E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης

Αρχική Αναζήτηση

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

Εντολή Αναζήτησης : Συγγραφέας="Καράντζαλη" Και Συγγραφέας="Ευθυμία"

Τρέχουσα Εγγραφή: 1 από 2

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000351373

Τίτλος

Γενετική και επιγενετική ανάλυση της γονιδιακής έκφρασης των εμβρυ'ικών βλαστοκυττάρων του ποντικού κατά τη διαφοροποίηση / Καράντζαλη Ευθυμία.

Άλλος τίτλος

Genetic and epigenetic analysis of gene expression during mouse embryonic stem cell differentiation

Συγγραφέας

Καράντζαλη, Ευθυμία

Σύμβουλος διατριβής

Παπαματθαιάκης, Ιωσήφ

Περίληψη

Στην παρούσα μελέτη αναπτύχθηκε ένας νέος τρόπος διαφοροποίησης των εμβρυϊκών βλαστοκυττάρων με τη χρήση ενός αναστολέα απακετυλασών, την Τριχοστατίνη Α (TSA). Επώαση των κυττάρων με TSA προκάλεσε αναδιαμόρφωση της χρωματινικής δομής και των τροποποιήσεων των ιστονών αλλά και αλλαγές στο πρότυπο γονιδιακής έκφρασης με τους παράγοντες πλειοδυναμίας και διαφοροποίησης να καταστέλλονται και να επάγονται μεταγραφικά, αντίστοιχα. Οι αλλαγές αυτές είναι παρόμοιες με εκείνες που λαμβάνουν χώρα κατά τη διαφοροποίηση των κυττάρων μέσω του σχηματισμού των εμβρυϊκών σωματίων (ΕΒ) αλλά συμβαίνουν σε διάστημα 12 ωρών αντί 8 ημερών. Η δράση της TSA δεν ήταν μόνιμη καθώς μετά την απομάκρυνσή της από την καλλιέργεια τα κύτταρα επανήλθαν μερικώς στην αρχική κατάσταση, αποκαθιστώντας τα αρχικά επίπεδα έκφρασης ορισμένων παραγόντων και κάποιες από τις αρχικές τροποποίησεις στους αντίστοιχους υποκινητές. Συνδυασμός των παραπάνω αποτελεσμάτων έδειξε πως εκείνα τα γονίδια που κατά την καταστολή τους αποκτούσαν αυξημένα επίπεδα τριμεθυλίωσης της λυσίνης 27 στην ιστόνη 3 (3meK27H3), δεν μπορούσαν να επανέλθουν στην αρχική κατάσταση έκφρασης μετά την απομάκρυνση της TSA. Παρόλα αυτά, τα κύτταρα παρέμεναν πλειοδύναμα αφού όταν διαφοροποιήθηκαν μέσω του σχηματισμού των ΕΒ παρατηρήθηκε επαγωγή παραγόντων διαφοροποίησης και των τριών κατευθύνσεων (ενδόδερμα, μεσόδερμα, εκτόδερμα). Ανάμεσα στους παράγοντες που εμφάνισαν τη μεγαλύτερη καταστολή κατά τη διαφοροποίηση ήταν ο παράγοντας Sall1. Αποσιώπηση του γονιδίου του οδήγησε στη μεταγραφική καταστολή του nanog, ενός από τους σημαντικότερους παράγοντες πλειοδυναμίας, ενώ μετά από in vitro και in vivo πειράματα πρωτεϊνικών αλληλεπιδράσεων βρέθηκε πως αλληλεπιδρά με τους παράγοντες πλειοδυναμίας Nanog και Sox2. Μετά από ανοσοκατακρήμνιση χρωματίνης και ανάλυση μικροσυστοιχειών υποκινητών βρέθηκε πως οι παράγοντες Sall1 και Nanog εντοπίζονται στους υποκινητές κοινών γονιδίων-στόχων. Τέλος, διατήρηση της έκφρασης του Sall1 κατά τη διαφοροποίηση παρεμπόδισε την επαγωγή μεσοδερμικών και εκτοδερμικών παραγόντων διαφοροποίησης υποδηλώνοντας πως ο παράγοντας αυτός παίζει ρόλο στην καταστολή τους στην αδιαφοροποίητη κατάσταση και τοποθετώντας τον ανάμεσα στους παράγοντες που συμβάλλουν στη διατήρηση της πλειοδυναμίας των εμβρυικών βλαστοκυττάρων.

Φυσική περιγραφή

174 σ. : εικ. ; 30 εκ.

Γλώσσα

Ελληνικά

Θέμα

Chromatin

Differentiation

Nanog

Salli

Trichostatin A CTSA

Διαφοροποίηση

Επιγενετικές τροποποιήσεις