E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης

Αρχική Αναζήτηση

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

Εντολή Αναζήτησης : Συγγραφέας="Κατερινόπουλος" Και Συγγραφέας="Χαράλαμπος"

Τρέχουσα Εγγραφή: 4 από 79

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000442915

Τίτλος

Ανακάλυψη αναστολέων της κινάσης CK1 με την χρήση υπολογιστικών μεθόδων

Άλλος τίτλος

Discovery of kinase CK1 inhibitors using computer aided methods

Συγγραφέας

Ορφανάκης, Εμμανουήλ Γ.

Αντιγραφέας

Κατερινόπουλος, Χαράλαμπος

Μέλος κριτικής επιτροπής

Μικρός, Εμμανουήλ
Μυριανθόπουλος, Βασίλειος

Περίληψη

Τα τελευταία χρόνια παρατηρείται εκτενής χρήση υπολογιστικών μεθοδολογιών, όσον αφορά στην έρευνα για την ανακάλυψη νέων φαρμάκων. Στην παρούσα διπλωματική εργασία, πραγματοποιήθηκε προσπάθεια με τη χρήση υπολογιστικών μεθόδων να ανακαλυφθούν μόρια με ανασταλτική δράση στις τέσσερις ισομορφές της πρωτεϊνικής κινάσης CK1. Οι κινάσες της ομάδας αυτής αντιπροσωπεύουν σημαντικούς στόχους για τη φαρμακευτική και την θεραπεία διαφόρων παθολογιών. Η αναζήτηση υποψηφίων αναστολέων των CK1 πραγματοποιήθηκε σε τέσσερις συλλογές μορίων ανοιχτής πρόσβασης και για την εικονική αξιολόγηση έγινε χρήση τριών διαφορετικών αλγορίθμων υψηλών δυνατοτήτων και αξιοπιστίας. Αρχικά, πραγματοποιήθηκε η κατασκευή και επικύρωση ενός θεωρητικού μοντέλου χρησιμοποιώντας διαθέσιμα πειραματικά δεδομένα. Έπειτα, έγινε χρήση μεθοδολογιών βασισμένων στη δομή του φαρμακολογικού στόχου (structure-based) αλλά και άλλων βασισμένων στη δομή γνωστών βιολογικά δραστικών μορίων (ligand-based). Χρησιμοποιήθηκαν υπολογισμοί πρόσδεσης και αποτίμησης σε δύο επίπεδα ακρίβειας σε ότι αφορά στη διαμορφωτική ελευθερία της πρωτεΐνης. Επιπροσθέτως, πραγματοποιήθηκε εικονική αξιολόγηση που μέσω της σύγκρισης της τρισδιάστατης δομικής ομοιότητας μεταξύ των υπό μελέτη μορίων και γνωστών αναστολέων των διερευνώμενων κινασών (ligandbased). Τέλος, συγκρίθηκαν τα αποτελέσματα που προέκυψαν μέσω των διαφορετικών τεχνικών που αναφέρθηκαν και σχηματίστηκε μια ομάδα από μόρια που παρουσιάζουν αυξημένες πιθανότητες να αποτελούν βιολογικά δραστικές ουσίες για τις κινάσες CK1. Η πρόσδεση των αυτών των ενώσεων αναφοράς στις κινάσες στόχους μελετήθηκε με προσομοιώσεις μοριακής δυναμικής για την εξαγωγή συμπερασμάτων όσον αφορά στη χρονοεξαρτώμενη διάσταση της αλληλεπίδρασης. Οι ενώσεις που παρουσιάζουν τα βέλτιστα χαρακτηριστικά και πιθανότητες πολλά υποσχόμενης βιολογικής δράσης θα δοκιμαστούν σε πειραματικό επίπεδο σαν υποψήφιοι αναστολείς των προαναφερθέντων πρωτεϊνών.

Φυσική περιγραφή

131 σ. : πίν., σχήμ., εικ. (μερ. εγχρ.) ; 30 εκ.

Γλώσσα

Ελληνικά

Θέμα

Computational tools

In silico studies

In silico μελέτες

Protein inhibition

Αναστολή πρωτεϊνών

Υπολογιστικά εργαλεία

Ημερομηνία έκδοσης