| Περίληψη |
Η μεγάλη κόκκινη γαρίδα Aristaeomorpha foliacea (Risso, 1827) είναι ένα κοσμοπολίτικο
βενθοπελαγικό είδος γαρίδας το οποίο κατανέμεται μεταξύ άλλων στη Μεσόγειο, στην
Καραϊβική, στη Ν. Αφρική, στην Ιαπωνία και στην Ωκεανία. Απαντάται σε βάθη από 120 έως
1300μ, με μέγιστη αφθονία στα 500 με 800μ και είναι από τα πιο σημαντικά εμπορικά είδη
στη Μεσόγειο, όπου η παρουσία του εμφανίζει διαβάθμιση σε σχέση με το γεωγραφικό
μήκος. Αλιεύεται συστηματικά στην κεντρική και ανατολική Μεσόγειο, ενώ στη δυτική
πλευρά η αφθονία του είναι πλέον σημαντικά μειωμένη.
Η πληροφορία για τη γενετική ποικιλότητα του είδους είναι περιορισμένη. Οι διαθέσιμες
γενετικές μελέτες έχουν γίνει με χρήση μικρού αριθμού α) πληθυσμών, β) σημείων
δειγματοληψίας και γ) δεικτών (πυρηνικού και μιτοχονδριακού DNA) και δεν έχουν εντοπίσει
πρότυπα διαφοροποίησης μεταξύ των πληθυσμών του εντός της Μεσογείου. Στα πλαίσια
ενός ευρωπαϊκού προγράμματος το οποίο στοχεύει στην οριοθέτηση των ιχθυοαποθεμάτων
6 εμπορικών ειδών στη Μεσόγειο, συλλέχθηκαν 1.700 περίπου δείγματα από 32
πληθυσμούς που καλύπτουν τις περισσότερες περιοχές εξάπλωσης του Α. foliacea στη
Μεσόγειο. Ως μοριακοί δείκτες για τις αναλύσεις πληθυσμιακής γενωμικής,
χρησιμοποιήθηκαν σημειακοί νουκλεοτιδικοί πολυμορφισμοί (Single Nucleotide
Polymorphisms, SNPs) που εντοπίστηκαν με τη μεθοδολογική προσέγγιση αλληλούχησης
«double-digest Restriction site Associated DNA (ddRADseq)». Με τη μέθοδο αυτή
κατασκευάστηκαν αρχικά βιβλιοθήκες χαμηλής αντιπροσώπευσης του γονιδιώματος με τη
χρήση περιοριστικών ενζύμων, που στη συνέχεια αλληλουχήθηκαν. Ο μεγάλος όγκος
γενετικών δεδομένων που προέκυψαν, αναλύθηκε με λογισμικά βιοπληροφορικής για την
εξαγωγή συμπερασμάτων για τις σχέσεις μεταξύ των πληθυσμών.
Τα αποτελέσματα των αναλύσεων έδειξαν έλλειψη γενετικής δομής μεταξύ των πληθυσμών
του Α. foliacea στη Μεσόγειο και δεν απέδειξαν την ύπαρξη γεωγραφικών ή
ωκεανογραφικών ασυνεχειών που θα μπορούσαν να εμποδίζουν τη γονιδιακή ροή. Πιο
συγκεκριμένα, παρατηρήθηκαν χαμηλές τιμές ετεροζυγωτίας, ειδικά σε πληθυσμούς με λίγα
άτομα στην ανάλυση. Οι τιμές Fst ανά ζεύγη πληθυσμών ήταν χαμηλές και στατιστικά μη
σημαντικές ακόμη κι όταν συγχωνεύτηκαν πληθυσμοί με λίγα άτομα, ώστε να γίνει η
ανάλυση πιο στατιστικά ισχυρή. Τέλος, οι αναλύσεις που έγιναν για την εκτίμηση της
πληθυσμιακής δομής (χρήση λογισμικών DAPC, STRUCTURE) έδειξαν την ύπαρξη πιθανότατα
ενός ενιαίου παμμικτικού πληθυσμού για το είδος στη Μεσόγειο, ενώ η AMOVA έδειξε
χαμηλή αλλά στατιστικά σημαντική τιμή FCT = 0,2%, όταν ομαδοποιήθηκαν οι πληθυσμοί σε
3 ομάδες που αντιστοιχούν στη Δυτική, την Κεντρική και την Ανατολική Μεσόγειο.
Τα παραπάνω αποτυπώνουν την υψηλή συνδεσιμότητα που υπάρχει μεταξύ των
πληθυσμών της κόκκινης γαρίδας στη Μεσόγειο με πιθανότερη εξήγηση για αυτό, τη
σημαντική ικανότητα διασποράς τόσο κατά τα προνυμφικά στάδια, όσο και κατά την ενήλικη
ζωή του είδους. Τέλος, έγινε συζήτηση για τη σημασία της παραγωγής ποιοτικών συνόλων
δεδομένων στα οποία να μπορούν να βασιστούν οι συγκεκριμένες αναλύσεις και τα πιθανά
προβλήματα που μπορεί να ανακύψουν σε αυτές.
|
Αναζήτηση
