Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες
Εντολή Αναζήτησης : Συγγραφέας="Καλαντίδης"
Και Συγγραφέας="Κρίτων"
Τρέχουσα Εγγραφή: 52 από 68
|
Κωδικός Πόρου |
000391109 |
Τίτλος |
Λειτουργική ανάλυση των πρωτεϊνών p22 του Tomato chlorosis virus και p25 του Cucurbit yellow stunting disorder virus σε σχέση με την RNA σίγηση |
Άλλος τίτλος |
Functional analysis of proteins p22 from ToCV and p25 from CYSDV in relation to Rna silencing |
Συγγραφέας
|
Σαπλαούρα, Ελευθερία Κ.
|
Σύμβουλος διατριβής
|
Καλαντίδης, Κρίτων
|
Μέλος κριτικής επιτροπής
|
Τσαγρή, Ευθυμία
Βόντος, Ιωάννης
|
Περίληψη |
Η RNA σίγηση (RNA silencing ή RNA interference, RNAi) είναι η στοχευμένη καταστολή της γονιδιακής έκφρασης μέσω της συμμετοχής του RNA. Τα φυτά χρησιμοποιούν την RNA σίγηση για τρεις κυρίως σκοπούς: 1) τη δημιουργία και διατήρηση της ετεροχρωματίνης, 2) τη ρύθμιση ενδογενών λειτουργιών και 3) την άμυνα ενάντια σε ιογενείς και βακτηριακές μολύνσεις. Η αντι-ιική RNA σίγηση ενεργοποιείται από δίκλωνα RNA μόρια (dsRNAs) τα οποία μπορεί να προκύψουν κατά την αντιγραφή των ιών ή από το σχηματισμό δίκλωνων δομών στο ιικό γονιδίωμα. Από τα dsRNAs στη συνέχεια προκύπτουν μικρά παρεμβαλλόμενα μόρια RNA (siRNAs) που αποτελούν τους οδηγούς για την μετα-μεταγραφική γονιδιακή σίγηση (PTGS) του RNA του ιού. Οι ιοί κωδικοποιούν για πρωτεΐνες που καταστέλλουν την RNA σίγηση, επιτρέποντας τη μόλυνση και την εξάπλωσή της. Οι ιικοί καταστολείς μπορούν να στοχεύουν είτε τα μόρια RNA ή τις πρωτεΐνες και τα σύμπλοκα που συμμετέχουν στο μονοπάτι της σίγησης.
Ο ιός του κίτρινου παραμορφωτικού νανισμού των κολοκυνθοειδών (Cucurbit yellow stunting disorder virus, CYSDV) και ο ιός της χλώρωσης της ντομάτας (Tomato chlorosis virus, ToCV) κωδικοποιούν για πρωτεΐνες-καταστολείς της RNA σίγησης: τις p25 και p22, αντίστοιχα. Με τη χρήση της μεθόδου του αγροεμποτισμού σε φυτά Nicotiana benthamiana αγρίου τύπου (Wt) και της διαγονιδιακής σειράς 16C (σταθερή έκφραση της GFP) και ακολούθως ανάλυση κατά Northern, μελετήθηκε η επίδραση των καταστολέων στα επίπεδα των διαφόρων κλασμάτων RNA του φυτού. Επιπλέον, έγιναν δοκιμές ανοσοκατακρήμνισης ώστε να ανιχνευθεί πιθανή αλληλεπίδραση των καταστολέων με πρωτεΐνες που συμμετέχουν στον μηχανισμό της σίγησης. Τέλος, μελετήθηκε ο ενδοκυτταρικός εντοπισμός των p25 και p22 με την βοήθεια GFP επιτόπου και έγιναν προσπάθειες κατασκευής διαγονιδιακών φυτών που να υπερεκφράζουν τους καταστολείς με σκοπό να χρησιμοποιηθούν σε μεταγενέστερες αναλύσεις.
Τα αποτελέσματα επιβεβαιώνουν τις προηγούμενες μελέτες και παρέχουν νέα δεδομένα όσον αφορά τον τρόπο δράσης των p25 και p22. Συγκεκριμένα, και οι δύο πρωτεΐνες καταστέλλουν το sense (S-) και hairpin (hp-) PTGS αλλά δεν επηρεάζουν την μετάδοση του σήματος της σίγησης. Η ToCV p22 φαίνεται να εντοπίζεται κατά κύριο λόγο στον πυρήνα και να μειώνει σημαντικά τα επίπεδα των μικρών RNAs, με μεγαλύτερο αντίκτυπο στα siRNAs 24 νουκλεοτιδίων. Αυτό ίσως υποδεικνύει μια συσχέτιση του καταστολέα με την δράση της DCL3. Η CYSDV p25 εντοπίζεται στο κυτταρόπλασμα και έχει προταθεί ότι δρα μεταγενέστερα της παραγωγής siRNAs. Εκκρεμεί η ολοκλήρωση και των υπολοίπων δοκιμασιών και η μελέτη συνεχίζεται ώστε να διαλευκανθεί ο ρόλος αυτών των καταστολέων.
|
Φυσική περιγραφή |
70 φύλλα : πίν., εικ. (μερικές έγχ.) ; 30 εκ. |
Γλώσσα |
Ελληνικά |
Θέμα |
Crinivirus |
|
Plants |
|
Suppressor |
|
Virus |
|
Ιός |
|
Καταστολείς |
|
Φυτά |
Ημερομηνία έκδοσης |
2015-03-20 |
Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Βιολογίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
|
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
Μόνιμη Σύνδεση |
https://elocus.lib.uoc.gr//dlib/a/e/d/metadata-dlib-1427186532-212702-27107.tkl
|
Εμφανίσεις |
372 |