Διδακτορικές διατριβές
Τρέχουσα Εγγραφή: 267 από 337
|
|
| Κωδικός Πόρου |
uch.biology.phd//2000maniataki |
| Τίτλος |
Αλληλεπιδράσεις των ιοειδών με ξενιστές: Δύο προσεγγίσεις |
| Άλλος τίτλος |
Interactions of viroids with hosts: two approaches |
|
Συγγραφέας
|
Μανιατάκη, Ελισάβετ
|
|
Σύμβουλος διατριβής
|
Αλεξανδράκη, Δέσποινα
|
| Περίληψη |
Στην παρούσα διατριβή, προσεγγίζεται το ζήτημα της αλληλεπίδρασης των ιοειδών με τους ξενιστές τους. Πρόκειται για δύο προσεγγίσεις από άλλη πλευρά και σε διαφορετικό επίπεδο, οι οποίες παρουσιάζονται ξεχωριστά στο Πρώτο και στο Δεύτερο μέρος της διατριβής, μετά από μια κοινή Εισαγωγή. Αφορούν κατά κύριο λόγο το ιοειδές των ατρακτοειδών κονδύλων της πατάτας (Potato Spindle Tuber Viroid, PSTVd). Στο Πρώτο μέρος παρουσιάζεται μια μελέτη της αλληλεπίδρασης του RNA των ιοειδών με την πρωτείνη Χ1 της τοματιάς, την πρώτη πρωτείνη ξενιστή που γίνεται γνωστό ότι προσδένεται ειδικά σε ιοειδή. Στο Κεφάλαιο 1 διαπιστώνεται με το Σύστημα των τριών Υβριδίων η in vivo πρόσδεsh της πρωτείνης Χ1 στο RNA του ιοειδούς PSTVd. Στο Κεφάλαιο 2, το ίδιο σύστημα χρησιμοποιείται για τον εντοπισμό της περιοχής του PSTVd στην οποία προσδένεται η Χ1. Ο εντοπισμός γίνεται και για ένα ακόμη ιοειδές, το HSVd. Κατόπιν σύγκρισης των δύο περιοχών πρόσδεσης, διακρίινονται τα κοινά στοιχεία πρωτοταγούς και δευτεροταγούς δομής του RNA τα οποία τις χαρακτηρίζουν. ΄Ενα πεντανουκλεοτίδιο, το CCUUC, εμφανίζεται κατά επανάληψη μόνο στις περιοχές των ιοειδών που αναγνωρίζονται από την Χ1. Στο Κεφάλαιο 3, με βάση τις προηγούμενες παρατηρήσεις, σχεδιάζεται επιτυχώς μια ελάχιστη θέση πρόσδεσης της πρωτείνης, το R34 RNA. Εκτός από το R34 του άγριου τύπου κατασκευάζονται επιπλέον τρία μεταλλάγματα και ελέγχεται το κατά πόσον αναγνωρίζονται από την πρωτείνη Χ1 in vivo και in vitro. Η ιεράρχηση των τεσσάρων ποικιλόμορφων, με βάση την ισχύ της αλληλεπίδρασης τους με την πρωτείνη, ανευρίσκεται να συμπίπτει με την προϋπάρχουσα λειτουργική τους ιεράρχηση, που είχε βασιστεί στην ικανότητα τους να διασκορπίζονται στην τοματιά. Το εύρημα αυτό προσανατολίζει την μελλοντική αναζήτηση της λειτουργίας της πρωτείνης Χ1 στο πεδίο της διακυτταρικής μετακίνησης του RNA. Στο Δεύτερο μέρος διερευνάται η δυνατότητα να διευρυνθεί το εύρος ξενιστών ενός ιοειδούς ώστε να συμπεριλάβει τους σακχαρομύκητες. Δύο είδη σακχαρομύκητα, Schizosaccharomyces pombe και Saccharomyces cerevisiae, μετασχηματίζονται με πλασμιδιακές κατασκευές που περιέχουν το cDNA του ιοειδούς PSTVd. Σε εκχυλίσματα από τα μετασχηματισμένα στελέχη πραγματοποιείται ανάλυση του RNA, προκειμένου να διαπιστωθεί αν εμφανίζονται μορφές του PSTVd RNA ενδεικτικές για τον πολλαπλασιασμό του ιοειδούς. Οι δοκιμές επεκτάθηκαν σε διαφορετικά στελέχη Saccharomyces cerevisiae και με διαφορετικές πλασμιδιακές κατασκευές (Κεφάλαιο 1). Εφόσον δεν παρατηρήθηκε πολλαπλασιασμός του ιοειδούς, αναζητήθηκαν συνθήκες που ενδεχομένως θα διευκόλυναν την γένεση και την διάδοση στον Saccharomyces cerevisiae γενετικά προσαρμοσμένων ποικιλόμορφων του PSTVd (Κεφάλαιο 2). Πρώτα αυξήθηκε η διάρκεια της καλλιέργειας ενώ στη συνέχεια επινοήθηκε ένα πρωτόκολλο εγγενούς αναπαραγωγής που επιτρέπει την οριζόντια μετάδοση κάποιου αναπαραγώμενου στοιχείου στον κυτταρικό πληθυσμό.
|
| Γλώσσα |
Ελληνικά |
| Θέμα |
Ιοειδή; Αλληλεπιδράσεις πρωτεϊνών-RNA; Ξενιστές; Υβρίδια; Τομάτα; Σακχαρομύκητες |
| Ημερομηνία έκδοσης |
2000-12-14 |
| Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Βιολογίας--Διδακτορικές διατριβές
|
|
|
Τύπος Εργασίας--Διδακτορικές διατριβές
|
| Μόνιμη Σύνδεση |
https://elocus.lib.uoc.gr//dlib/f/2/6/metadata-dlib-2000maniataki.tkl
|
| Εμφανίσεις |
339 |
Συλλογές
