E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης

Αρχική Συλλογές Τύπος Εργασίας Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης

Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης

Τρέχουσα Εγγραφή: 7 από 6977

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000470931

Τίτλος

Bacteria-phage interactions in the marine Antarctic environment

Άλλος τίτλος

Αλληλεπίδραση φάγων-βακτηρίων στο θαλάσσιο περιβάλλον της Ανταρκτικής

Συγγραφέας

Αχθοφορίδου, Γεωργία Δ.

Σύμβουλος διατριβής

Καθάριος, Παντελής

Μέλος κριτικής επιτροπής

Σαρρής, Παναγιώτης
Πήττα, Παρασκευή

Περίληψη

Οι βακτηριοφάγοι, ή αλλιώς φάγοι, είναι ιοί οι οποίοι μολύνουν βακτήρια και θεωρούνται οι πιο πολυπληθείς βιολογικές οντότητες στον πλανήτη. Οι φάγοι διαδραματίζουν καθοριστικό ρόλο στα θαλάσσια οικοσυστήματα, καθώς εκτιμάται ότι περίπου 20-40% των βακτηρίων στη θάλασσα υπόκεινται καθημερινά σε λύση εξαιτίας των φάγων. Με αυτόν τον τρόπο επηρεάζουν τους βιογεωχημικούς κύκλους, μεταβάλλουν τις μικροβιακές κοινότητες και ενισχύουν την ποικιλότητά τους μέσω μεταγωγής. Ο ρόλος των φάγων σε ακραία περιβάλλοντα, όπως αυτό της Ανταρκτικής, αναμένεται να είναι ακόμη πιο σημαντικός. Ωστόσο, ο Νότιος Ωκεανός παραμένει μία από τις λιγότερο μελετημένες περιοχές όσον αφορά τους ιούς. Στην μελέτη αυτή, έγινε απομόνωση και χαρακτηρισμός φάγων, καθώς και των βακτηρίων-ξενιστών τους, από το θαλάσσιο περιβάλλον της Ανταρκτικής. Εξετάστηκε η μορφολογία των φάγων με την χρήση ηλεκτρονικής μικροσκοπίας διέλευσης (TEM), προσδιορίστηκε το φάσμα των βακτηριακών ξενιστών και έγινε η ταυτοποίησή τους, αξιολογήθηκε η λυτική δράση των φάγων και η αλληλεπίδρασή τους με τα βακτήρια-ξενιστές σε διαφορετικές θερμοκρασίες και τέλος, πραγματοποιήθηκαν αναλύσεις των γονιδιωμάτων των φάγων αλλά και των ξενιστών τους καθώς και φυλογενετικές αναλύσεις. Η παρούσα μελέτη είναι η πρώτη που αφορά την απομόνωση και τον χαρακτηρισμό φάγων από το θαλάσσιο περιβάλλον της Ανταρκτικής. Συγκεκριμένα, απομονώθηκαν πέντε διακριτοί φάγοι οι οποίοι ανήκουν σε διαφορετικούς μορφότυπους (Myovirus, Siphovirus και Podovirus), ενώ δύο από αυτούς ταυτοποιήθηκαν ως ήπιοι φάγοι. Το φάσμα των ξενιστών ποικίλει ανάλογα τον φάγο, από εξαιρετικά ειδικό σε πολύ ευρύ. Οι πιο άφθονοι ξενιστές ανήκουν στα είδη Pseudoalteromonas sp. και Psychrobacter sp. Όσον αφορά το πείραμα των θερμοκρασιών, η υψηλή θερμοκρασία επηρέασε αρνητικά τη λυτική ικανότητα ενός φάγου, ενώ οι υπόλοιποι δεν επηρεάστηκαν. Η γονιδιωματική ανάλυση των βακτηριακών ξενιστών αποκάλυψε γονίδια που σχετίζονται με την προσαρμογή τους σε κρύα περιβάλλοντα, ενώ επιπλέον αποκαλύφθηκε η παρουσία ενός προφάγου μέσα στο γονιδίωμα ενός ξενιστή. Τα ευρήματα αυτά παρέχουν σημαντικές πληροφορίες για την περαιτέρω κατανόηση των μικροβιακών κοινοτήτων και της αλληλεπίδρασης μεταξύ φάγων και βακτηρίων σε πολικά περιβάλλοντα, ωστόσο απαιτείται περαιτέρω έρευνα.

Φυσική περιγραφή

49 σ. : πίν., σχήμ., εικ. ; 30 εκ.

Γλώσσα

Αγγλικά

Θέμα

Antarctica

Bacteriophages

Marine microbial ecology

Phage-host interactions

Αλληλεπιδράσεις φάγων-ξενιστών

Βακτήρια

Βακτηριοφάγοι