει με χρήση μικρού αριθμού α) πληθυσμών, β) σημείων δειγματοληψίας και γ) δεικτών (πυρηνικού και μιτοχονδριακού DNA) και δεν έχουν εντοπίσει πρότυπα διαφοροποίησης μεταξύ των πληθυσμών του εντός της Μεσογείου. Στα πλαίσια ενός ευρωπαϊκού προγράμματος το οποίο στοχεύει στην οριοθέτηση των ιχθυοαποθεμάτων 6 εμπορικών ειδών στη Μεσόγειο, συλλέχθηκαν 1.700 περίπου δείγματα από 32 πληθυσμούς που καλύπτουν τις περισσότερες περιοχές εξάπλωσης του Α. foliacea στη Μεσόγειο. Ως μοριακοί δείκτες για τις αναλύσεις πληθυσμιακής γενωμικής, χρησιμοποιήθηκαν σημειακοί νουκλεοτιδικοί πολυμορφισμοί (Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs) που εντοπίστηκαν με τη μεθοδολογική προσέγγιση αλληλούχησης «double-digest Restriction site Associated DNA (ddRADseq)». Με τη μέθοδο αυτή κατασκευάστηκαν αρχικά βιβλιοθήκες χαμηλής αντιπροσώπευσης του γονιδιώματος με τη χρήση περιοριστικών ενζύμων, που στη συνέχεια αλληλουχήθηκαν. Ο μεγάλος όγκος γενετικών δεδομένων που προέκυψαν, αναλύθηκε με λογισμικά βιοπληροφορικής για την εξαγωγή συμπερασμάτων για τις σχέσεις μεταξύ των πληθυσμών. Τα αποτελέσματα των αναλύσεων έδειξαν έλλειψη γενετικής δομής μεταξύ των πληθυσμών του Α. foliacea στη Μεσόγειο και δεν απέδειξαν την ύπαρξη γεωγραφικών ή ωκεανογραφικών ασυνεχειών που θα μπορούσαν να εμποδίζουν τη γονιδιακή ροή. Πιο συγκεκριμένα, παρατηρήθηκαν χαμηλές τιμές ετεροζυγωτίας, ειδικά σε πληθυσμούς με λίγα άτομα στην ανάλυση. Οι τιμές Fst ανά ζεύγη πληθυσμών ήταν χαμηλές και στατιστικά μη σημαντικές ακόμη κι όταν συγχωνεύτηκαν πληθυσμοί με λίγα άτομα, ώστε να γίνει η ανάλυση πιο στατιστικά ισχυρή. Τέλος, οι αναλύσεις που έγιναν για την εκτίμηση της πληθυσμιακής δομής (χρήση λογισμικών DAPC, STRUCTURE) έδειξαν την ύπαρξη πιθανότατα ενός ενιαίου παμμικτικού πληθυσμού για το είδος στη Μεσόγειο, ενώ η AMOVA έδειξε χαμηλή αλλά στατιστικά σημαντική τιμή FCT = 0,2%, όταν ομαδοποιήθηκαν οι πληθυσμοί σε 3 ομάδες που αντιστοιχούν στη Δυτική, την Κεντρική και την Ανατολική Μεσόγειο. Τα παραπάνω αποτυπώνουν την υψηλή συνδεσιμότητα που υπάρχει μεταξύ των πληθυσμών της κόκκινης γαρίδας στη Μεσόγειο με πιθανότερη εξήγηση για αυτό, τη σημαντική ικανότητα διασποράς τόσο κατά τα προνυμφικά στάδια, όσο και κατά την ενήλικη ζωή του είδους. Τέλος, έγινε συζήτηση για τη σημασία της παραγωγής ποιοτικών συνόλων δεδομένων στα οποία να μπορούν να βασιστούν οι συγκεκριμένες αναλύσεις και τα πιθανά προβλήματα που μπορεί να ανακύψουν σε αυτές.
Φυσική περιγραφή [82 σ.] : πίν., σχήμ., εικ. ; 30 εκ.
Γλώσσα Ελληνικά
Θέμα Larval dispersal
SNPs
ddRADseq
Προνυμφική διασπορά
Ημερομηνία έκδοσης 2021-07-30
Συλλογή   Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Βιολογίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
  Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
Εμφανίσεις 22

Ψηφιακά τεκμήρια
No preview available

Δεν έχετε δικαιώματα για να δείτε το έγγραφο.
Δεν θα είναι διαθέσιμο έως: 2024-07-30