Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

Εντολή Αναζήτησης : Συγγραφέας="Νικολάου"  Και Συγγραφέας="Μαρία"

Τρέχουσα Εγγραφή: 8 από 18

[Προσθήκη στο καλάθι]
Κωδικός Πόρου	000419430
Τίτλος	Learning pathway dynamics from single-cell proteomic data
Άλλος τίτλος	Μάθηση δυναμικών βιολογικών μονοπατιών από single cell δεδομένα
Συγγραφέας	Βέρρου, Κλειώ-Μαρία
Σύμβουλος διατριβής	Τσαμαρδίνος, Ι Νικολάου, Χ. Στρουμπούλης, Ι
Περίληψη	Οι πλατφόρμες μονού κυττάρου παρέχουν δεδομένα με στατιστικά μεγάλα δείγματα παρατηρήσεων στιγμιότυπου ικανών να επιλύσουν τη διακυτταρική ετερογένεια. Επί του παρόντος, υπάρχει μια αυξανόμενη βιβλιογραφία σχετικά με τους αλγόριθμους που εκμεταλλεύονται αυτό το χαρακτηριστικό προκειμένου να συναχθεί η τροχιά των βιολογικών μηχανισμών όπως ο πολλαπλασιασμός των κυττάρων και η διαφοροποίηση. Η μεθοδολογία συμπερασμάτων τροχιάς (Τ.Ι. μέθοδοι) δεν έχει ακόμη χρησιμοποιηθεί για την αντιμετώπιση του προβλήματος της εκμάθησης της δυναμικής των σηματοδοτικών πρωτεϊνικών μονοπατιών. Σε αυτή την εργασία αξιολογούμε αυτήν την προοπτική. Ελέγξαμε την απόδοση αυτής της νέας κατηγορίας μεθόδων σε δύο από τα προσωρινά σύνολα δεδομένων των πρωτεϊνωμάτων που δημιουργήθηκαν χρησιμοποιώντας ξεχωριστά σηματοδοτικά ερεθίσματα στον ίδιο πληθυσμό κυττάρων. Για να αξιολογήσουμε την ποιότητα της μάθησης, κατασκευάσαμε τέσσερις διαφορετικές μεθόδους αξιολόγησης που εξετάζουν την απόδοση του αλγορίθμου με βάση (α) την προϋπάρχουσα βιολογική γνώση, (β) την ευρωστία τους, (γ) τη συσχέτιση τους με το αρχικό σύνολο δεδομένων και (δ) την τραχύτητα των επιπέδων φωσφορυλίωσης κατά τον βιολογικό χρόνο. Δείχνουμε ότι μόνο ο πειραματικός χρόνος είναι ανεπαρκής για να παρέχει γνώση σχετικά με τη σειρά των πρωτεϊνών κατά τη διάρκεια της μεταγωγής σήματος. Συνεπώς, δείχνουμε ότι οι T.Ι. μέθοδοι παρέχουν πλουσιότερες πληροφορίες σχετικά με την υποβόσκουσα δυναμική. Τα αποτελέσματά μας υπογραμμίζουν επίσης ότι κανένας από τους ήδη αναπτυγμένους αλγορίθμους δεν είναι καθολικά εφαρμόσιμος σε αυτό το πρόβλημα, επειδή η ποιότητα εκμάθησης εξαρτάται σε μεγάλο βαθμό από τη σηματοδοτικό εναύσματα.
Φυσική περιγραφή	70 σ. : πίν. σχήμ. ; 30 εκ.
Γλώσσα	Αγγλικά
Θέμα	Mass cytometry
	Proteomics
	Ψευδοχρόνος
Ημερομηνία έκδοσης	2018-12-05
Συλλογή	Σχολή/Τμήμα--Ιατρική Σχολή--Τμήμα Ιατρικής--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
	Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
Μόνιμη Σύνδεση	https://elocus.lib.uoc.gr//dlib/4/e/b/metadata-dlib-1543577806-995359-30058.tkl
Εμφανίσεις	294

Ψηφιακά τεκμήρια
	Κατέβασμα Εγγράφου Προβολή Εγγράφου Εμφανίσεις : 1