Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
Εντολή Αναζήτησης : Συγγραφέας="Στεφανίδης"
Και Συγγραφέας="Κωνσταντίνος"
Τρέχουσα Εγγραφή: 4705 από 6513
|
|
| Κωδικός Πόρου |
000326715 |
| Τίτλος |
Ο ρόλος της στροφής και του μοτίβου της επτάδας στην αναδίπλωση και σταθερότητης πρωτεΐνης Rop |
|
Συγγραφέας
|
Κυριαζίδης, Γιάννης
|
|
Σύμβουλος διατριβής
|
Κοκκινίδης, Μιχάλης
|
| Περίληψη |
Η διαδικασία της πρωτεΐνικής αναδίπλωσης αποτελεί ένα από τα μεγαλύτερα προβλήματα της
σύχρονης βιολογίας. Η Rop είναι μία μικρή πρωτεΐνη που έχει χρησιμοποιηθεί εκτενέστατα για την
κατανόηση μέρους του προβλήματος της «αναδίπλωσης των πρωτεϊνών». Η βιολογική της μορφή είναι
ένα ομοδιμερές, αντιπαράJηλο, 4-α-ελικοειδές δεμάτιο και ενέχεται στο μηχανισμό ελέγχου του αριθμού
των αντιγράφων των πλασμιδίων της ColE1 οικογένειας, του E.coli. Η Rop εμφανίζει ένα
συγκεκριμένο πρότυπο υδρόφοβων και πολικών αμινοξεών, το «μοτίβο της επτάδας» σε όλο το μήκος
της αJηλουχία της, η οποία διαταράσσεται στην περιοχή της στροφής. Ο ρόλος της στροφής στη
διαδικασία της αναδίπλωσης, παρόλη την έρευνα που έχει πραγματοιποιηθεί, δεν είναι ακόμη πλήρως
κατανοητός.
Ορισμένες μελέτες προσέδιδαν στη στροφή έναν περισσότερο ενεργό ρόλο στη διαμόρφωση της
δομής, ενώ άJες δευτερεύοντα. Μία σημειακή και μόνο μετάJαξη του καταλοίπου A31 σε προλίνη,
οδήγησε σε δραματική αJαγή της διαμόρφωσης του μορίου. Το διπλό μετάJαγμα που ερευνήθηκε στην
εργασία αυτή D30GA31P δημιουργήθηκε ώστε να διαπιστωθεί εάν παρουσία της γλυκίνης, η το
μετάJαγμα RopA31P, θα μπορέσει να ακολουθήσει ένα θερμοδυναμικά σταθερότερο μονοπάτι προς
την εVενή διαμόρφωσή της και θα μπορέσει να διαφύγει από την κατάσταση εύπλαστης σφαίρας στο
οποίο είχε μεταπέσει.
Το μετάJαγμα μελετήθηκε ως προς τις φασματοσκοπικές και θερμοδυναμικές ιδιότητες και τα
αποτελέσματα έδειξαν παρόμοια συμπεριφορά προς την εVενή μορφή της πρωτεΐνης παρά αυτή του
μεταJάγματος A31P. Τα αποτελέσματα δείχνουν πως πιθανότατα το διπλό μετάJαγμα να έχει
μεταπηδήσει από την κατάσταση εύπλαστης σφαίρας σε μία πιο εVενή διαμόρφωση. Διαφαίνεται
λοιπόν πως η σύσταση της στροφής σε αμινοξέα επηρεάζει την αναδίπλωση του μορίου με το να
επιτρέπει ή να αποτρέπει πιθανά θερμοδυναμικά μονοπάτια που δύναται να ακολουθήσει το μόριο προς
την τελική του διαμόρφωση.
Επιπλέον το μετάJαγμα Rop2aL σχεδιάστηκε με στόχο την «επιδιόρθωση» του μοτίβου της
επτάδας στην περιοχή της στροφής. Σε αντίθεση με το μετάJαγμα Rop2a, το οποίο είχε δημιουργηθεί
παλαιότερα και είχε δομή παρόμοια με αυτή της αγρίου τύπου Rop, το μετάJαγμα Rop2aL, με την
αντικατάσταση της γλουταμίνης στη θέση 34 με μία λευκίνη, αποκαθιστά και το μη σωστό πρότυπο
υδροφοβικότητας της Rop2a. Η His-Rop2aL εκλούεται από τη στήλη μοριακής διήθησης σε 2
διαφορετικούς πληθυσμούς, έναν διμερή και έναν τετραμερή και φαίνεται πως απουσία αναγωγικού
ευνοείται ο σχηματισμός της τετραμερούς μορφής. Οι τετραμερείς πληθυσμοί εμφανίζουν υψηλότερη
θερμοκρασία τήξης από την αγρίου τύπου Rop, κάτι που μπορεί να οφείλεται στη δημιουργία ενός νέου
πιο εκτεταμένου υδρόφοβου πυρήνα.
ΚρύσταJοι έχουν προκύψει για την περίπτωση της RopD30GA31P και για τους τετραμερείς
πληθυσμούς της Rop2aL παρουσία και απουσία αναγωγικού. Η επίλυση της δομής θα μας δώσει
ξεκάθαρα αποτελέσματα και πληροφορία για την επίδραση των μεταJαγών αυτόν στη δομή του μορίου.
|
| Φυσική περιγραφή |
53 σ. : εικ. ; 30 εκ. |
| Γλώσσα |
Ελληνικά |
| Ημερομηνία έκδοσης |
2008-04-07 |
| Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Βιολογίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
|
|
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
| Μόνιμη Σύνδεση |
https://elocus.lib.uoc.gr//dlib/e/0/2/metadata-dlib-user1215415627-15387.tkl
|
| Εμφανίσεις |
253 |
Συλλογές
