Your browser does not support JavaScript!

Αρχική    Συλλογές    Τύπος Εργασίας    Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης  

Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης

Εντολή Αναζήτησης : Συγγραφέας="Μπριασούλης"  Και Συγγραφέας="Γεώργιος"

Τρέχουσα Εγγραφή: 7 από 4902

Πίσω στα Αποτελέσματα Προηγούμενη σελίδα
Επόμενη σελίδα
Προσθήκη στο καλάθι
[Προσθήκη στο καλάθι]
Κωδικός Πόρου 000431878
h
Τίτλος Localizing selective sweeps using higher order Site Frequency Spectra: the 2-D SFS.
Άλλος τίτλος Εντοπισμός επιλεκτικής συμπαράσυρσης χρησιμοποιώντας μεγαλύτερης διάστασης φάσμα αλληλικών συχνοτήτων : 2D-SFS
Συγγραφέας Μαλλιαρού, Μαρία
Σύμβουλος διατριβής Παυλίδης, Παύλος
Μέλος κριτικής επιτροπής Νικολάου, Χριστόφορος
Λαδουκάκης, Εμμανουήλ
Περίληψη Όταν ένα αλληλόμορφο επιλέγεται μέσω φυσικής επιλογής, η συχνότητα του μπορεί να αυξηθεί στο πλυθυσμό και συνδεδεμένες με αυτό, ουδέτερες μεταλλάξεις, θα αυξηθούν σε συχνότητα, ένα φαινόμενο που ονομάζεται επιλεκτική συμπαράσυρση. Καθώς η απόσταση από την ευεργετική μετάλλαξη αυξάνεται, ο ανασυνδυασμός επιτρέπει ουδέτερες παραλλαγές να ξεφύγουν από το λεγόμενο «φαινόμενο ωτοστόπ» της ωφέλιμης μεταλλαγής, δημιουργώντας έτσι χαρακτηριστικά μοτίβα ουδέτερων παραλλαγών, τοπικά, γύρω από τον στόχο της φυσικής επιλογής. Αυτά τα μοτίβα ουδέτερων πολυμορφισμών έχουν αξιοποιηθεί τα τελευταία 20 χρόνια με υπολογιστικές μεθόδους που στοχεύουν στον εντοπισμό της δράσης της θετικής επιλογής σε γονιδιώματα που λαμβάνονται από φυσικούς πληθυσμούς. Είναι γνωστό ότι ορισμένα δημογραφικά μοντέλα θέτουν σοβαρές προκλήσεις στην ανίχνευση επιλεκτικής συμπαράσυρσης επειδή δημιουργούν μοτίβα ουδέτερων πολυμορφισμών που μοιάζουν με εκείνα μίας επιλεκτικης συμπαράσυρσης. Έχει καταβληθεί σημαντική προσπάθεια για την κατανόηση των προτύπων ουδέτερων παραλλαγών που δημιουργούνται αποκλειστικά από δημογραφικά μοντέλα. Ωστόσο, δεν υπάρχει ακόμη περιγραφή ενός επιλεκτικού μοντέλου σάρωσης σε έναν πληθυσμό που έχει βιώσει δημογραφικές αλλαγές κατά την εξελικτική του ιστορία. Έτσι, παρόλο που η ουδετερότητα έχει μελετηθεί εκτενώς, αυτό δεν ισχύει για το μοντέλο της θετικής επιλογής. Εδώ, παρουσιάζουμε μια νέα μεθοδολογία για την ενσωμάτωση της δημογραφικής ιστορίας ενός πλυθυσμού στο μοντέλο επιλογής μιας επιλεκτικής σάρωσης. Δείχνουμε ότι ορισμένα δημογραφικά μοντέλα μπορεί να αλλάξουν δραματικά τα γνωστά πρότυπα θετικής επιλογής. Για να διευκολύνουμε την ανίχνευση της θετικής επιλογής σε μη απομονωμένους φυσικούς πληθυσμούς που έχουν βιώσει δημογραφικές αλλαγές, εφαρμόσαμε ένα λογισμικό ανίχνευσης επιλογής μέσω προσομοιώσεων (SweeD-sim) που επεκτείνει το ήδη υπάρχον εργαλείο Sweep Detector(SweeD). Επιπλέον, για να ενσωματώσουμε συγκεκριμένα μοτίβα ανισορροπίας σύνδεσης της γενετικής συμπαράσυρσης, έχουμε επεκτείνει την προσέγγισή μας σε δύο διαστάσεις, δημιουργώντας ένα λεγόμενο δισδιάστα™ φάσμα αλληλικών συχνοτήτων (2D-SFS) με στόχο στατιστικά σημαντικότερα αποτελέσματα.
Φυσική περιγραφή 26 σ. : πίν. σχήμ. ; 30 εκ.
Γλώσσα Αγγλικά
Θέμα Kernel density
Simulations
Εκτίμηση πυκνότητας με πυρήνες
Επιλεκτική συμπαράσυρση
Προσομοιώσεις
Ημερομηνία έκδοσης 2020-08-05
Συλλογή   Σχολή/Τμήμα
  Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
Μόνιμη Σύνδεση https://elocus.lib.uoc.gr//dlib/d/1/a/metadata-dlib-1599546920-42019-12642.tkl Bookmark and Share
Εμφανίσεις 172

Ψηφιακά τεκμήρια
No preview available

Δεν έχετε δικαιώματα για να δείτε το έγγραφο.
Δεν θα είναι διαθέσιμο έως: 2023-08-05