E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Συγκριτική φυλογενετική ανάλυση της βακτηριακής ποικιλότητας σε βαθιά θαλάσσια ιζήματα του Ειρηνικού Ωκεανού και της Ανατολικής Μεσογείου (σταθμός km3net)

Αρχική Συγκριτική φυλογενετική ανάλυση της βακτηριακής ποικιλότητας σε βαθιά θαλάσσια ιζήματα του Ειρηνικού Ωκεανού και της Ανατολικής Μεσογείου (σταθμός km3net)

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000348319

Τίτλος

Συγκριτική φυλογενετική ανάλυση της βακτηριακής ποικιλότητας σε βαθιά θαλάσσια ιζήματα του Ειρηνικού Ωκεανού και της Ανατολικής Μεσογείου (σταθμός km3net)

Άλλος τίτλος

Comparative phylogenetic diversity of sediment bacteria from the deep Pacific ocean and the eastern Mediterranean sea (KM3 Station)

Συγγραφέας

Κουριδάκη, Ιωάννα Εμ

Σύμβουλος διατριβής

Στεφάνου, Ευριπίδης

Περίληψη

Στην παρούσα εργασία πραγματοποιήθηκε συγκριτική μελέτη της βακτηριακής σύστασης και ποικιλότητας μεταξύ βαθιών θαλάσσιων ιζημάτων (βάθη: 4000 μέτρα), τα οποία συλλέχθηκαν από τον Ειρηνικό Ωκεανό (ALVIN, 4 δείγματα) και την Ανατολική Μεσόγειο (ΚΜ3 net, 1 δείγμα). Πρόκειται για την πρώτη προσπάθεια σύγκρισης βακτηριακών βιοκοινωνιών μεγάλου βάθους των προαναφερθέντων θαλάσσιων οικοσυστημάτων, μεταξύ των οποίων δεν πραγματοποιείται καμία ανταλλαγή υδάτινων μαζών. Στα πλαίσια της μελέτης αυτής, κλωνοποιήθηκαν συνολικά 304 βακτηριακές αλληλουχίες του συντηρημένου γονιδίου 16S ριβοσωμικού RNΑ, οι οποίες και χρησιμοποιήθηκαν για φυλογενετική ανάλυση και ταυτόχρονα πραγματοποιήθηκε η ανάλυση τριών χημικών παραμέτρων: χλωροφύλλη α, οργανικός άνθρακας και λόγος C/N. Διαπιστώθηκε ότι τα υπό μελέτη μικροπεριβάλλοντα του Ειρηνικού Ωκεανού ήταν μεσοτροφικά σε αντίθεση με αυτό της Ανατολικής Μεσογείου, που ήταν ισχυρά ολιγοτροφικό, ενώ βρέθηκε ότι ο οργανικός άνθρακας είναι ο παράγοντας που συνδέεται άμεσα με την δομή των βακτηριακών μικροκοινωνιών. Επιπλέον, διαπιστώθηκε η υψηλή βιοποικιλότητα και στα πέντε μικροπεριβάλλοντα, με αυτό της Ανατολικής Μεσογείου να χαρακτηρίζεται από την υψηλότερη τιμή. Ιδιαίτερο ενδιαφέρον παρουσιάζει το γεγονός ότι η σύνθεση των μικροβιακών κοινωνιών των υπό μελέτη θαλασσίων οικοσυστημάτων δεν εμφανίζουν σημαντικές διαφορές, καθιστώντας την πίεση ως τον καθοριστικό παράγοντα επιλογής των φυλογενετικών βακτηριακών ομάδων που δομούν τις εκάστοτε μικροβιακές κοινωνίες σε βάθη 4000 μέτρων. Σύμφωνα με την φυλογενετική ανάλυση, οι κλώνοι του γονιδίου του 16S ριβοσωμικού RNA ταξινομήθηκαν στις ακόλουθες φυλογενετικές ομάδες: Acidobacteria, Actinobacteria, Planctomycetes, Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Deltaproteobacteria, Nitrospirae, Chloroflexi, Veruccomicrobia, Bacteroidetes και ΟΡ11 (υποψήφια ταξινομική ομάδα). Επιπρόσθετα, το ποσοστό των βακτηριακών αλληλουχιών που δεν ταξινομήθηκε σε καμία γνωστή φυλογενετική ομάδα, ήταν ιδιαίτερα υψηλό και για τις πέντε βακτηριακές βιοκοινωνίες. Οι υψηλές τιμές βιοιποικιλότητας και το μεγάλο ποσοστό των ‘άγνωστων’ αλληλουχιών του γονιδίου 16S ριβοσωμικού RNA αποτελούν σαφή ένδειξη μικροπεριβαλλόντων ιδιαίτερης σημασίας (‘hot spot’), καθιστώντας αναγκαία την περαιτέρω διερεύνηση τους.

Φυσική περιγραφή

71 σ.. : εικ. (μερικές έγχρ.), πίν. ; 30 εκ.

Γλώσσα

Ελληνικά

Θέμα

16S RNA genes

Biodiversity

Deep-sea sediments

Βαθιά θαλάσσια ιζήματα

Βιοποικιλότητα

Γονίδια του 16S ριβοσωμικού RNA

Ημερομηνία έκδοσης