E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - SCENERY: a web-based application for network reconstruction, visualization and statistical analysis of single-cell cata

Αρχική SCENERY: a web-based application for network reconstruction, visualization and statistical analysis of single-cell cata

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000403638

Τίτλος

SCENERY: a web-based application for network reconstruction, visualization and statistical analysis of single-cell cata

Άλλος τίτλος

SCENERY : μια διαδικτυοκεντρική εφαρμογή για την ανασυγκρότηση δικτύων, οπτικοποίηση και στατιστική ανάλυση μονοκυτταρικών δεδομένων

Συγγραφέας

Αθηναίου, Γιώργος Ι.

Σύμβουλος διατριβής

Τσαμαρδινός, Ιωάννης

Μέλος κριτικής επιτροπής

Τόλλης, Ιωάννης
Χριστοφίδης, Βασίλειος

Περίληψη

Οι τεχνικές κυτταρομετρίας επιτρέπουν την ποσοτικοποίηση των μορφολογικών χαρακτηριστικών και της αφθονίας πρωτεΐνων σε επίπεδο ενός κυττάρου. Τα δεδομένα που συλλέγονται με αυτές τις τεχνικές μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την αντιμετώπιση του συναρπαστικού μεν αλλά και απαιτητικού προβλήματος της ανασυγκρότησης του δικτύου των αλληλεπιδράσεων των πρωτεινών που σχηματίζει μονοπάτια σηματοδότησης και διέπει βιολογικούς μηχανισμούς του κυττάρου. Η ανακατασκευή δικτύων είναι ένα καθιερωμένο και καλά μελετημένο πρόβλημα σε τομείς όπως αυτούς της μηχανικής μάθησης και της εξόρυξης δεδομένων, με αρκετούς αλγορίθμους να είναι ήδη διαθέσιμοι. Επιπλέον, η τυπική στατιστική ανάλυση των δεδομένων αυτών χρησιμοποιείται ευρέως, κυρίως για την μοντελοποίηση της σχέσης μεταξύ των πρωτεϊνών και τη σύγκριση διαφορετικών πληθυσμών κυττάρων. Σε αυτή την εργασία, παρουσιάζουμε το SCENERY, την πρώτη ελεύθερα διαθέσιμη διαδικτυοκεντρική εφαρμογή, που επιτρέπει στους επιστήμονες να εφαρμόσουν γρήγορα και εύκολα μεθόδους, τελευταίας τεχνολογίας, για την ανασυγκρότηση δίκτυων, σε συνδιασμό με λειτουργίες προ-επεξεργασίας και στατιστικής ανάλυσης δεδομένων κυτταρομετρίας, μέσα από προηγμένες λειτουργίες απεικόνισης των δεδομένων και των αποτελεσμάτων. Το SCENERY διέπεται από μια εύκολη στη χρήση, σταδιακά διαβαθμισμένη διεπαφή χρήστη σε συνδιασμό με μια ανοικτή, αρθρωτά σχεδιασμένη αρχιτεκτονική για ευκολία της επέκτασής του. Οι λειτουργίες της εφαρμογής παρουσιάζονται και πιστοποιούνται σε δεδομένα από ένα δημόσια διαθέσιμο πείραμα στον τομέα της ανοσολογίας.

Φυσική περιγραφή

[vi] 47 σ. : πίν., σχήμ. εικ. (μερ. έγχρ.) ; 30 εκ.

Γλώσσα

Αγγλικά

Θέμα

Cytometry

Data analysis

Signal pathways

Ανάλυση δεδομένων

Κυτταρομετρία

Μονοπάτια σηματοδότησης

Ημερομηνία έκδοσης