Your browser does not support JavaScript!

Αρχική    Αναζήτηση  

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

Εντολή Αναζήτησης : Συγγραφέας="Βόντας"  Και Συγγραφέας="Ιωάννης"

Τρέχουσα Εγγραφή: 16 από 76

Πίσω στα Αποτελέσματα Προηγούμενη σελίδα
Επόμενη σελίδα
Προσθήκη στο καλάθι
[Προσθήκη στο καλάθι]
Κωδικός Πόρου 000443848
Τίτλος Ανάπτυξη χιμαιρικών μορίων για πιθανές θεραπευτικές εφαρμογές κατά της COVID-19
Άλλος τίτλος Design and analysis of chimeric molecules with potential therapeutic applications against COVID-19
Συγγραφέας Λιούτα, Κυριακή Μαρία Α.
Σύμβουλος διατριβής Κοκκινίδης, Μιχαήλ
Μέλος κριτικής επιτροπής Αθανασάκη, Ειρήνη
Βόντας, Ιωάννης
Περίληψη Τα α-ελικοειδή δεμάτια σχηματίζονται συχνά από 4 α-έλικες οι οποίες διασταυρώνονται με γωνία 20ο και πακετάρονται με αντιπαράλληλο τρόπο. Στο κέντρο του δεματίου εμφανίζεται ένας υδρόφοβος πυρήνας, ο σχηματισμός του οφείλεται στο χαρακτηριστικό μοτίβο επανάληψης της επτάδας, όπου τοποθετούνται υδρόφοβα και υδρόφιλα αμινοξέα με περιοδικότητα επτά καταλοίπων. Οι τοπολογίες των 4-α-ελικοειδών δεματίων χαρακτηρίζουν μεγάλη ποικιλία πρωτεϊνών οι οποίες υπάρχουν σε μονομερείς μορφές ή σε ολιγομερή σύμπλοκα. Στην συγκεκριμένη εργασία αναπτύσσεται μια τεχνική παρουσίασης πρωτεϊνικών λειτουργικών μονάδων με την βοήθεια ελικοειδών δεματίων, έτσι ώστε να εξασφαλίζεται η αλληλεπίδρασή τους. Η γειτνίαση των λειτουργικών μονάδων, προκύπτει από μια ειδική πρωτεϊνική πλατφόρμα δομικής στήριξης/προσανατολισμού, με χαρακτηριστικά 4 α-ελικοειδών δεματίων. Λόγω της ομοτετραμερούς, αντιπαράλληλης διαμόρφωσής τους, αλλά και της σταθερότητας της δομής τους, τα 4 α-ελικοειδή δεμάτια αποτελούν ιδανικά ικριώματα. Στη παρούσα εργασία, ως δομική πλατφόρμα προτείνεται η χρήση δυο θερμοανθεκτικών μεταλλαγμάτων της Rop (Repressor Of Primer), η RM6 και η αντίστροφη αλληλουχία αυτής, η πρωτεΐνη rRM6. Στα πλαίσια της εργασίας, κατασκευάστηκαν δυο χιμαιρικές πρωτεΐνες, οι A11/rRM6/M8 και A1/RM6/RBM. Στην πρώτη περίπτωση ως λειτουργικές μονάδες χρησιμοποιήθηκαν τα δυο μεταλλάγματα της μεγανουκλεάσης I-CreI, Α11 και Μ8 τα οποία συνδυαζόμενα αναγνωρίζουν αλληλουχίες που αντιστοιχούν σε γονίδιο υπεύθυνο για την ασθένεια Xeroderma Pigmentosum. Η συγκεκριμένη κατασκευή στοχεύει στην δημιουργία ετεροδιμερών της I-CreI, αποτρέποντας τον ομοδιμερισμό των μεταλλαγμάτων, προκειμένου να προκύψουν οι επιθυμιτές νέες εξειδικεύσεις, ως προς την αλληλουχία αναγνώρισης. Η οργάνωση της χιμαιρικής πρωτεΐνης σε μεγαλύτερες ινώδεις δομές, η οποία διαπιστώθηκε στα πλαίσια του καθαρισμού της, προσδίδει ακόμα περισσότερες προοπτικές στην συγκεκριμένη κατασκευή. Στη δεύτερη περίπτωση σχεδιάστηκε μια χιμαιρική πρωτεΐνη χρησιμοποιώντας το ικρίωμα της RM6, ως λειτουργικές ομάδες επιλέχθηκαν, το μοτίβο RBM της πρωτεΐνης ακίδας (S glycoprotein) του SARS-COV-2 και η α1-έλικα του ανθρώπινου υποδοχέα ACE2. Τα συγκεκριμένα μοτίβα επιλέχθηκαν σύμφωνα με την ανάλυση των αλληλεπιδράσεων του συμπλόκου ACE2/S glycoprotein, όπως προκύπτουν από την κρυσταλλική δομή του συμπλόκου (pdb: 6Μ0J). Η μελέτη της χιμαιρικής πρωτεΐνης, με προσομοιώσεις Μοριακής Δυναμικής, ανέδειξε την σταθεροποίηση μιας λούπας (L1) του μοτίβου RBM, η οποία σταθεροποιείται από την α1-έλικα, μέσω της αλλήλεπίδρασή τους. Η συγκεκριμένη πληροφορία μπορεί να αξιοποιηθεί κατά τον σχεδιασμό πεπτιδικών (πρωτεϊνικών) εμβολίων. Τέλος προτείνεται πρωτόκολλο καθαρισμού της συγκεκριμένης χιμαιρικής πρωτεΐνης, αξιοποιώντας την πρωτεΐνη SUMO3. Η A1/RM6/RBM πρωτεΐνη, προσφέρεται να αξιοποιηθεί ως υπόστρωμα σε in vitro πειράματα αξιολόγησης μικρών μορίων, σχεδιασμένων για την αναστολή της αλληλεπίδρασης μεταξύ ACE2/ S glycoprotein.
Φυσική περιγραφή 78 σ. : πίν., σχήμ., εικ. (μερ. εγχρ.) ; 30 εκ.
Γλώσσα Ελληνικά, Αγγλικά
Θέμα Chimeric protein
Χιμαιρικά μόρια
Ημερομηνία έκδοσης 2021-11-26
Συλλογή   Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Βιολογίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
  Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
Μόνιμη Σύνδεση https://elocus.lib.uoc.gr//dlib/1/f/e/metadata-dlib-1637658574-115898-20650.tkl Bookmark and Share
Εμφανίσεις 283

Ψηφιακά τεκμήρια
No preview available

Κατέβασμα Εγγράφου
Προβολή Εγγράφου
Εμφανίσεις : 3