E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης

Αρχική Αναζήτηση

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

Εντολή Αναζήτησης : Συγγραφέας="Ηλιόπουλος" Και Συγγραφέας="Α."

Τρέχουσα Εγγραφή: 6 από 22

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000406866

Τίτλος

Structure-based virtual screening of potential inhibitors for peptidoglycan deacetylase BC1974 from Bacillus cereus

Άλλος τίτλος

In Silico επιλογή και μελέτη αναστολέων της απακετυλάσης πεπτιδογλυκάνης BC1974 από Bacillus cereus.

Συγγραφέας

Γκιουλμπασάνη, Μαριάνθη Α.

Σύμβουλος διατριβής

Ηλιόπουλος, Ηλίας
Μπουριώτης, Βασίλης

Περίληψη

Η πεπτιδογλυκάνη είναι το βασικό κυτταρικό τοίχωμα του Bacillus cereus. Οι απακετυλάσες N-ακετυλο-γλυκοζαμίνης της πεπτιδογλυκάνης (Peptidoglycan GlcNAc deacetylases, PGNG-DACS) ανήκουν στην οικογένεια των εστερασών υδατανθράκων 4 (Carbohydrate Esterase Family 4, CE4) και είναι απαραίτητες για τη βακτηριακή διαφυγή από την λυσοζύμη και τις ανοσολογικές αποκρίσεις. Η BC1974 είναι μια PGNG-dac του Β. cereus που έχει 97% ταυτότητα με την BA1977, μια απεκατελάση πεπτιδογλυκάνης που εμπλέκεται στην αντίσταση της λυσοζύμης του ξενιστή και θεωρείται υπεύθυνη για την πλήρη μολυσματικότητα από τον Bacillus anthracis, τον αιτιολογικό παράγοντα του άνθρακα. Για τον εντοπισμό πιθανών αναστολέων για την BC1974, έχει εφαρμοστεί η προσέγγιση εικονικής διαλογής που βασίζεται στη δομή. Ψάξαμε για πιθανά μόρια στη βάση δεδομένων ZINC που να περιέχουν ένα υδροξαμικό τμήμα ή Ν-υδροξυβενζαμίδιο ως υποδομή. Τρεις ενώσεις: 1-[(3,5-διμεθυλο-1,2-οξαζολ-4-υλ)σουλφονυλο]-N-υδροξυπιπεριδίνη-4-καρβοξαμίδιο (ZINC12560961), 1-(2,3-διυδρο-1H-ινδεν-5-υλσουλφονυλο)-N-υδροξυπιπεριδίνη-4-καρβοξαμίδιο (ZINC12560959), 2-(1-αδαμαντυλο)-N-υδροξυακεταμίδιο (ZINC03866444), επελέγησαν τελικά για πειράματα in vitro. Ενζυμικές δοκιμές που βασίζονται είτε στο φθορισμό είτε στη ραδιενέργεια χρησιμοποιώντας σαν υπόστρωμα GlcNAc5 και γλυκόλ-χιτίνη αντίστοιχα χρησιμοποιήθηκαν για την εξέταση της πιθανής ανασταλτικής δράσης των επιλεγμένων ενώσεων. Η ανάλυση των αποτελεσμάτων δεν έδειξε σημαντική αναστολή της ενεργότητας της BC1974 χρησιμοποιώντας δύο από τις τρεις ενώσεις. Η τρίτη (ZINC03866444) έδειξε μια μικρή αναστολή αλλά μόνο χρησιμοποιώντας τη ραδιενεργό δοκιμή. Ένας λόγος μπορεί να είναι η διαφορά μεταξύ της συγγένειας του αναστολέα και των υποστρωμάτων (GlcNAc5 και ραδιοσημασμένη γλυκολ χιτίνη) για τη θέση σύνδεσης της BC1974. Είναι απαραίτητη η διεξαγωγή περισσότερων πειραμάτων ώστε να αποσαφηνιστεί η ανασταλτική δράση του τρίτου αναστολέα.

Φυσική περιγραφή

77 φύλλα : σχεδ., πίν., εικ. (μερ. έγχ.) ; 30 εκ.

Γλώσσα

Αγγλικά

Θέμα

B. Anthracis

B. Cereus

BA1977

Εικονική διαλογή βασισμένη στη δομή

Ημερομηνία έκδοσης

2017-03-17

Συλλογή