Post-graduate theses
Current Record: 8 of 5933
|
Identifier |
000452375 |
Title |
Exosomal miRNAs as potential biomarkers of Myelodysplastic Syndromes |
Alternative Title |
Τα εξωσωμικά miRNAs ως πιθανοί βιοδείκτες των Μυελοδυσπλαστικών Συνδρόμων |
Author
|
Ντρετάκη, Αγάπη Στυλιανή
|
Thesis advisor
|
Ποντίκογλου, Χαράλαμπος
|
Reviewer
|
Παπαδάκη, Ελένη
Καλπαδάκη Χριστίνα
|
Abstract |
Background: Increasing evidence have demonstrated that exosomal microRNAs are promising noninvasive
biomarkers for various cancer types, including certain hematological malignancies.
Objective: In this specific study we aimed to optimize a protocol for exosomal miRNAs’ isolation that could be used
for the identification of potential minimally-invasive biomarkers of MDS.
Methods: Serum and Plasma samples were collected from healthy individuals, as well as MDS patients at different
therapy stages. Exosomes have been isolated from selected samples and moreover, exosome quantification and
visualization were performed, with the use of Elisa assay, Western Blot and TEM respectively. Finally, a variety of
commercial kits have been tested for the optimization of exosomal RNA isolation.
Results: Exosome quantification has proven that exosomes are isolated properly, however TEM has indicated that
besides exosomes samples might be contaminated with other EVs or cellular waste as well. Isolated RNA was in
general of poor quality and quantity both in healthy individuals and MDS patients. However, plasma was chosen as
the optimal biological fluid for exosomal RNA isolation and 200μl as the optimal volume for total RNA isolation.
Conclusions: Either a dilution step or an extra purification step should be performed for better exosome
characterization. Moreover, exosome isolation should be performed prior to sample freezing, in case sample’s
quality is interfering with exosome release.
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Ιστορικό: Αυξανόμενες ενδείξεις έχουν δείξει ότι τα εξωσωματικά microRNAs είναι πολλά υποσχόμενοι μη
επεμβατικοί βιοδείκτες για διάφορους τύπους καρκίνου, συμπεριλαμβανομένων ορισμένων αιματολογικών
κακοηθειών.
Στόχος: Στη συγκεκριμένη μελέτη στοχεύσαμε στη βελτιστοποίηση ενός πρωτοκόλλου για την απομόνωση
εξωσωματικών miRNAs που θα μπορούσαν να χρησιμοποιηθούν για την ταυτοποίηση πιθανών ελάχιστα
επεμβατικών βιοδεικτών για τα MDS.
Μέθοδοι: Συλλέχθηκαν δείγματα ορού και πλάσματος από υγιή άτομα, καθώς και από ασθενείς με MDS σε
διαφορετικά στάδια θεραπείας. Τα εξωσώματα απομονώθηκαν από επιλεγμένα δείγματα και, επιπλέον,
πραγματοποιήθηκε ποσοτικοποίηση και απεικόνιση των εξωσωμάτων με τη πραγματοποίηση δοκιμασίας Elisa,
Western Blot και TEM αντίστοιχα. Τέλος, δοκιμάστηκαν διάφορα εμπορικά kits για τη βελτιστοποίηση της
απομόνωσης εξωσωματικού RNA.
Αποτελέσματα: Η ποσοτικοποίηση των εξωσωμάτων απέδειξε ότι τα εξωσώματα απομονώνονται σωστά, ωστόσο
η TEM έδειξε ότι εκτός από εξωσώματα τα δείγματα μπορεί να είναι μολυσμένα και με άλλα EVs ή κυτταρικά
απόβλητα. Το απομονωμένο RNA ήταν γενικά κακής ποιότητας και ποσότητας τόσο σε υγιή άτομα όσο και σε
ασθενείς με MDS. Ωστόσο, το πλάσμα επιλέχθηκε ως το βέλτιστο βιολογικό υλικό για την απομόνωση
εξωσωμικού RNA και τα 200μl ως ο βέλτιστος όγκος για την απομόνωση ολικού RNA.
Συμπεράσματα: Για τον καλύτερο χαρακτηρισμό των εξωσωμάτων θα πρέπει να πραγματοποιείται είτε ένα
στάδιο αραίωσης είτε ένα επιπλέον στάδιο καθαρισμού. Ακόμα, η απομόνωση των εξωσωμάτων θα πρέπει να
πραγματοποιείται πριν από την κατάψυξη του δείγματος, σε περίπτωση που η ποιότητα του δείγματος
παρεμποδίζει την απελευθέρωση των εξωσωμάτω
|
Language |
English |
Subject |
Circulating miRNAs |
|
Exosomes |
|
Βιοδείκτες |
|
Εξωσώματα |
|
Κυκλοφορούντα miRNAs |
Issue date |
2022-12-07 |
Collection
|
School/Department--School of Medicine--Department of Medicine--Post-graduate theses
|
|
Type of Work--Post-graduate theses
|
Permanent Link |
https://elocus.lib.uoc.gr//dlib/d/d/4/metadata-dlib-1669450408-136985-20265.tkl
|
Views |
22 |
Digital Documents
|
|
No permission to view document.
It won't be available until: 2025-12-07
|